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氧化应激PCR阵列-人
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氧化应激PCR阵列-人

货号:WC-MRNA0118-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0118-H


          产品介绍:

氧化应激代表了活性氧的产生和表现之间的不平衡与生物系统容易排毒或修复产生的损伤的能力。正常氧化还原组织状态的干扰会通过产生过氧化物和自由基的产生,从而损害细胞的所有成分,包括蛋白质,脂质和DNA。一些反应性氧化物种甚至可以通过称为氧化还原信号传导的现象充当使者。

在人类中,氧化应激与许多疾病有关。例子包括镰状细胞疾病,动脉粥样硬化,帕金森氏病,心力衰竭,心肌梗塞,阿尔茨海默氏病,精神分裂症,双相情感障碍,脆弱的X综合征和慢性疲劳综合征,但短期氧化应激也可能在短期中很重要。预防通过诱导呈线型的过程来预防衰老。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Oxidative Stress PCR Array plate

种    属:

HUMAN

货    号:

WC-MRNA0118-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

AKR1C2

CAT

DUSP1

GLA

GSTP1

LPO

NCF1

OXR1

PREX1

SEPP1

SQSTM1

TXNRD2

B

ALB

CCL5

EPHX2

GPX1

GSTZ1

MB

NCF2

OXSR1

PRNP

SFTPD

SRXN1

UCP2

C

ALOX12

CCS

EPX

GPX2

GTF2I

MBL2

NCOA7

PDLIM1

PTGR1

SIRT2

STK25

NUDT1

D

AOX1

CYBB

FHL2

GPX3

HMOX1

MGST3

NOS2

PNKP

PTGS1

SLC7A11

TBP

PRDX4

E

APOE

CYGB

FOXM1

GPX4

HSP90AA1

MPO

NOX4

PRDX1

PTGS2

SOD1

TPO

SCARA3

F

ATOX1

DHCR24

FTH1

GPX5

HSPA1A

MPV17

NOX5

PRDX2

PXDN

SOD2

TRAPPC6A

SPINK1

G

BAG2

DUOX1

GCLC

GSR

KRT1

MSRA

NQO1

PRDX3

RNF7

SOD3

TXN

TXNRD1

H

BNIP3

DUOX2

GCLM

GSS

LHPP

MT3

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


基因分类(Human)

相关基因

谷胱甘肽过氧化物酶

GPX1,GPX2,GPX3,GPX4,GPX5,GSTP1,GSTZ1。PRDX1,PRDX2,PRDX3,PRDX4,PRDX6

其他过氧化物酶

CYBB,CYGB,DUOX1,DUOX2,EPX,LPO,MPO,PTGS1,PTGS2,TPO,TTN

其他抗氧化剂

Alb,APOE,GSR,MT3,SELENOS,SOD1,SOD3,SRXN1,TXNRD1,TXNRD2

活性氧代谢超氧化物歧化酶(SOD)

SOD1,SOD2,SOD3

其他超氧化物代谢基因

ALOX12,CCS,DUOX1,DUOX2,MT3,NCF1,NCF2,NOS2,NOX4,NOX5,UCP2

其他活性氧(ROS)代谢基因

AOX1,BNIP3,EPHX2,MPV17,SFTPD,ATOX1,CAT,CCL5,CYGB,DHCR24,DUOX1,

DUOX2,DUOX2,DUSP1,EPX,FOXM1,FTH1,GCLC,GCLM,GPX1,GPX2,GPX3,

GPX4,GPX5,GSR,GSS,HMOX1,HSPA1A,KRT1,LPO,MBL2,MPO,MSRA,NQO1,NUDT1,PDLIM1,PRDX2,PRDX6,PRNP,RNF7,SELENOS,SIRT2,SELENOS,SIRT2,SELENOS,SIRT2,SELENOS,SIRT2,SELENOS,SOD1,SOD2,SQSTM1,SRXN1,TPO,TTN,TXN,TXNRD1,TXNRD2

途径活性特征基因

 

AKR1C2,BAG2,FHL2,GCLM,GLA,HMOX1,HSP90AA1,LHPP,NCOA7,NQO1,PTGR1,SLC7A11,SPINK1,TRAPPC6A,TXN,TXNRD1

氧转运蛋白

CYGB,MB。


氧化应激信号通路图:

 

图片来源:https://www.wikipathways.org/index.php/Pathway:WP408

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.