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基底细胞癌 PCR阵列-人
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基底细胞癌 PCR阵列-人

货号:wc-mRNA0260-H

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商品描述

货号:wc-mRNA0260-H


产品介绍:

皮肤癌是高加索人中最常见的癌症,基底细胞癌(BCC)占所有皮肤癌的90%。尽管存在罕见的家族性综合征基底细胞痣综合征(BCNS或Gorlin综合征),但绝大多数BCC病例是散发性的,易患BCC。此外,有强有力的流行病学和遗传学证据表明,紫外线照射是最重要的危险因素。基底细胞癌的发展与声波刺猬信号的组成性激活有关。BCC中SMOH,PTCH1和SHH的突变导致靶基因的连续激活。在细胞水平上,声波刺猬信号促进细胞增殖。在散发性BCC中也发现TP53突变的频率很高(>50%)。

  WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Basal cell carcinoma PCR Array

种    属:

HUMAN

货    号:

wc-mRNA0260-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

HUMAN

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

ASIP

EDN1

IL6

MUC1

S100A6

TP63

ASIP

EDN1

IL6

MUC1

S100A6

TP63

B

BMP2

EGFR

ING1

MYCN

SMO

TYMP

BMP2

EGFR

ING1

MYCN

SMO

TYMP

C

BMP4

ERCC2

ITGAV

NDUFA1

SOX9

TYR

BMP4

ERCC2

ITGAV

NDUFA1

SOX9

TYR

D

CCL5

FOXP3

KRT15

PLAGL1

STAT3

VEGFA

CCL5

FOXP3

KRT15

PLAGL1

STAT3

VEGFA

E

CDKN2A

GLI1

LGR5

PRKCA

TGFB1

WNT1

CDKN2A

GLI1

LGR5

PRKCA

TGFB1

WNT1

F

CFLAR

GLI2

MC1R

PTCH1

TGFBR2

XPA

CFLAR

GLI2

MC1R

PTCH1

TGFBR2

XPA

G

CXCL12

GREM1

MCL1

PTGS2

TNF

ACTB

CXCL12

GREM1

MCL1

PTGS2

TNF

ACTB

H

CXCL8

IGF1R

MSH3

RUNX3

TP53

GAPDH

CXCL8

IGF1R

MSH3

RUNX3

TP53

GAPDH


基底细胞癌通路图:


图片来源于:https://www.kegg.jp/kegg-bin/show_pathway?map05217


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.