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肿瘤药物靶点PCR 阵列-大鼠
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肿瘤药物靶点PCR 阵列-大鼠

货号:WC-MRNA0018-R

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商品描述

货号:WC-MRNA0018-R


产品介绍:

癌症是一种异质性疾病,具有多种生存机制,这些机制是由改变基因表达的累积突变引起的。癌症研究不断发现新的失调的致癌作用相关基因,阐明癌症进展或治疗逃避的新机制,并可能为药物开发开辟新途径。对这些基因表达的进一步研究可以确定它们如何以及何时失调,并可能发现癌症生长和进展背后的潜在机制。该阵列包括在致癌过程中失调的基因,包括那些涉及关键细胞生长途径(例如凋亡,DNA损伤修复,表观遗传学,生长因子和其他信号传导途径)的基因。

WCGENE®PCRArrayPlate操作简单。只需要将cDNA与qPCRmix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Cancer Drug Targets PCR Array plate

种    属:

Rat

货    号:

WC-MRNA0018-R

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Rat

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Abcc1

Bcl2

Cdk6

Egfr

Flt4

Hdac6

Igf1

Mdm4

Pdgfra

Plk2

Rhoa

Vegfb

B

Akt1

Bcl6

Cdk7

Erbb2

Grb2

Hdac7

Igf1r

Mtor

Pdgfrb

Plk3

Rhob

Vegfc

C

Akt2

Birc5

Cdk8

Erbb3

Gstp1

Hdac8

Igf2

Nfkb1

Pgr

Plk4

Tert

Mdm2

D

Akt3

Cdc25a

Cdk9

Erbb4

Hdac1

Hif1a

Irf5

Nfkb2

Pik3c2a

Prkca

Tnks

Parp2

E

Atf2

Cdk1

Ctsb

Esr1

Hdac11

Hras

Kdr

Nras

Pik3c3

Prkcb

Top2a

Plk1

F

Aurka

Cdk2

Ctsd

Esr2

Hdac2

Hsp90aa1

Kit

Ntn3

Pik3ca

Prkcd

Tp53

Ptgs2

G

Aurkb

Cdk4

Ctsl1

Figf

Hdac3

Hsp90ab1

Kras

Parp1

Pik3cb

Prkce

Txn1

Txnrd1

H

Aurkc

Cdk5

Ctss

Flt1

Hdac4

Hsp90b1

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Rat)

相关基因

细胞凋亡

Bcl2,Birc5.

PI3激酶和磷酸酶

Mtor,Pik3c2a,Pik3c3 ,Pik3ca 

生长因子和受体

Egfr,Erbb2 ,Erbb3,Erbb4,Flt1,Flt4 ,Igf1,Igf1r,Igf2,Kdr ,Kit ,Pdgfra,Pdgfrb,Vegfb,Vegfc,Vegfd

药物代谢

Abcc1,Gstp1,Ptgs2,Txn1,Txnrd1.

G蛋白信号

Rhoa,Rhob.

激素受体

Esr1 ,Esr2 ,Pgr

热休克蛋白

Hsp90aa1,Hsp90b1

受体酪氨酸激酶信号

Akt1,Akt2,Grb2.

组织蛋白酶类

Ctsb,Ctsd,Ctsl,Ctss

细胞周期

Cdc25a,Cdk1,Cdk2,Cdk4,Cdk5,Cdk7,Cdk8,Cdk9,Mdm2,Mdm4,Tert

拓扑异构酶,II型

Top2a

转录因子

Atf2 ,Hif1a,Irf5,Nfkb1,Tp53

蛋白激酶类

Aurka,Aurkb,Aurkc,Plk1,Plk2,Plk3,Plk4,Prkca,Prkcb,Prkcd,Prkce

RAS信号

Hras,Kras,Nras.

组蛋白去乙酰化酶

Hdac1,Hdac11,Hdac2,Hdac3,Hdac4,Hdac6,Hdac7,Hdac8

聚ADP核糖聚合酶

Parp1 ,Parp2,Tnks .

结构蛋白质类

Ntn3.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.