货号:WC-MRNA0021-M
产品介绍:
除了上皮细胞和基质细胞外,肿瘤微环境还包含几种细胞类型的先天性和适应性免疫系统,包括B淋巴细胞和T淋巴细胞、树突状细胞和巨噬细胞。针对通过MHC I类分子呈现的肿瘤相关抗原,或Toll样受体识别的异常分子模式,免疫系统使用各种效应酶和促凋亡信号(包括TRAIL和FAS配体)的参与来消除靶细胞。如果正常的体内平衡不能很快得到解决,就会出现慢性炎症状态,包括局部活性氧和氮水平升高,从而促进基因组不稳定。免疫细胞产生多种细胞因子来协调炎症反应,炎症反应由正反馈回路推动,正反馈回路通常涉及肿瘤细胞中的STAT和NFkB信号通路。由此产生的抗凋亡和免疫抑制因子的上调使转化细胞能够在免疫系统的抑制下增殖。在癌症进展过程中,可以利用协调正常免疫反应的趋化因子、细胞因子和生长因子,创造一种免疫抑制状态,促进侵袭和转移。
WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Cancer Inflammation & Immunity Crosstalk PCR Array plate
种 属:
Mouse
货 号:
WC-MRNA0021-M
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
Mouse
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
Ackr3
Ccl4
Ccr9
Cxcl1
Cxcr2
Gbp2b
Igf1
Il1a
Il6
Nos2
Tgfb1
Trp53
B
Aicda
Ccl5
Cd163
Cxcl10
Cxcr3
Gzma
Il10
Il1b
Irf1
Pdcd1
Tlr2
Vegfa
C
Bcl2
Ccr1
Cd206
Cxcl11
Cxcr4
Gzmb
Il12a
Il1r1
Kitl
Il1r2
Tlr3
Il17b
D
Bcl2l1
Ccr10
Cd274
Cxcl12
Cxcr5
H2-D1
Il12b
Il2
Mif
Ptgs2
Tlr4
Il5
E
Ccl2
Ccr2
Csf1
Cxcl2
Egf
H2-K1
Il13
Il22
Mmp
Socs3
Tlr7
Nfkb1
F
Ccl20
Ccr4
Csf2
Cxcl5
Egfr
Hif1a
Il15
Il23a
Myc
Spp1
Tlr9
Stat3
G
Ccl22
Ccr5
Csf3
Cxcl9
Fasl
Ido1
Il17a
Il4
Myd88
Stat1
Tnf
Tnfsf10
H
Ccl28
Ccr7
Ctla4
Cxcr1
Foxp3
Ifng
Actb
Gapdh
Hprt1
B2m
NTC
NTC
基因分类(Mouse)
相关基因
免疫和炎症反应
免疫刺激因子Ifng,Il12a,Il12b,Il15,Il2,Tnf.免疫抑制因子Cd274 ,Csf2,Ctla4,Cxcl12,Cxcl5 ,Ido1,Il10,Il13,Il4,Il5,Mif,Nos2,Pdcd1,Ptgs2,Tgfb1,Vegfa促炎基因Ccl2 ,Ccl20 ,Ifng,Il12a,Il12b,Il17a,Il1a,Il1b,Il2,Il22,Il23a,Il6,Ptgs2,Tlr4,Tnf,Vegfa.抗炎基因Il10,Il13,Il4,Tgfb1.
炎症和免疫的酶调节剂
Aicda,Gzma,Gzmb,Ido1,Nos2,Ptgs2
抗原呈递
H2-D1,H2-K1
趋化因子
Ccl2 ,Ccl20 ,Ccl22,Ccl28,Ccl4,Ccl5,Cxcl1,Cxcl10 ,Cxcl11,Cxcl12,Cxcl2 ,Cxcl5,Cxcl9
趋化因子受体
Ackr3,Ccr1,Ccr10,Ccr2,Ccr4,Ccr5,Ccr7,Ccr9,Cxcr1,Cxcr2,Cxcr3,Cxcr4,Cxcr5,Il1r1
白细胞间介素
Il10,Il12a,Il12b,Il13,Il15,Il17a,Il1a,Il1b,Il2,Il22,Il23a,Il4,Il5,Il6
其他细胞因子
Kitl ,Mif,Spp1,Tnf,Tnfsf10
生长因子和受体
Csf1 ,Csf2,Csf3,Egf,Egfr,Igf1,Tgfb1,Vegfa
干扰素信号
Gbp2b,Ifng,Il6,Irf1
干扰素反应基因
Ccl2,Ccl5,Cxcl10,Cxcl9,Gbp2b,Irf1,Myd88,Stat1,Tlr3,Tnfsf10
NFκB靶点
Bcl2l1,Ccl2 ,Ccl5,Csf1,Csf2 ,Csf3,Ifng,Tnf
STAT 靶点
Ccl2,Ccl4 ,Ccl5 ,Csf1 ,Csf2 ,Csf3,Cxcl10,Cxcl11,Cxcl12,Cxcl9,Il10,Il17a,Il1b,Il23a,Il6,Myc
Toll样受体信号
Myd88,Tlr2,Tlr3,Tlr4,Tlr7,Tlr9
转录因子
Foxp3,Hif1a,Irf1,Myc,Nfkb1,Stat1,Stat3,Trp53
细胞凋亡
促凋亡Fasl,Tnf,Tnfsf10 ,Trp53抗凋亡Bcl2,Bcl2l1,Myc,Stat3
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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