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多发性硬化PCR 阵列-大鼠
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多发性硬化PCR 阵列-大鼠

货号:WC-MRNA0094-R

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商品描述

货号:WC-MRNA0094-R


产品介绍:

MS是一种中枢神经系统的自身免疫性疾病,逐渐破坏轴突髓鞘和少突胶质细胞。症状主要由髓磷脂丢失和伴随的炎症引起。这种疾病通常以急性发作(复发)为特征,其特征是T细胞浸润和炎症形成白质损伤,在缓解期内神经元细胞可以恢复。MS研究的一个中心焦点是对死后患者的白质损伤进行微阵列分析,以确定新的解释MS机制的基因,并可能产生新的治疗靶点。该阵列包括介导MS进展的基因,如细胞因子和趋化因子或炎症和免疫应答基因,以及其表达变化在多个微阵列表达分析中相关的基因,潜在地识别与该疾病相关的新细胞功能,如细胞粘附、细胞应激和凋亡。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Multiple Sclerosis PCR Array plate

种    属:

Rat

货    号:

WC-MRNA0094-R

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表   

Rat

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Adam17

Bcl2l1

Ccr5

Cxcl11

Ezr

Hdac1

Il1b

Lta

Myc

Ptpn11

Tbp

Vegfa

B

Adm

C1s

Cd28

Cxcl9

Faslg

Hexb

Il2ra

Mag

Nfkb1

Raf1

Tgfb1

Ywhah

C

Akt1s1

Ccl12

Cd4

Cxcr3

Fn1

Hif1a

Il6

Mal

Nr2f1

Rag1

Tgfb2

Lrch1

D

Apc

CCL2

Cd40

Edc4

Foxp3

Icam1

Il6st

Map2k1

Ntf3

Rag2

Tnf

Mog

E

App

Ccl3

Cd44

Ednra

Gfap

Ifng

Itgb2

Mapk1

Phgdh

Rangap1

TNF

Prf1

F

Aspa

Ccl5

Cd9

Egr1

Gnai2

Il10

Jak1

Mbp

Plp1

RT1-Db1

Tnfrsf1a

Stat3

G

Bax

Ccl7

Csf1

Epha1

Gpx1

Il13

Jak2

Mmp9

Pmp22

Sod1

Tnfrsf1b

Vcam1

H

Bcl2

Ccr1

Cxcl10

Erbb3

Grb2

Il18

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Rat)

相关基因

髓鞘形成

Cd9,Hexb,Ifng,Mal,Mbp,Ntf3,Plp1,Pmp22,Sod1,Tgfb1.

T细胞激活和信号

Adam17,Apc,Cd28,Cd4,Egr1,Foxp3,Icam1,Ifng,Il10,Il18,Il1b,Il2ra,Il6,Il6st,Mapk1,Sod1,Tgfb1,Vcam1.

适应性免疫

Adam17,C1s,Cd40,Foxp3,Icam1,Ifng,Il10,Il18,Il1b,Il6st,Tgfb1,Vegfa.

细胞因子和趋化因子

Ccl12,Ccl3 ,Ccl5 ,Ccl7,Csf1,Cxcl10,Cxcl11,Cxcl9,Faslg,Ifng,Il10,Il18,Il1b,Il6,Lta,Tgfb2,Tnf,Vegfa.

炎症反应

炎症调节

Ccl5,Ednra,Gpx1,Il6,Il6st,Jak2,Tnfrsf1a.

炎症反应

C1s,Ccl12,Ccl3,Ccl7 ,Ccr1,Ccr5,Cd40,Cd44,Cxcl10,Cxcl11,Cxcl9,Fn1,Hif1a,Il10,Il13,Il1b,Il2ra,Itgb2,Nfkb1,Stat3,Tgfb1,Tnf,Tnfrsf1b.

神经元凋亡

Akt1s1,Bax,Bcl2,Bcl2l1,Erbb3,Gpx1,Jak2,Ntf3,Sod1,Tgfb2,Tnf

其他细胞凋亡基因

Adam17,Adm,Apc,App,Ccl12,Cd28,Cd44,Faslg,Hdac1,Ifng,Il10,Il1b,Il2ra,Il6,Il6st,Itgb2,Lta ,Mal,Mapk1,Mmp9,

Nfkb1,Raf1,Tgfb1,Tnfrsf1a,Tnfrsf1b,Vegfa.

细胞粘附分子

Adam17,Apc,App,Bcl2,Ccl12,Ccl5,Ccr1,Cd4,Cd44,Cd9,Csf1,Cxcr3,Erbb3,Ezr,Fn1,Icam1,Il18,Il1b,Itgb2,Jak2,Mag,

Map2k1,Tgfb1,Tgfb2,Tnf,Vcam1

细胞应激反应

Adm,Bcl2,Gpx1,Hif1a,Ifng,Il1b,Jak2,Ptpn11,Sod1,Tgfb2,Tnf

受体

Ccr1,Ccr5,Cd28,Cd4,Cd40,Cd44,Cxcr3,Ednra,Epha1,Icam1,Il2ra ,Il6st ,Itgb2,Nr2f1,RT1-Db1,Tnfrsf1a,Tnfrsf1b.

转录因子

Egr1,Foxp3,Hdac1,Hif1a,Myc,Nfkb1,Nr2f1,Stat3

其他多发性硬化基因

Aspa,Edc4,Gfap,Gnai2,Grb2,Jak1,Phgdh,Rangap1,Top1,Tubb4a,Ywhah.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.