产品介绍：

      动脉粥样硬化PCR阵列包括涉及凝血和循环过程的基因以及涉及细胞粘附，脂质转运和代谢的基因，还包括了涉及应激反应，细胞生长和增殖以及细胞凋亡的基因。

      动脉粥样硬化是一种慢性炎症性疾病，其特征在于动脉血管壁内存在的富含脂质的斑块使动脉变窄。它代表了大多数心血管疾病（CVD）及其并发症的根本原因，包括冠状动脉疾病，心肌梗塞和中风等疾病。低密度脂蛋白（LDL）胆固醇水平升高是动脉粥样硬化发生的主要危险因素。LDL可以积聚在血管壁内并通过氧化进行修饰。氧化LDL（oxLDL）导致内皮功能障碍，导致粘附分子的表达和内皮下空间中单核细胞的募集。单核细胞增殖，分化为巨噬细胞并吸收脂蛋白，形成胆固醇充盈的“泡沫细胞”。随着时间的推移，泡沫细胞死亡，留下结晶胆固醇和细胞碎片的“坏死核心”。平滑肌细胞增殖并迁移到该区域，在病变部位铺设保护帽。介导oxLDL识别和内化的凝集素样氧化低密度脂蛋白受体-1（LOX-1）参与了动脉粥样硬化发病机制中所有这些关键事件。

     WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀，然后加入每个孔里，上机检测，即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高，灵敏性强，操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程，可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

产品内容

品    名：	Atherosclerosis PCR Array plate
种    属：	Rat
货    号：	WC-MRNA0015-R
规    格：	96孔板
品    牌：	Wcgene® biotech
产    品：	96孔引物预置板，封板膜，说明书
储    存：	-20℃
有效期：	六个月
生产日期：	见外包装
使用限制：	本产品仅供科研使用，不应用于诊断、预防和治疗疾病。

基因列表

Rat

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Abca1

Bcl2a1

Cd44

Egr1

Fn1

Il2

Kdr

Nfkb1

Ppara

Selp

Thbs4

Vegfa

B

Abcc1

Bcl2l1

Cdh5

Eln

Hbegf

Il3

Klf2

Nos3

Ppard

Selplg

Timp1

Vwf

C

Ace

Bid

Cflar

Eng

Icam1

Il4

Lama1

Npy

Pparg

Serpinb2

Timp2

Mmp3

D

Apoa1

Birc3

Col3a1

Fabp3

Ifng

Il5

Ldlr

Nr1h3

Ptgs1

Serpine1

Timp3

Plin2

E

Apob

Ccl2

Csf1

Fas

Il1a

Itga2

Lif

Pdgfa

Ptgs2

Sod1

Tlr4

Sell

F

Apoe

Ccl5

Csf2

Fga

Il1b

Itga5

Lpl

Pdgfb

Rxra

Spp1

Tnc

Tgfb2

G

Bax

Ccr1

Ctgf

Fgb

Il1r1

Itgax

Lypla1

Pdgfrb

Sele

Tgfb1

Tnf

Vcam1

H

Bcl2

Ccr2

Cxcl1

Fgf2

Il1r2

Itgb2

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC

基因分类（Rat）		相关基因
应激反应	炎症反应	Ccl2,Ccl5,Ccr1,Ccr2,Cxcl1,Ifng,Il1a,Il1b,Il2,Itgb2,Pparg,Selp,Spp1,Tgfb1,Tnf
	对害虫、病原体或寄生虫的反应	Fn1,Il2,Il4,Nos3,Spp1.
	其他应激反应基因	Apoe,Bax,Bcl2l1,Sod1
细胞凋亡	抗凋亡	Bcl2,Bcl2l1,Birc3,Spp1,Vegfa
	诱导细胞凋亡	Apoe,Bax,Fas.
	其他凋亡基因	Bcl2a1,Bid,Cflar,Ifng,Nfkb1,Sod1.
血液凝固和循环	血液凝固	Apoe,Npy,Ptgs1,Serpinb2,Serpine1,Vwf
细胞粘附分子	细胞间的粘附	Cdh5,Icam1,Vcam1
	细胞外基质（ECM）粘附	Ccn2,Itga2,Itga5,Itgax,Itgb2,Spp1.
	其他细胞粘附分子	Cd44,Eng ,Fn1,Lama1,Sele,Sell ,Selp,Selplg,Thbs4
细胞外基质（ECM）分子	细胞外基质（ECM）蛋白酶抑制剂	Serpinb2,Serpine1
	细胞外基质（ECM）蛋白酶	Ace,Mmp3.
	细胞外基质（ECM）结构成分	Col3a1,Eln,Lama1
	其他细胞外基质（ECM）分子	Apoa1,Apoe,Ccl2,Ccl5,Ccn2,Cdh5,Csf1,Csf2,Cxcl1,Eng,Fga,Fgb,Fgf2 ,Fn1,Hbegf,Ifng, Il1a,Il1b,Il1r1,Il1r2,Il2,Il3,Il4,Il5,Itga2,Itga5,Itgb2,Kdr,Ldlr,Lif,Lpl,Npy,Pdgfa,Pdgfb,Pdgfrb,Ptgs1, Sele,Selp,Selplg ,Spp1,Tgfb1,Tgfb2,Thbs4,Tnc,Vcam1,Vegfa,Vwf
脂质转运与代谢	胆固醇代谢	Abca1,Apoa1,Apoe,Il4,Ldlr
	脂肪酸代谢	Apob,Lypla1,Ppara,Ptgs1
	脂质转运	Abca1,Apoa1,Apob,Apoe,Fabp3,Ldlr,Lpl,Plin2.
	脂蛋白代谢	Abca1,Apoa1,Apoe,Ldlr,Lpl
	类固醇代谢	Nr1h3,Ppara,Ppard,Pparg,Rxra
细胞生长与增殖	生长因子和受体	Ccn2,Csf1,Csf2,Cxcl1,Fgf2,Hbegf,Il1a,Il1b,Il2,Il3,Il4,Il5,Kdr,Lif,Pdgfa,Pdgfb,Pdgfrb,Spp1, Tgfb1,Tgfb2,Vegfa.
	细胞周期的调节	Fgf2,Il1a,Il1b,Pdgfa,Pdgfb,Tgfb1,Tgfb2,Vegfa.
	其他细胞生长与增殖 基因	Eln,Eng,Fn1,Ifng,Itga5,Ppard
转录调控	核受体	Nr1h3,Ppara,Ppard,Pparg,Rxra
	其他转录调控因子	Ccl5,Egr1,Ifng,Klf2,Nfkb1

动脉粥样硬化通路图

图片来源于：https://www.kegg.jp/kegg-bin/show_pathway?map05417

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号，来实现对起始模板进行定量及定性的分析，本实验采取荧光染料法，在 PCR 反应体系中，加入荧光染料，荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后，发射荧光信号，而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号，从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列，它以96孔板或者384孔为载体，将目的基因引物固定在孔里，可同时定量、定性检测多个基因，具有高灵敏性和高特异性，是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因，只需要将cDNA与qPCR MIX混匀，然后加入每个孔里，即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高，灵敏性强，操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程，可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

流程图

操作步骤

1. 将样品提取RNA，并逆转成cDNA，样品要求如下（建议范围）：

RNA：	无明显降解，A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA：	严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围：	ACTB或GAPDH的CT值：细胞15左右；组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心，2000r离心20 秒，离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl，将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板，加完后用透明封板膜封板，2000r离心20 秒，上机检测。

表a. cDNA和mix混合液配方表

组成成分	96孔 （搭配96孔板,每孔9 μl）
Wcgene® mRNA qPCR mix （2×）	510 μl
cDNA sample	100 μl
无RNA酶ddH2O	290 μl
ROX Reference Dye（50×）	20 μl
总体积	920 μl

4. 反应体系设置10μl，程序设置如表b所示

表b. PCR反应条件（WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例）

循环		温度	时间
预变性	1	95℃	30 sec
变性	40	95℃	5 sec
退火延伸	40	60℃	30 sec
熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出，数据分析

芯片与适用的Real Time PCR仪（本品仅适用于订单所写机器型号）

Plate format	Instrument provider	qPCR instrument model
A (96 well)	Roche Applied Science	LC480
	Bio-rad	CFX96
B (96 well)	Applied Biosystems	7500， 7900HT， ViiA 7
C (96 well)	Applied Biosystems	7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System

参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.