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细胞应激反应PCR 阵列-大鼠
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细胞应激反应PCR 阵列-大鼠

货号:WC-MRNA0030-R

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商品描述

货号:WC-MRNA0030-R





产品介绍:

     沃吉基因细胞应激反应PCR阵列包括编码抗氧化剂的基因和参与异生素的促氧化酶,分子伴侣和蛋白质代谢。代表性的热休克蛋白和细胞色素P450基因也包括在内。

       WCGENE®PCRArrayPlate操作简单。只需要将cDNA与qPCRmix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验,引物验证,文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Cellular Stress Responses PCR Array plate

种    属:

Rat

货    号:

WC-MRNA0030-R

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Rat

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Acadsb

Cct5

Cyp11a1

Cyp2c7

dkk-4

Dnajb4

Dnajc7

Gpx2

Hopx

Hspa9

PON2

Tcp1

B

Bag1

Cct7

Cyp17a1

Cyp2d4

Dnaja1

Dnajb5

Dnajc8

Gsr

HSP60

Hspb1 (Hsp27)

PON3

Xdh

C

Calr

Cct8

Cyp1a1

Cyp2e1

Dnaja2

Dnajb6

Dnajc9

Gsta1

Hspa12a

Hspb2

Ppid

Gpx1

D

Canx

Ces1d (Ces3)

Cyp1a2

Cyp2f4

Dnaja3

Dnajb9

Ephx2

Gstk1

Hspa1a

Hspb3

Serpinh1 (Hsp47)

Hmox2

E

Cat

Ces1e (Es22)

Cyp1b1

Cyp3a2

Dnaja4

Dnajc1

Fmo1

Gstm1 (Mgst1)

Hspa1l

Hspd1

Sod1

Hspa5 (Grp78)

F

Cct2

Clu

Cyp2c12

Cyp4b1

Dnajb1

Dnajc4

Fmo4

Gsto1

Hspa2

Hspe1

Sod2

PON1

G

Cct3

Cryaa

Cyp2c13

Cyp7a1

Dnajb11

Dnajc5

Fmo5

Hmox1

Hspa4 (Hsp70)

IDO

Sod3

St13

H

Cct4

Cryab

Cyp2c6v2

Cyp7b1

Dnajb12

Dnajc6

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Rat)

相关基因

抗氧化酶和促氧化酶

Acadsb,Cat,Gpx1,Gpx2,Sod1,Sod2,Sod3,Xdh(Srd5a2)。

分子伴侣

热休克蛋白

Cryaa,Cryab,Dnaja1,Dnaja2,Dnaja3,Dnaja4,Dnajb1,Dnajb11,Dnajb12,Dnajb4,Dnajb5,Dnajb6,Dnajb9,Dnajc1,Dnajc4,Dnajc5,Dnajc6,Dnajc7,Dnajc8,Dnajc9,Hmox1,Hmox2,Hspa12a,Hspa1a,Hspa1l,Hspa2,Hspa4,Hspa5,Hspa9,Hspb1,Hspb2,Hspb3,Hspd1,Hspe1,Serpinh1。

其他分子伴侣

BAG1,Calr,Canx,Cct2,Cct3,Cct4,Cct5,Cct7,Cct8,Clu,Hopx,Ppid,St13,Tcp1

外源代谢细胞色素

Cyp11a1,Cyp17a1,Cyp1a1,Cyp1a2,Cyp1b1,Cyp2c12,Cyp2c13,Cyp2c6v2,Cyp2c7,Cyp2d4,

Cyp2e1,Cyp2f4,Cyp3a2,Cyp4b1,Cyp7a1,Cyp7b1

其他外源代谢基因

Ces1d,Ephx2,Fmo1,Fmo4,Fmo5,Gsr,Gsta1,Gstk1,Gstm1,Gsto1


细胞应激反应通路图

 

图片来源于:https://www.wikipathways.org/index.php/Pathway:WP3395



检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.