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MYC靶向PCR阵列-小鼠
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MYC靶向PCR阵列-小鼠

货号:wc-mRNA0099-M

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商品描述

货号:wc-mRNA0099-M



产品介绍:

MYC包含一个碱性螺旋-环-螺旋DNA结合结构域和一个亮氨酸拉链结构域,用于与其另一种碱性螺旋-链-螺旋转录因子MAX二聚。异源二聚体结合启动子中的增强子盒序列(E-box),并招募组蛋白乙酰转移酶,以主要上调哺乳动物基因组中多达15%的基因的表达。MYC信号主要负责促进细胞生长和增殖,其过度表达导致约20%的人类癌症的形成,每年导致约10万美国癌症死亡。因此,MYC功能的破坏最近被确定为抗癌药物开发的一个重要目标。分析MYC反应基因的表达可以帮助研究人员更好地了解其正常功能、在肿瘤发生中的作用以及抗MYC药物在分子水平上的作用机制。

该阵列中包含的大多数MYC靶点是通过正常或人工过度表达MYC的各种癌细胞系中的染色质免疫沉淀,通过对基因表达和MYC启动子结合位点的全基因组分析发现的。这些MYC靶点调节细胞凋亡等重要过程;细胞周期;细胞生长、增殖和分化;DNA修复;表观遗传学;新陈代谢蛋白质合成、降解和周转;RNA加工;以及信号转导。MYC、MAX和其他相关转录因子也在该阵列中显示。

WCGENE®PCRArrayPlate操作简单。只需要将cDNA与qPCRmix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

MYC Targets PCR Array plate

种    属:

MOUSE

货    号:

wc-mRNA0099-M

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

MOUSE

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Aimp2

Ccnd2

Csda

Eif4a1

Hk2

Max

Mycn

Nme1

Phb

Rpl13

Srm

Ube2c

B

Apex1

Cct5

Csde1

Eif4b

Hnrnpa1

Maz

Mycs

Nolc1

Pias2

Rpl19

Srsf1

Zfp36l1

C

Atf4

Cdc25a

Cstb

Eif4e

Hnrnpa2b1

Mgst1

Nap1l1

Npm1

Pold2

Rpl23

Tbp

Ndrg3

D

Bax

Cdk4

Ctsc

Eno1

Id3

Msh2

Nbn

Odc1

Ppat

Rpl27a

Tert

Pdk1

E

Bcat1

Cdkn1b

Ddx10

Exosc8

Ilk

Mthfd1

Ncl

Pa2g4

Ppp2r4

Rpl5

Top1

Pycr1

F

Cad

Cdkn2b

Ddx39b

Fasn

Itgb1

Myc

Ndrg1

Paics

Psmg1

Rps5

Tpi1

Snrpb

G

Cbx3

Chek1

Dkc1

Gclc

Lta4h

Mycbp

Ndrg2

Pcna

Pten

Shmt1

Trp53

Tyms

H

Ccnb1

Cks2

E2f1

Gnl3

Mat2a

Mycl1

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC



基因分类(Mouse)

相关基因

MYC&共转录因子

E2f1,Max,Maz,Mycl,Mycn,Pias2

因MYC上调

Aimp2,Apex1,Atf4,Bax,Bcat1,Cad,Cbx3,Ccnb1,Ccnd2,Cct5,Cdc25a,Cdk4,Chek1,Cks2,Cstb,Ctsc,Ddx10,Dkc1,E2f1,

Eif4a1,Eif4b,Eif4e,Eno1,Exosc8,Fasn,Gnl3,Hk2,Hnrnpa1,Hnrnpa2b1,Lta4h,Mat2a,Mgst1,Msh2,Mthfd1,Nap1l1,Nbn,Ncl,Nme1,Nolc1,Npm1,Odc1,Pa2g4,Paics,Pcna,Phb,Pold2,Ppat,Psmg1,Pten,Pycr1,Rpl13,Rpl19,Rpl23,Rpl27a,Rpl5,Rps5,Shmt1,Snrpb,Srm,Srsf1,Tert,Top1,Tpi1,Trp53,Tyms,Ube2c,Ybx3

因MYC下调

Cdkn1b,Cdkn2b,Csde1,Id3,Ilk,Itgb1,Myc,Ptpa,Zfp36l1

凋亡

Bax,Ccnb1,Gnl3,Npm1,Trp53

细胞周期

Ccnb1,Ccnd2,Cdc25a,Cdk4,Cdkn1b,Cdkn2b,Gnl3,Pa2g4,Pcna,Trp53

细胞生长与增殖

Cdkn1b,Cks2,Npm1,Pa2g4,Pcna,Phb

染色质修饰及相关蛋白

Cbx3,Nap1l1

DNA修复

Aimp2,Apex1,Chek1,Msh2,Nbn,Npm1,Pcna,Tert,Trp53

DNA复制

Pcna,Pold2,Top1

细胞外基质(ECM)&细胞粘附分子

Ilk,Itgb1

新陈代谢

Bcat1,Cad,Eno1,Fasn,Gclc,Hk2,Lta4h,Mat2a,Mgst1,Mthfd1,Nme1,Odc1,Paics,Pdk1,Ppat,Pycr1,Shmt1,Srm,Tpi1,Tyms

蛋白质合成、降解和周转

Cct5,Cstb,Ctsc,Eif4a1,Eif4b,Eif4e,Ncl,Npm1,Psmg1,Pycr1,Rpl13,Rpl19,Rpl23,Rpl27a,Rpl5,Rps5,Ube2c

RNA加工与结合因子

Csde1,Ddx10,Ddx39b,Dkc1,Exosc8,Hnrnpa1,Hnrnpa2b1,Nolc1,Snrpb,Srsf1

信号转导

Ilk,Npm1,Pdk1,Pten,Ptpa

转录因子和辅因子

Atf4,Id3,Myc,Trp53,Ybx3,Zfp36l1

肿瘤抑制基因

Msh2,Phb,Trp53

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.