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核受体与调控因子PCR阵列-人
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核受体与调控因子PCR阵列-人

货号:WC-MRNA0112-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0112-H




产品介绍:    

        WCGENE®PCRArrayPlate操作简单。只需要将cDNA与qPCRmix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Nuclear Receptors & Coregulators PCR Array plate

种    属:

HUMAN

货    号:

WC-MRNA0112-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

AHR

AR

ARNT

BRD8

COPS2

CREBBP

DDX5

ESR1

ESR2

ESRRA

ESRRB

ESRRG

B

HDAC1

HDAC2

HDAC3

HDAC4

HDAC5

HDAC6

HDAC7

HMGA1

HNF4A

ITGB3BP

KAT2B

KAT5

C

MED1

MED12

MED13

MED14

MED16

MED17

MED24

MED4

MTA1

NCOA1

NCOA2

NCOA3

D

NCOA4

NCOA6

NCOR1

NCOR2

NFKB2

NOTCH2

NR0B1

NR0B2

NR1D1

NR1D2

NR1H2

NR1H3

E

NR1H4

NR1I2

NR1I3

NR2C1

NR2C2

NR2E1

NR2E3

NR2F1

NR2F2

NR2F6

NR3C1

NR3C2

F

NR4A1

NR4A2

NR5A1

NR5A2

NR6A1

NRIP1

PGR

PPARA

PPARD

PPARG

PPARGC1A

PPARGC1B

G

PSMC3

PSMC5

RARA

RARB

RARG

RBPJ

RORA

RORB

RORC

RXRA

RXRB

RXRG

H

TBP

TGS1

THRA

THRB

TRIP4

VDR

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


基因分类(Human)

相关基因

 

 

 

 

核受体

雄激素受体及相关分子

AR,MED1,MED12,MED13,MED14,MED16,MED17,MED24,MED4,NR1I3.

雌激素受体及相关分子

ESR1,ESR2,NCOA6,PPARGC1B

糖皮质激素受体及相关分子

NCOA6,NR3C1

视黄酸受体及相关分子

NCOA6,RARA,RARB,RARG,RXRA,RXRB,RXRG.

甲状腺激素受体及相关分子

BRD8,MED1,MED12,MED13,MED14,MED16,MED17,MED24,MED4,NCOA3,NCOA4,NCOA6,NR1D1,NR1H3,NR1I3,NR2F6,THRA,THRB.

维生素D受体及相关分子

MED1,MED12,MED13,MED14,MED16,MED17,MED24,MED4,VDR.

类固醇激素受体

ESRRA,ESRRB,ESRRG,HNF4A,NR0B1,NR0B2,NR1D1,NR1D2,NR1H2,NR1H3,NR1H4,NR1I2,NR2C1,NR2C2,NR2E3,NR2F1,NR2F2,NR2F6,NR3C2,NR4A1,NR5A1,NR6A1,PGR,PPARA,PPARD,PPARG,RARA,RARB,RARG,RORA,RXRA,RXRB,RXRG,THRA,THRB,VDR

其他 核受体

AHR,TRIP4

转录因子和调节因子

配体依赖性核受体转录共激活因子

MED1,MED12,MED13,MED14,MED16,MED17,MED24,MED4,NCOA6,PPARGC1A,PPARGC1B

转录的正调控因子

ARNT,BRD8,CREBBP,ESR2,KAT5,NCOA1,NCOA2,NCOA3,NCOA4,NFKB2,NR1H3,NR1I2,NR1I3,NR2C2,NR2F1,NR5A1,NRIP1,PSMC3,RARA,RXRA,RXRB,TRIP4

转录的负调控因子

COPS2,HDAC4,HDAC5,HDAC6,HDAC7,NCOR1,NCOR2,NR0B2,NR1D1,NR2F2,PSMC3,PSMC5,THRA,THRB

其他 转录因子和调节因子

AHR,AR,ESR1,ESRRA,ESRRB,ESRRG,HDAC1,HDAC2,HDAC3,HNF4A,ITGB3BP,KAT2B,MTA1,NOTCH2,NR0B1,NR1D2,NR1H2,NR1H4,NR2C1,NR2E3,NR2F6,NR3C1,

NR3C2,NR4A1,NR6A1,PPARA,PPARD,PPARG,RARB,RARG,RBPJ,RORA,RXRG,VDR

染色质修饰酶

组蛋白乙酰化

KAT2B,KAT5,NCOA1,NCOA3

组蛋白去乙酰化

HDAC1,HDAC2,HDAC3,HDAC4,HDAC5,HDAC6,HDAC7

其他 染色质修饰酶

ESR1,NCOA6,PPARGC1B

其他 核受体共同调节因子

DDX5,TGS1

核受体与调控因子通路图:


图片来源:https://www.wikipathways.org/index.php/Pathway:WP170


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.