产品介绍：

HOX基因编码一组含有同源结构域的转录因子，这些转录因子最初被描述为控制发育过程中的节段模式。最近，在干细胞和癌症研究方面的重要性再次被强调。尽管这些HOX基因已根据其在多细胞生物发育中的既定角色进行了分组，但它们在细胞系统中的真正功能仍有待于您的发现。使用实时PCR，您可以使用该阵列轻松可靠地分析HOX基因的集中表达。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀，然后加入每个孔里，上机检测，即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高，灵敏性强，操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程，可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

产品内容

品    名：	Homeobox (HOX) Genes PCR Array plate
种    属：	Rat
货    号：	WC-MRNA0069-R
规    格：	96孔板
品    牌：	Wcgene® biotech
产    品：	96孔引物预置板，封板膜，说明书
储    存：	-20℃
有效期：	六个月
生产日期：	见外包装
使用限制：	本产品仅供科研使用，不应用于诊断、预防和治疗疾病。

基因列表

Rat

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Alx1

Dlx3

Hoxa1

Hoxb4

Hoxc5

Lhx4

Meis3

Nkx3-1

PAX5

Pou1f1

Pou5f1

Vax1

B

Alx3

Dlx4

Hoxa11

Hoxb7

Hoxc6

Lhx5

Meox1

Nkx6-1

PAX6

Pou2f2

Prop1

Vax2

C

Alx4

Dlx5

Hoxa2

Hoxb9

Hoxd10

Lhx6

Meox2

Nkx6-2

Pdhx

Pou2f3

Prox1

Nkx2-2

D

Arx

Drgx

Hoxa5

Hoxc10

Hoxd4

Lhx8

Mixl1

Otp

Pdx1

Pou3f1

Shox2

PAX4

E

Barx1

Emx2

Hoxa9

HOXC11

Isl1

Lmx1a

Msx1

Otx1

Phox2a

Pou3f2

Six1

Pitx3

F

Cdx2

Hhex

Hoxb13

HOXC12

Isl2

Lmx1b

Msx2

Otx2

Pitx1

Pou3f3

Six3

Pou4f1

G

Dlx1

Hlx

Hoxb2

HOXC13

Lhx1

Meis1

Nkx2-1

Pax3

Pitx2

Pou3f4

Six4

Six6

H

Dlx2

Hopx

Hoxb3

Hoxc4

Lhx2

Meis2

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC

基因分类（Rat）	相关基因
解剖结构形态发生	Hoxc10,Pitx1,Pou5f1,Six4.
器官形态发生	Cdx2,Lhx1,Lhx4,Lhx8,Msx1,Nkx2-1,Pax3,Pdhx,Pdx1,Pitx2,Pitx3,Prox1,Six6.
身体形态形成	Hhex,Hoxa2,Hoxa5,Hoxc4,Hoxc5,Hoxd10,Lmx1b,Pitx2.
外胚层发育	Prox1,Vax2.
大脑发育	Alx1,Dlx2,Lhx2,Lhx5,Lhx6,Lhx8,Nkx2-1,Otx2,Pou1f1,Pou3f1,Pou3f2,Pou3f3,Pou3f4,Pou4f1,Six3
神经系统发育	Arx,Dlx5,Drgx,Hoxd10,Lhx1,Lhx2,Lhx4,Lhx5,Lhx6,Lhx8,Nkx2-1,Nkx2-2,Nkx6-1,Nkx6-2,Otp,Pax3,Phox2a,Pou1f1,Pou3f1,Pou3f2,Pou3f3,Pou3f4,Pou4f1,Prop1,Shox2.
骨骼发育	Alx4,Dlx3,Dlx5,Hoxa11,Hoxa2,Hoxa5,Hoxc5,Hoxd10,Msx1,Msx2,Pitx1,Shox2.
肌肉发育	Meox2,Six1.
心脏发育	Isl1,Shox2.
其他发育HOX基因	Alx3,Barx1,Dlx1,Dlx4,Emx2,Hoxa1,Hoxb13,Hoxb2,Hoxb3,Hoxb4,Hoxb7,Hoxb9,Hoxc6,Hoxd4,Isl2,Lmx1a,Meis1,Meis2,Meis3,Meox1,Nkx3-1,Otx1,Vax1.
细胞分化HOX基因	Arx,Drgx,Hhex,Hlx,Hopx,Lhx1,Lhx2,Lhx4,Lhx5,Lhx6,Lhx8,Lmx1b,Mixl1,Nkx2-2,Nkx6-1,Nkx6-2,Otp,Pou1f1 ,Pou2f2,Pou2f3, Pou3f1,Pou3f2,Pou3f3,Pou3f4,Pou4f1

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号，来实现对起始模板进行定量及定性的分析，本实验采取荧光染料法，在 PCR 反应体系中，加入荧光染料，荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后，发射荧光信号，而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号，从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列，它以96孔板或者384孔为载体，将目的基因引物固定在孔里，可同时定量、定性检测多个基因，具有高灵敏性和高特异性，是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因，只需要将cDNA与qPCR MIX混匀，然后加入每个孔里，即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高，灵敏性强，操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程，可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

流程图

操作步骤

1. 将样品提取RNA，并逆转成cDNA，样品要求如下（建议范围）：

RNA：	无明显降解，A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA：	严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围：	ACTB或GAPDH的CT值：细胞15左右；组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心，2000r离心20 秒，离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl，将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板，加完后用透明封板膜封板，2000r离心20 秒，上机检测。

表a. cDNA和mix混合液配方表

组成成分	96孔 （搭配96孔板,每孔9 μl）
Wcgene® mRNA qPCR mix （2×）	510 μl
cDNA sample	100 μl
无RNA酶ddH2O	290 μl
ROX Reference Dye（50×）	20 μl
总体积	920 μl

4. 反应体系设置10μl，程序设置如表b所示

表b. PCR反应条件（WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例）

循环		温度	时间
预变性	1	95℃	30 sec
变性	40	95℃	5 sec
退火延伸	40	60℃	30 sec
熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出，数据分析

芯片与适用的Real Time PCR仪（本品仅适用于订单所写机器型号）

Plate format	Instrument provider	qPCR instrument model
A (96 well)	Roche Applied Science	LC480
	Bio-rad	CFX96
B (96 well)	Applied Biosystems	7500， 7900HT， ViiA 7
C (96 well)	Applied Biosystems	7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System

参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.