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癌症通路发现PCR 阵列-小鼠
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癌症通路发现PCR 阵列-小鼠

货号:WC-MRNA0020-M

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商品描述

货号:WC-MRNA0020-M


产品介绍:

最近的研究表明,随着肿瘤的生长,代谢也会发生变化,部分原因是基因表达的改变。血管生成是另一种常见的受影响途径,当受到肿瘤细胞缺氧信号刺激时,通过血管化和氧合进一步促进肿瘤生长。上皮-间充质转换(EMT)允许肿瘤侵入周围组织并转移。许多基因介导和控制着这些途径中的每一个,而这些基因表达的变化可以解除对其途径的调控。因此,在任何给定的癌症或肿瘤中,受影响基因的组合可能是独特的。了解特定癌症背后的分子机制,研究诊断和预后生物标志物,不仅需要单独分析其中一种途径,还需要分析所有途径。该阵列包括这9种重要癌症相关途径的靶基因,

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

 

产品内容

品    名:

Cancer PathwayFinder PCR Array plate

种    属:

Mouse

货    号:

WC-MRNA0020-M

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Mouse

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Acly

Atrx

Casp9

Cox5a

Ercc3

Flt3

Igfbp5

Lpl

Pgf

Slc2a1

Tep1

Xiap

B

Acsl4

Aurka

Ccl2

Cpt2

Ercc4

Foxc2

Igfbp7

Map2k1

Pinx1

Snai1

Terf2ip

Xrcc4

C

Adm

Bcl2l11

Ccnd1

Ddb2

Ercc5

G6pdx

Ing1

Map2k3

Ppp1r15a

Snai2

Tinf2

Lig4

D

Angpt1

Birc3

Ccnd2

Dkc1

Ets2

Gadd45g

Kdr

Mcm2

Serpinb2

Snai3

Tnks

Pfkl

E

Angpt2

Bmi1

Ccnd3

Dsp

Fas

Gpd2

Krt14

Mki67

Serpinf1

Sox10

Tnks2

Skp2

F

Apaf1

Car9

Cdc20

E2f4

Fasl

Gsc

Ldha

Nol3

Sirt1

Stmn1

Uqcrfs1

Tek

G

Arnt

Casp2

Cdh2

Epo

Fgf2

Hmox1

Ldhb

Ocln

Sirt2

Tbx2

Vegfc

Wee1

H

Atp5a1

Casp7

Cflar

Ercc2

Flt1

Igfbp3

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分(Mouse)

相关基因

血管生成

Angpt1,Angpt2,Ccl2 ,Fgf2 ,Flt1 ,Kdr,Pgf,Serpinf1,Tek ,Vegfc.

细胞凋亡

Apaf1,Bcl2l11,Birc3 ,Casp2,Casp7,Casp9,Cflar,Fasl,Nol3,Xiap.

细胞周期

Aurka,Ccnd2,Ccnd3,Cdc20,E2f4,Mcm2,Mki67,Skp2,Stmn1,Wee1

细胞衰老

Bmi1,Ets2,Igfbp3,Igfbp5,Igfbp7,Ing1,Map2k1 ,Map2k3 ,Serpinb2 ,Sirt1,Tbx2.

DNA损伤与修复

Atrx,Ddb2,Ercc3 ,Ercc5,Gadd45g,Lig4,Ppp1r15a ,Xrcc4.

上皮-间充质转换

Cdh2 ,Dsp,Foxc2,Gsc,Krt14,Ocln,Snai1 ,Snai2,Snai3,Sox10.

低氧信号

Adm,Arnt,Car9,Epo,Hmox1,Ldha,Slc2a1

新陈代谢

Acly,Acsl4,Atp5a1,Cox5a,Cpt2,G6pdx,Gpd2,Lpl,Pfkl,Uqcrfs1.

端粒和端粒酶

Dkc1,Pinx1,Sirt2,Tep1,Terf2ip,Tinf2,Tnks ,Tnks2.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.