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癌基因和抑癌基因PCR阵列-大鼠
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癌基因和抑癌基因PCR阵列-大鼠

货号:WC-MRNA0110-R

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商品描述

货号:WC-MRNA0110-R




产品介绍:

沃吉基因癌基因和抑癌基因PCR阵列所代表的基因要么具有致癌或抑癌特性,要么两者都具有,这不仅取决于肿瘤类型,还取决于已知或观察到的与匹配正常组织相关的基因表达差异。分析这些基因在肿瘤样本中的表达可能与生物学表型或临床结果相关,如分期、治疗选择、转移、复发和存活率等。研究结果还可以深入了解癌发生和癌症病理学背后的分子机制和生物学途径,包括细胞凋亡、细胞周期、细胞粘附、DNA损伤和修复以及信号转导。

WCGENE®PCRArrayPlate操作简单。只需要将cDNA与qPCRmix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Oncogenes & Tumor Suppressor Genes PCR Array plate

种    属:

RAT

货    号:

WC-MRNA0110-R

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

RAT

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Abl1

Brca2

Cdkn3

Ets1

Jak2

Men1

Nf2

Raf1

Runx3

Tbp

Tsp1

Xrcc1

B

Akt1

Casp8

Ctnnb1

Fhit

Jun

Met

Nfkb1

Rara

S100a4

Tgfb1

Tsp2

Zhx2

C

Apc

Ccnd1

E2f1

Fos

Junb

Mgmt

Nfkbia

Rassf1

Serpinb5

Tnf

Tsp3

Pten

D

Atm

Cdh1

Egf

Foxd3

Jund

Mlh1

Nras

Rb1

Sh3pxd2a

Tp53

Tsp4

Runx1

E

Bax

Cdk4

Egfr

Fyn

Kit

Mos

Pik3c2a

Rel

Smad4

Tp73

Tsp5

Stk11

F

Bcl2

Cdkn1a

Elk1

Hgf

Kitlg

Myc

Pik3ca

Ret

Src

Trp53

Vhl

Tsc1

G

Bcl2l1

Cdkn2a

Erbb2

Hic1

Kras

Mycn

Prkca

Ros1

Stat3

Trp73

Wt1

Wwox

H

Brca1

Cdkn2b

Esr1

Igf2r

Mdm2

Nf1

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC



基因分类(Rat)

相关基因

Oncogenes(癌基因)

 

Bax,Bcl2l1,Casp8,Cdk4,Elk1,Ets1,Fyn,Hgf,Jak2,Junb,Jund,Kit,Kitlg ,Mcl1,Met,Mos,Nfkbia,Nras,Pik3ca ,Prkca,Raf1,

Rara,Rel,Ros1,Runx1,Src,Stat3,Zhx2

Tumor Suppressor Genes(肿瘤抑制基因)

Atm,Brca1,Brca2,Cdh1,Cdkn2b,Cdkn3,E2f1,Fhit,Foxd3,Hic1,Igf2r,Men1,Mgmt,Mlh1,Nf1,Nf2,Rassf1,Runx3,S100a4,

Serpinb5 ,Smad4,Stk11,Tp73,Tsc1,Vhl,Wt1,Wwox,Xrcc1

Both Oncogenic & Tumor Suppressor Properties(致癌和抑癌特性)

Egf,Egfr,Erbb2 ,Esr1,Fos,Jun,Kras,Mdm2,Myc,Mycn,Nfkb1,Pik3c2a,Pten,Rb1,Ret,Sh3pxd2a,Tgfb1,Tnf,Tp53

Transcription Factors(转录因子)

Abl1,Brca1,Brca2,Cdkn2a,Ctnnb1,E2f1,Elk1,Esr1,Ets1,Fos,Foxd3,Hic1,Jun,Junb,Jund,Mdm2,Men1,Myc,Mycn,Nf1,Nfkb1,Rara,Rb1,Rel,Runx1,Runx3,Smad4,Stat3,Tgfb1,Tnf,Tp53,Tp73,Tsc1,Vhl,Wt1,Zhx2

Epithelial-to-Mesenchymal Transition (EMT)(上皮-间质转化(EMT))

Brca2,Cdkn2b ,Ctnnb1,Erbb2 ,Hgf,Jak2,Kit ,Mcl1,Nf1,Runx3,S100a4,Smad4,Tgfb1,Vhl.

 

Angiogenesis(血管生成)

Akt1,Ctnnb1,Egf,Erbb2 ,Nf1,Pten,Runx1 ,Tgfb1

Apoptosis(细胞凋亡)

Bax,Bcl2,Bcl2l1,Brca1,Casp8 ,E2f1,Mcl1,Mgmt,Pten,Tnf,Vhl

Cell Adhesion Molecules(细胞粘附分子)

Apc,Cdh1,Cdkn2a,Ctnnb1,Kitlg,Nf1,Nf2,Tgfb1

Cell Cycle(细胞周期)

Atm,Brca1,Brca2,Ccnd1,Cdk4,Cdkn1a ,Cdkn2a,Cdkn2b,Cdkn3,E2f1,Hgf,Men1,Stk11,Tp53


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.