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心血管疾病PCR 阵列-人
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心血管疾病PCR 阵列-人

货号:WC-MRNA0024-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0024-H


产品介绍:

 心血管疾病是发达国家发病和死亡的最重要原因,其死亡人数是美国癌症的两倍。多种遗传和环境因素,以及它们之间的相互作用,增加了发展主要心血管疾病的风险,如冠状动脉疾病(CAD)、心肌梗死(MI)和充血性心力衰竭(CHF)等。这些疾病的潜在致病机制尚不清楚,但观察到的基因表达变化可能在心血管疾病的发展和进展中起核心作用。微阵列研究已经表征了患病和非患病患者的基因表达模式,从而确定了与心脏病过程相关的独特基因亚群。用该阵列描述的基因在细胞凋亡、心脏重塑、细胞周期、细胞生长、应激和免疫反应、转录调控和信号转导等分子过程中发挥作用。  

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Cardiovascular Disease PCR Array plate

种    属:

Human

货    号:

WC-MRNA0024-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

HUMAM

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

ACE

AEBP1

CCL18

COL3A1

DUSP6

HDAC4

MAOA

NDUFB5

NPR3

PTN

SLC12A1

UBB

B

ACTC1

AGTR1

CCL2

CREB5

ENAH

HDAC5

MAPK1

NEBL

NR3C1

RARRES1

SNCA

ZYX

C

ADRA1A

ANXA4

CCND1

CREM

EPOR

HDAC6

MAPK8

NFIA

NR3C2

RASSF1

SPOCK1

MYH6

D

ADRA1B

AR

CDKN1B

CRYAB

F2R

HDAC9

MMP13

NKX2-5

PDE3A

REN

STAT1

NPR2

E

ADRA1D

ATP2A2

COL11A1

CRYM

FN1

HMGCL

MSI2

NPPA

PDE3B

RTN4

TCF4

POSTN

F

ADRB1

ATP5A1

COL15A1

CTGF

FRZB

HMGCR

MT1X

NPPB

PDE5A

S100A1

THBS2

SFRP4

G

ADRB2

C6

COL1A1

DCN

G0S2

HMGN2

MYH10

NPR1

PDE7A

SERPINA3

TNNI3

TNNT2

H

ADRB3

CCL11

COL1A2

DMD

GJA1

KLHL3

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Human)

相关基因

细胞凋亡

CCL2,MAOA,NDUFB5,NPPA,NPPB,NPR1,PDE3A,SNCA,THBS2,UBB,ZYX.

心脏重塑

AEBP1,ANXA4,COL11A1,COL1A1,COL3A1,DCN,DMD,F2R,FN1,GJA1,MMP13,MT1X,REN,RTN4,SERPINA3,TNNI3,TNNT2

细胞周期

CCND1,CDKN1B,G0S2,RARRES1

细胞生长

ACE,CCN2,PTN,SFRP4,SPOCK1

肉瘤结构蛋白

ACTC1,CRYAB,CRYM,MYH10,MYH6,NEBL,POSTN

信号转导

ADRA1A,ADRA1B,ADRA1D,ADRB1,ADRB2,ADRB3,AGTR1,AR,DUSP6,EPOR,FRZB,HMGCL,HMGCR,MAPK1,MAPK8,NPR2,NPR3,NR3C1,NR3C2,PDE3B,PDE5A,PDE7A,RASSF1,SLC12A1.

压力和免疫反应

C6,CCL11 ,CCL18,CCL2,S100A1

转录调控

CREB5,CREM,ENAH,HMGN2,KLHL3,MSI2,NFIA,NKX2-5,STAT1,TCF4

转运因子

ATP2A2,ATP5F1A


心血管疾病通路图

图片来源于:https://www.wikipathways.org/index.php/Pathway:WP3668#nogo2 


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.