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淋巴瘤PCR 阵列-小鼠
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淋巴瘤PCR 阵列-小鼠

货号:WC-MRNA0090-M

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商品描述

货号:WC-MRNA0090-M


产品介绍:

淋巴瘤是免疫系统中的一种淋巴细胞癌。成人淋巴瘤的主要临床和病理亚型包括滤泡性淋巴瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)。淋巴瘤影响负责细胞粘附、细胞周期、免疫和炎症反应的分子和生物途径,PI-3-激酶/AKT信号传导和T细胞分化。该阵列代表了这些途径中的许多基因以及源自相同途径的许多常见淋巴瘤治疗靶点。该阵列还包括在淋巴瘤样本的分子分析和高通量微阵列分析研究中常规检测到的失调基因,尤其是与淋巴瘤生存相关的基因。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Lymphoma PCR Array plate

种    属:

Mouse

货    号:

WC-MRNA0090-M

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Mouse

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Aff1

C1qa

Ccr1

Cd5

Cdkn2b

Fcer2a

Id4

Mcl1

Myod1

Ptprc

Timp1

Ttc9

B

Alk

C4a

Cd2

Cd79a

Cdkn2c

Fcgr1

Ifng

Mki67

Ncam1

Rassf1

Timp2

Vgll4

C

Asb13

Cadm1

Cd22

Cd80

Csf3

Fhit

Il2

Mlh1

Nfkb1

Rbp1

Timp3

Lrp1b

D

Atm

Ccnd1

Cd34

Cd8a

Cxcr4

Flt3l

Il6

Mme

Notch1

Slc19a1

Tlr5

Myc

E

Bcl2

Ccnd2

Cd3d

Cdh1

Dapk1

Gstp1

Itpkb

Ms4a1

Pag1

Src

Tnf

Ptk2

F

Bcl6

Ccnd2

Cd4

Cdh13

Dlc1

Hic1

Lmo2

Mtor

Parp1

Stat4

Tnfrsf1b

Tgfb1

G

Birc5

Ccnd3

Cd40

Cdh2

Dntt

Hrk

Lrmp

Mybl1

Pdlim7

Syk

Tnfsf13b

Trp53

H

Btk

Ccnd3

Cd40lg

Cdkn1c

F8

Hsp90aa1

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Mouse)

相关基因

差异甲基化启动子

Aff1,Atm,Cadm1,Ccnd1,Cdh1,Cdh13,Cdkn1c,Cdkn2b ,Cdkn2c,Dapk1,Dlc1,Fhit,Gstp1,Hic1,Hrk,Id4,Lrp1b,

Mlh1,Myod1,Rassf1,Rbp1,Slc19a1,Timp2,Timp3.

弥漫性大B细胞淋巴瘤生存率

Asb13,Bcl6,Itpkb,Lmo2,Lrmp,Mybl1,Pag1,Ptk2,Ttc9,Vgll4

滤泡性淋巴瘤生存率

C1qa,C4a,Ccr1,F8,Fcgr1,Flt3l,Stat4,Tlr5,Tnfrsf1b,Tnfsf13b

淋巴瘤治疗靶点

Bcl6,Birc5,Btk,Cd22,Cd40,Cd80,Cxcr4,Fcgr1,Hsp90aa1,Mcl1,Ms4a1,Mtor,Notch1,Parp1,Ptk2 ,Src,Syk,Tgfb1,

Tnfsf13b.

炎症反应

C1qa,C4a,Ccr1,Cd40,Cd40lg,Csf3,Cxcr4,F8,Il6,Nfkb1,Tgfb1,Tlr5,Tnf,Tnfrsf1b

免疫系统过程

Bcl6,C1qa,C4a,Cadm1,Cd2,Cd4,Cd40,Cd5,Cd79a,Cd80,Fcer2a,Ifng,Il2,Il6,Itpkb,Pdlim7,Ptprc,Syk,Tgfb1,Tnfsf13b.

T细胞分化

Bcl2,Cd3d,Cd4,Cd8a,Il2,Itpkb,Ptprc ,Syk,Tgfb1,Trp53

细胞粘附分子

Bcl2,Cadm1 ,Ccr1,Cd2,Cd22,Cd34,Cd4,Cd40lg,Cd8a,Cdh1,Cdh13,Dlc1,F8,Il2,Ncam1,Ptprc,Src,Syk,Tnf.

细胞周期

Atm,Bcl2,Birc5,Ccnd1,Cdkn1c,Cdkn2b ,Cdkn2c,Id4,Ifng,Mki67,Mlh1,Myc,Rassf1,Tgfb1,Trp53

AKT和PI3激酶信号传导

Alk,Bcl2,Btk,Ccnd1,Ccr1,Cd2,Cd4,Cd40,Cd40lg,Csf3,Cxcr4,Hsp90aa1,Il2,Il6,Mtor,Ptk2 ,Syk,Tgfb1,Timp2,Timp3,Tnfrsf1b,Tnfsf13b,Trp53

基因融合

Alk,Mme.

DNA损伤与修复

Dntt


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.