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衰老PCR 阵列-大鼠
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衰老PCR 阵列-大鼠

货号:WC-MRNA0003-R

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商品描述

货号:WC-MRNA0003-R



产品介绍:

       WCGENE®PCRArrayPlate操作简单。只需要将cDNA与qPCRmix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Aging PCR Array plate

种    属:

Rat

货    号:

WC-MRNA0003-R

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Rat

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Akt1

Angel2

Anxa3

Anxa5

Apoe

Arid1a

Arl6ip6

Bub1b

C1qa

C1qb

C1qc

C1s

B

C3

C3ar1

C4a

C4b

C5ar1

Calb1

Casp1

Ccr1

Cd14

Cd163

Cdkn1c

Cfh

C

Cfhr1

Clu

Col1a1

Ctsd

Ctss

Ctsz

Cx3cl1

Cxcl16

Elavl1

Elp3

Eml1

Ep300

D

Fbxl16

Fcer1g

Fcgbp

Fcgr1a

Fcgr2a

Fcgr2b

Foxo1

Gfap

Hsf1

Hspb1

Jakmip3

Lmna

E

Lmnb1

Lmnb2

Lsm5

Ltf

Lyzl1

Mbp

Mrpl43

Ndufb11

Panx1

Pdcd6

Phf3

Polrmt

F

Pot1

Rap1a

Rnf144b

S100a8

S100a9

Scn2b

Sirt3

Sirt6

Smad2

Snap23

Terf1

Terf2

G

Tfam

Tfb1m

Tfb2m

Tinf2

Tlr2

Tlr4

Tmem135

Tmem33

Tollip

Tpp1

Txnip

Vps13c

H

Vwa5a

Wrn

Zbtb10

Zfp9

Zfr

Zmpste24

Actb

Gapdh

Hprt1

Ubb

NTC

NTC



基因分类(Rat)

相关基因

基因组不稳定性

Bub1b , Mrpl43 , Polrmt , Tfam , Tfb1m , Tfb2m , Zmpste24

端粒磨损

Pot1 , Rap1a , Terf1 , Terf2 , Tinf2 , Tpp1 .

线粒体功能障碍

Mrpl43 , Ndufb11 , Polrmt , Sirt3 , Sirt6 , Tfam , Tfb1m , Tfb2m .

蛋白质停滞

Arl6ip6 , Bub1b , Foxo1 , Hsf1, Jakmip3 , Rnf144b , Txnip , Vps13c

核纤层疾病

Lmna , Lmnb1 , Lmnb2 , Zmpste24 .

神经变性与突触传递

Calb1 , Gfap , Mbp , Scn2b , Snap23

表观遗传改变

Arid1a , Sirt3 , Sirt6

DNA结合

Arid1a , Ep300, Fbxl16 , Zbtb10 , Zfp9 , Zfr

RNA结合

Elavl1 , Lsm5 , Zfr

炎症反应

Angel2 , Anxa3 , Anxa5 , C1qa , C1qb , C1qc , C1s , C3 , C3ar1 , C4a , C4b , C5ar1 , Ccr1 , Cd14 , Cd163 , Cfh , Cfhr1 , Cx3cl1 , Cxcl16 , Fcer1g , Fcgbp , Fcgr1a , Fcgr2a , Fcgr2b , Gfap , Ltf , Lyzl1 , Mbp , Panx1 , S100a8 , S100a9 , Tlr2 , Tlr4 , Tmem135 , Tmem33 , Tollip

凋亡

Casp1 , Clu , Ep300 , Pdcd6 , Tollip .

细胞衰老

Cdkn1c,Vwa5a

细胞周期

Bub1b , Cdkn1c

细胞骨架调节因子

Col1a1 , Eml1

氧化应激

Ep300

转录调控

Arid1a , Ep300 , Foxo1 , Hsf1 , Phf3 , Smad2 

 


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.