货号:WC-MRNA0049-R
产品介绍:
沃吉基因表观遗传染色质修饰酶PCR阵列包括催化组蛋白乙酰化、甲基化、磷酸化和泛素化的酶,以及脱乙酰酶和脱甲基酶。该阵列还分析编码SET结构域蛋白质的基因,这些蛋白质都包含一个同源结构域,该结构域在某些家族成员中显示组蛋白甲基转移酶活性。在干细胞向终末分化细胞的发育过程中,许多基因的表达发生改变,以控制染色质的动态。这些基因在肿瘤细胞中的表达谱也与正常细胞不同,表明染色质修饰和重塑在肿瘤发生中的作用。
WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Epigenetic Chromatin Modification Enzymes PCR Array plate
种 属:
Rat
货 号:
WC-MRNA0049-R
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
Rat
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
Ash1l
Carm1
Edf1
Fbxo11
Hdac5
Kat2b
Kmt2e
Nek6
Prmt2
Rps6ka5
Smyd3
Usp16
B
Ash2l
Cdk2
Eed
Hat1
Hdac6
Kat5
Mbd2
Nsd1
Prmt5
Setd4
Supt7l
Usp22
C
Atf2
Ciita
Ehmt1
Hdac1
Hdac7
Kat6a
Med24
Pak1
Prmt6
Setd5
Suv39h1l1
Ncor1
D
Aurka
Crebbp
Ehmt2
Hdac10
Hdac8
Kat7
Men1
Phf5a
Prmt7
Setd6
Suv39h2
Prmt1
E
Aurkb
Cxxc1
Ep300
Hdac11
Hdac9
Kat8
Mta2
Phf6
Rbbp5
Setdb2
Suv420h1
Rnf40
F
Aurkc
Dnmt3a
Epc1
Hdac2
Ing3
Kdm1b
Ncoa3
Prdm2
Rnf2
Sirt1
Suv420h2
Smyd1
G
Baz1b
Dnmt3b
Esco1
Hdac3
Jmjd6
Kmt2a
Ncoa6
Prdm9
Rnf20
Sirt2
Ube2a
Ube2b
H
Brca2
Dot1l
Ezh2
Hdac4
Kat2a
Kmt2c
Actb
Gapdh
Hprt1
Ubb
NTC
NTC
基因分类(Rat)
相关基因
DNA甲基转移酶
Dnmt3a,Dnmt3b.
组蛋白乙酰转移酶
Atf2,Brca2,Ciita,Crebbp,Edf1,Ep300,Epc1,Hat1,Ing3,Kat2a,Kat5,Kat6a,Kat7,Kat8,Kmt2a,Med24,Ncoa3,Ncoa6,Supt7l
组蛋白甲基转移酶
Ash2l,Cxxc1,Dot1l,Edf1,Eed,Ehmt1,Ehmt2,Ezh2,Fbxo11,Kmt2a,Kmt2e,Kmt5c,Men1,Prdm2,Prdm9,
Prmt1,Prmt2,Prmt5,Prmt6,Prmt7,Rbbp5,Setdb2,Smyd1,Smyd3,Suv39h1l1,Suv39h2
SET结构域蛋白质(组蛋白甲基转移酶活性)
Ash1l,Kmt2e,Kmt5b,Nsd1,Setd4,Setd5,Setd6
组蛋白磷酸化
Aurka,Aurkb,Aurkc,Baz1b,Cdk2,Nek6,Pak1,Rps6ka5
组蛋白泛素化
Fbxo11,Rnf2,Rnf20,Rnf40,Ube2a,Ube2b,Usp16
DNA和组蛋白脱甲基酶
Jmjd6,Kdm1b,Mbd2.
组蛋白去乙酰化酶
Hdac1,Hdac10,Hdac11,Hdac2,Hdac3,Hdac4,Hdac5,Hdac6,Hdac7,Hdac8,Hdac9,Mbd2,Mta2,Ncor1,
Sirt1 ,Sirt2.
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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