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PPAR靶向PCR 阵列-小鼠
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PPAR靶向PCR 阵列-小鼠

货号:WC-MRNA0123-M

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商品描述

货号:WC-MRNA0123-M


产品介绍:

PPAR是调节脂质代谢,细胞分化和增殖的重要核激素受体。3种PPAR同种型具有相似的功能但组织分布不同:α(脂肪组织,肝脏和肌肉),β/δ(广泛表达)和γ(脂肪组织和肌肉)。配体如脂肪酸激活这些受体,导致它们与类视黄醇X受体(RXR)异二聚化并启动靶基因的转录。多种不同的共激活因子和共抑制因子与PPAR/RXR异二聚体相互作用以指导靶基因特异性。PPAR活性失调是代谢综合征相关疾病的潜在原因,例如胰岛素抵抗和高胆固醇血症。该阵列包括参与脂肪生成,脂质转运和代谢以及胰岛素信号传导的PPAR靶标。还包括参与PPAR配体转运的基因以及转录因子和辅因子。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

PPAR Targets PCR Array plate

种    属:

Mouse

货    号:

WC-MRNA0123-M

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

mouse

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Acaa2

Acadl

Acadm

Acox1

Acox3

Acsl1

Acsl3

Acsl4

Acsl5

Adipoq

Aldh3a2

Angptl4

B

Apoa1

Apoa5

Apoc3

Apoe

Cd36

Chd9

Clu

Cpt1a

Cpt1b

Cpt2

Creb1

Crebbp

C

Cyp27a1

Cyp4a10

Cyp7a1

Dgat1

Ech1

Ehhadh

Eln

Ep300

Etfdh

Fabp1

Fabp2

Fabp3

D

Fabp4

Fabp5

Fabp6

Fabp7

Fads2

Fgr

Gyk

Helz2

Hif1a

Hmgcs2

Hspd1

Ilk

E

Klf10

Lpl

Map3k8

Med1

Mlycd

Mmp9

Ncoa3

Ncoa6

Nr1h3

Olr1

Pck1

Pck2

F

Pdpk1

Pltp

Ppara

Ppard

Pparg

Ppargc1a

Ppargc1b

Pprc1

Pten

Rxra

Rxrb

Rxrg

G

Scd1

Sirt1

Slc22a1

Slc22a5

Slc25a1

Slc25a20

Slc27a1

Slc27a2

Slc27a4

Slc27a5

Slc27a6

Smarcd3

H

Sorbs1

Src

Tbp

Tgs1

Txnip

Ucp1

Actb

Gapdh

Hprt

B2m

NTC

NTC



基因分类(Mouse)

基因分类

 

PPARα目标

脂肪生成

Adipoq,Lpl,Nr1h3,Ucp1.

脂肪酸代谢

Acadl,Acadm,Acox1,Acox3,Acsl1,Acsl3,Acsl4,Acsl5,Cpt1a,Cpt1b,Cpt2,Cyp27a1,Cyp4a10,Cyp7a1,Ehhadh,Fads2,Hmgcs2,Pltp,Scd1.

脂质转运

Adipoq,Angptl4,Apoa1,Apoa5,Apoc3,Lpl,Nr1h3,Olr1.

胰岛素信号

Cpt1a,Sorbs1.

PPARβ和PPARδ目标

脂肪生成

Adipoq,Ech1,Fabp4,Lpl,Ucp1.

脂肪酸代谢

Acaa2,Acadl,Acadm,Acox1,Acox3,Acsl1,Acsl3,Acsl4,Acsl5,Cpt1a,Cpt1b,Cpt2,Cyp27a1,Cyp4a10,

Cyp7a1,Ehhadh,Etfdh,Fabp1,Fabp3,Fabp4,Fads2,Gk,Hmgcs2,Mlycd,Pltp,Scd1,Slc27a1,Slc27a4.

脂质转运

Adipoq,Angptl4,Lpl,Olr1.

细胞增殖

Hif1a,Ilk,Klf10,Pten.

胰岛素信号

Cpt1a,Pdpk1,Sorbs1.

其他PPARβ和PPARδ靶基因

Pdpk1.

PPARγ靶

 

脂肪生成

Adipoq,Lpl,Nr1h3,Ucp1.

脂肪酸代谢

Acadl,Acadm,Acox1,Acox3,Acsl1,Acsl3,Acsl4,Acsl5,Cpt1a,Cpt1b,Cpt2,Cyp27a1,Cyp4a10,Cyp7a1,

Ehhadh,Fads2,Gk,Scd1.

脂质转运

Adipoq,Angptl4,Apoe,Dgat1,Lpl,Nr1h3,Olr1.

细胞增殖

Clu,Eln,Hspd1,Txnip.

胰岛素信号

Cpt1a,Dgat1,Pck1,Sorbs1.

其他PPARγ靶基因

Mmp9,Pck1,Pck2.

PPAR辅因子

Chd9,Creb1,Crebbp,Ep300,Fgr,Med1,Ncoa3,Ncoa6,Ppargc1a,Ppargc1b,Pprc1,Sirt1,Smarcd3,Src,Tgs1.

PPAR配体转运

Cd36,Fabp1,Fabp2,Fabp3,Fabp4,Fabp5,Fabp6,Fabp7,Slc22a5,Slc27a1,Slc27a2,Slc27a4,Slc27a5,

Slc27a6.

PPAR转录因子

Ppara,Ppard,Pparg,Rxra,Rxrb,Rxrg.


Ppar通路图:


图片来源于:https://www.kegg.jp/pathway/map03320


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.