货号:WC-MRNA0252-H
产品介绍:
黑色素瘤是一种预后不良的皮肤癌症,在西方人群中呈上升趋势。黑色素瘤是由产生色素的细胞,即黑色素细胞的恶性转化引起的。唯一已知的环境风险因素是暴露在紫外线下,皮肤白皙的人的风险大大增加。黑色素瘤的发病机制也是由遗传因素驱动的。致癌NRAS突变激活效应通路Raf-MEK-ERK和PI3K-Akt。Raf-MEK-ERK通路也可以通过BRAF基因的突变被激活。PI3K-Akt通路可以通过抑制性肿瘤抑制基因PTEN的缺失或突变而被激活。这些突变在黑色素瘤发病早期出现,并在整个肿瘤进展过程中保留下来。黑色素瘤的发展已被证明与p16INK4a/细胞周期蛋白依赖性激酶4和6/视网膜母细胞瘤蛋白(p16INK4a/CDK4,6/pRb)和p14ARF/人双分钟2/p53(p14ARF/HMD2/p53)肿瘤抑制途径的失活密切相关。MITF和TP53与黑色素瘤的进一步发展有关。
WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Melanoma PCR Array plate
种 属:
HUMAN 货 号:
wc-mRNA0252-H
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
human
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
ABCC2
AKT1
AKT2
AKT3
ASXL1
BCL2
BCL2L1
BMI1
BRAF
BRCA2
BRN2
CDH1
B
CDKN1A
CDKN2A
CHP2
COL11A1
CSPG4
CTGF
CTNNB1
CXCR4
CYR61
DNAJA1
DTX3L
EDNRB
C
EGFR
ERCC2
FABP7
FGF13
FGFR2
FGFR3
FOXD1
FOXD3
GAPDHS
GNAQ
GRM1
HOXB7
D
HRAS
IGF1
IGFBP3
ISG15
ITGA4
ITGA6
ITGA7
ITGB3
KIT
KRAS
LIF
MAPK14
E
MAPK3
MC1R
MCAM
MITF
MLANA
MX1
NOTCH2
NPM2
NRAS
OAS1
OPN(SPP1)
PAX3
F
PIK3CA
PIK3CB
PIK3CD
PLA1A
PMEL
PPP2R2C
PTEN
PTPRF
Rab5b
RB1
RNF128
RPS6KA1
G
RUNX3
SHC4
SHOX2
SNAI1
SNAI2
SOS1
SOX10
STK11
TIMP3
TM4SF1
TM4SF13
TMEM229B
H
TNC
TP53
TPD52
TYRP1
UCHL1
WNT4
ACTB
GAPDH
HPRT1
18S
NTC
NTC
黑色素瘤通路图:
图片来源于:https://www.kegg.jp/kegg-bin/show_pathway?map05218
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
![]()
操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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