产品介绍

表观染色质重塑因子PCR阵列这些基因参与识别染色质修饰和重塑染色质，以调节染色质可及性，从而调节基因表达。这些基因中的许多含有负责ATP水解依赖性染色质重组的色域。色域蛋白根据其额外的结构域和它们所招募的蛋白质来激活或抑制转录。染色体盒结构域蛋白识别甲基化组蛋白赖氨酸残基并介导转录抑制。溴代和植物同源结构域（PHD）分别结合乙酰化和甲基化组蛋白赖氨酸残基，似乎协同工作。该阵列上的其他基因，如生长抑制剂（ING）家族，与组蛋白乙酰转移酶和去乙酰化酶复合物活性相关并调节其活性，而其他基因则直接结合甲基化的CpG DNA。在干细胞向终末分化细胞的发育过程中，许多这些基因的表达发生改变，以控制染色质动力学。与正常细胞相比，这些基因在肿瘤细胞中也表现出不同的表达谱，提示染色质修饰和重塑在肿瘤发生中的作用。

 

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀，然后加入每个孔里，上机检测，即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高，灵敏性强，操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程，可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

产品内容

品    名：	Epigenetic Chromatin Remodeling Factors PCR Array plate
种    属：	Mouse
货    号：	WC-MRNA0052-M
规    格：	96孔板
品    牌：	Wcgene® biotech
产    品：	96孔引物预置板，封板膜，说明书
储    存：	-20℃
有效期：	六个月
生产日期：	见外包装
使用限制：	本产品仅供科研使用，不应用于诊断、预防和治疗疾病。

基因列表

Mouse

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Arid1a

Bptf

Brdt

Cbx3

Chd1

Chd9

Ing2

Mbd4

Pcgf2

Phf13

Ring1

Wdr11

B

Arid2

Brd1

Brpf1

Cbx4

Chd2

Ctbp1

Ing3

Mecp2

Pcgf3

Phf2

Rnf2

Zmynd8

C

Asxl1

Brd2

Brpf3

Cbx5

Chd3

Ctbp2

Ing4

Mta1

Pcgf5

PHF21A

Smarca2

Mbd3

D

Baz1a

Brd3

Brwd1

Cbx6

Chd4

Ctcf

Ing5

Mta2

Pcgf6

Phf21b

Smarca4

Pcgf1

E

Baz1b

Brd4

BRWD2

Cbx7

Chd5

Eed

Ino80

Nab2

Phc1

Phf3

Smarca5

Phf1

F

Baz2a

Brd7

Brwd3

Cbx8

Chd6

Ezh2

Mbd1

Nsd1

Phc2

Phf5a

Spen

Phf7

G

Baz2b

Brd8

Cbx1

Cdyl

Chd7

Hinfp

MBD2

PBRM1

PHC3

Phf6

Suz12

Trim27

H

Bmi1

BRD9

Cbx2

Cdyl2

Chd8

Ing1

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC

基因分类（Mouse）	相关基因
SWI/SNF复杂组件	Arid1a,Arid2,Ino80,Smarca2,Smarca4,Smarca5.
Polycomb组基因	Asxl1,Bmi1,Ctbp1,Ctbp2,Eed,Ezh2,Pcgf1,Pcgf2,Pcgf3,Pcgf5,Pcgf6,Phc1,Phc2,Ring1,Rnf2,Suz12,Trim27.
染色体/异染色质蛋白1（HP1）同源物(HP1) 同系物	Cbx1,Cbx2,Cbx3,Cbx4,Cbx5,Cbx6,Cbx7,Cbx8.
Bromodomain蛋白质	Baz1a,Baz1b,Baz2a,Baz2b,Bptf,Brd1,Brd2,Brd3,Brd4,Brd7,Brd8,Brdt,Brpf1,Brpf3,Brwd1,Brwd3,Wdr11,Zmynd8
色域/解旋酶/DNA结合域（CHD）蛋白	Cdyl,Cdyl2,Chd1,Chd2,Chd3,Chd4,Chd5,Chd6,Chd7,Chd8,Chd9.
核小体重塑和组蛋白脱乙酰基酶（NuRD）复杂组件	Chd3,Mbd3,Mta1,Mta2,Nab2,Spen.
植物同源域（PHD）蛋白	Nsd1,Phf1,Phf13,Phf2,Phf21b,Phf3,Phf5a,Phf6,Phf7
生长抑制剂（ING）家庭成员	Ing1,Ing2,Ing3,Ing4,Ing5,Ring1
甲基-CpG DNA结合结构域（MDB）蛋白	Hinfp,Mbd1,Mbd3,Mbd4,Mecp2.
CCCTC结合因子（锌指蛋白）	Ctcf.

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号，来实现对起始模板进行定量及定性的分析，本实验采取荧光染料法，在 PCR 反应体系中，加入荧光染料，荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后，发射荧光信号，而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号，从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列，它以96孔板或者384孔为载体，将目的基因引物固定在孔里，可同时定量、定性检测多个基因，具有高灵敏性和高特异性，是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因，只需要将cDNA与qPCR MIX混匀，然后加入每个孔里，即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高，灵敏性强，操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程，可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

流程图

操作步骤

1. 将样品提取RNA，并逆转成cDNA，样品要求如下（建议范围）：

RNA：	无明显降解，A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA：	严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围：	ACTB或GAPDH的CT值：细胞15左右；组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心，2000r离心20 秒，离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl，将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板，加完后用透明封板膜封板，2000r离心20 秒，上机检测。

表a. cDNA和mix混合液配方表

组成成分	96孔 （搭配96孔板,每孔9 μl）
Wcgene® mRNA qPCR mix （2×）	510 μl
cDNA sample	100 μl
无RNA酶ddH2O	290 μl
ROX Reference Dye（50×）	20 μl
总体积	920 μl

4. 反应体系设置10μl，程序设置如表b所示

表b. PCR反应条件（WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例）

循环		温度	时间
预变性	1	95℃	30 sec
变性	40	95℃	5 sec
退火延伸	40	60℃	30 sec
熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出，数据分析

芯片与适用的Real Time PCR仪（本品仅适用于订单所写机器型号）

Plate format	Instrument provider	qPCR instrument model
A (96 well)	Roche Applied Science	LC480
	Bio-rad	CFX96
B (96 well)	Applied Biosystems	7500， 7900HT， ViiA 7
C (96 well)	Applied Biosystems	7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System

参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.