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表观遗传染色质修饰酶PCR 阵列-大鼠
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表观遗传染色质修饰酶PCR 阵列-大鼠

货号:WC-MRNA0049-R

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商品描述

货号:WC-MRNA0049-R




产品介绍:

       沃吉基因表观遗传染色质修饰酶PCR阵列包括催化组蛋白乙酰化、甲基化、磷酸化和泛素化的酶,以及脱乙酰酶和脱甲基酶。该阵列还分析编码SET结构域蛋白质的基因,这些蛋白质都包含一个同源结构域,该结构域在某些家族成员中显示组蛋白甲基转移酶活性。在干细胞向终末分化细胞的发育过程中,许多基因的表达发生改变,以控制染色质的动态。这些基因在肿瘤细胞中的表达谱也与正常细胞不同,表明染色质修饰和重塑在肿瘤发生中的作用。

       WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Epigenetic Chromatin Modification Enzymes PCR Array plate

种    属:

Rat

货    号:

WC-MRNA0049-R

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Rat

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Ash1l

Carm1

Edf1

Fbxo11

Hdac5

Kat2b

Kmt2e

Nek6

Prmt2

Rps6ka5

Smyd3

Usp16

B

Ash2l

Cdk2

Eed

Hat1

Hdac6

Kat5

Mbd2

Nsd1

Prmt5

Setd4

Supt7l

Usp22

C

Atf2

Ciita

Ehmt1

Hdac1

Hdac7

Kat6a

Med24

Pak1

Prmt6

Setd5

Suv39h1l1

Ncor1

D

Aurka

Crebbp

Ehmt2

Hdac10

Hdac8

Kat7

Men1

Phf5a

Prmt7

Setd6

Suv39h2

Prmt1

E

Aurkb

Cxxc1

Ep300

Hdac11

Hdac9

Kat8

Mta2

Phf6

Rbbp5

Setdb2

Suv420h1

Rnf40

F

Aurkc

Dnmt3a

Epc1

Hdac2

Ing3

Kdm1b

Ncoa3

Prdm2

Rnf2

Sirt1

Suv420h2

Smyd1

G

Baz1b

Dnmt3b

Esco1

Hdac3

Jmjd6

Kmt2a

Ncoa6

Prdm9

Rnf20

Sirt2

Ube2a

Ube2b

H

Brca2

Dot1l

Ezh2

Hdac4

Kat2a

Kmt2c

Actb

Gapdh

Hprt1

Ubb

NTC

NTC



基因分类(Rat)

相关基因

DNA甲基转移酶

Dnmt3a,Dnmt3b.

组蛋白乙酰转移酶

Atf2,Brca2,Ciita,Crebbp,Edf1,Ep300,Epc1,Hat1,Ing3,Kat2a,Kat5,Kat6a,Kat7,Kat8,Kmt2a,Med24,Ncoa3,Ncoa6,Supt7l

组蛋白甲基转移酶

Ash2l,Cxxc1,Dot1l,Edf1,Eed,Ehmt1,Ehmt2,Ezh2,Fbxo11,Kmt2a,Kmt2e,Kmt5c,Men1,Prdm2,Prdm9,

Prmt1,Prmt2,Prmt5,Prmt6,Prmt7,Rbbp5,Setdb2,Smyd1,Smyd3,Suv39h1l1,Suv39h2

SET结构域蛋白质(组蛋白甲基转移酶活性)

Ash1l,Kmt2e,Kmt5b,Nsd1,Setd4,Setd5,Setd6

组蛋白磷酸化

Aurka,Aurkb,Aurkc,Baz1b,Cdk2,Nek6,Pak1,Rps6ka5

组蛋白泛素化

Fbxo11,Rnf2,Rnf20,Rnf40,Ube2a,Ube2b,Usp16

DNA和组蛋白脱甲基酶

Jmjd6,Kdm1b,Mbd2.

组蛋白去乙酰化酶

Hdac1,Hdac10,Hdac11,Hdac2,Hdac3,Hdac4,Hdac5,Hdac6,Hdac7,Hdac8,Hdac9,Mbd2,Mta2,Ncor1,

Sirt1 ,Sirt2.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.