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视黄酸信号PCR 阵列-小鼠
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视黄酸信号PCR 阵列-小鼠

货号:WC-MRNA0129-M

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商品描述

货号:WC-MRNA0129-M


产品介绍:

视黄酸(RA)是维生素A(视黄醇)的主要功能衍生物,其活性涉及脊椎动物发育和体内平衡的许多方面,而该途径的破坏导致发育异常并破坏脂肪,心脏,神经,生殖,和外皮组织等。RA主要通过结合核受体家族(视黄酸受体α,β和γ)起作用,然后与其配偶体(类视黄醇X受体α,β和γ)异二聚化并改变转录。此外,最近的证据表明,替代受体(PPARδ)也在一些组织中响应RA信号传导,并且视黄醇和RA也可以诱导非基因组细胞效应。因此,RA的作用取决于其同源受体的表达,负责将视黄醇转化为RA的酶,降低RA水平的代谢酶和转运蛋白,其中一些作为信号转导物,似乎影响RA的分布。及其代谢前体。该阵列包括编码负责RA及其前体的合成,转运和代谢的已知受体和蛋白质的基因,以及RA信号传导的下游靶标。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。



产品内容

品    名:

Retinoic Acid Signaling PCR Array plate

种    属:

Mouse

货    号:

WC-MRNA0129-M

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Mouse

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Adh1a

Cd38

Cyp26c1

Fabp5

Gli1

Jag1

Myc

Pitx2

Rbp1

Rxrg

Tbx1

Wnt5a

B

Aldh1a1

Cdx1

Dcx

Fgf8

Hnf1b

Klf4

Nanog

Plat

Rbp2

Shh

Tfap2c

Wnt8a

C

Aldh1a2

Chd7

Dhrs3

Foxa1

Hoxa1

Lefty1

Neurod1

Ppara

Rbp4

Sox2

TGFB1

Pax6

D

Aldh1a3

Crabp1

Dhrs9

Foxg1

Hoxa5

Lhx1

Nrip1

Ppard

Rdh10

Sox9

Tgfb2

Rarg

E

Apoa2

Crabp2

Dlx5

Foxo3

Hoxb1

LRAT

NRP1

Pparg

Ret

Srebf1

Tgm2

Rxrc

F

Ascl1

Cyp1b1

Efnb1

FOXP3

Hoxb4

Mafb

Olig2

Rara

Rxra

STAT1

Tubb3

Stra8

G

Bhlhe40

Cyp26a1

Egr1

Gata4

Hsd17b2

Meis2

Otx2

Rarb

Rxrb

Stra6

Ucp1

UCP3

H

Bmp2

Cyp26b1

Epo

Gbx2

Isl1

Msx2

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Mouse)

相关基因

视黄酸和视黄醇受体

Ppard,Rara,Rarb,Rarg,Rxra,Rxrb,Rxrg,Stra6.

视黄酸和视黄醇代谢

Adh1,Aldh1a1,Aldh1a2,Aldh1a3,Cyp1b1,Cyp26a1,Cyp26b1,Cyp26c1,Dhrs3,Dhrs9,Lrat,Rdh10.

视黄酸和视黄醇转运蛋白

Crabp1,Crabp2,Fabp5,Rbp1,Rbp2,Rbp4,Stra6.

非经典视黄酸信号转导

Crabp1,Fabp5,Lrat,Ppard,Pparg,Rara,Stra6.

视黄酸受体靶标

Adh1,Apoa2,Bhlhe40 ,Cd38,Cdx1,Crabp1,Crabp2,Cyp26a1,Cyp26b1,Cyp26c1,Dhrs9,Efnb1,Egr1,Epo,Foxa1,Gbx2,Hnf1b,Hoxa1,Hoxa5,Hoxb1,Hoxb4,Hsd17b2,Klf4,Lefty1,Meis2,Myc,Plat,Rara,Rarb,Rarg,Rbp1,Rbp4,Shh,Srebf1,Stra6,Stra8,Tfap2c,Tgm2,Ucp1,Wnt8a.

视黄酸途径调节剂

Chd7,Hoxa1,Meis2,Nrip1,Pax6,Pparg,Tbx1.

信号转导

Bmp2,Cd38,Dcx,Efnb1,Epo,Fgf8,Jag1,Klf4,Lefty1,Plat ,Ret,Shh,Tgfb2,Wnt5a,Wnt8a.

转录因子和调节因子

Ascl1,Bhlhe40,Cdx1,Chd7,Dlx5,Egr1,Foxa1,Foxg1,Foxo3,Gata4,Gbx2,Gli1,Hnf1b,Hoxa1,Hoxa5,Hoxb1,Hoxb4,Isl1,Klf4,Lhx1,Mafb,Meis2,Msx2,Myc,Nanog,Neurod1,Nrip1,Olig2,Otx2,Pax6,Pitx2,Ppara,Ppard,Pparg,Rara,Rarb,Rarg,Rxra,Rxrb,Rxrg,Sox2,Sox9,Srebf1,Tbx1,Tfap2c.

发育;脂肪生成

Egr1,Fabp5,Foxa1,Klf4,Msx2,Nrip1,Ppara,Ppard,Pparg,Rbp4,Srebf1,Stra6,Ucp1.

心血管系统发展

Bmp2,Chd7,Dhrs3,Dlx5,Epo,Fgf8,Gata4,Isl1,Jag1,Pitx2,Shh,Sox9,Stra6,Tbx1,Tgfb2,Wnt5a.

体型形成

Bmp2,Cdx1,Efnb1,Fgf8,Foxa1,Foxg1,Gata4,Gbx2,Gli1,Hnf1b,Hoxa1,Hoxa5,Hoxb1,Hoxb4,Jag1,Lefty1,Lhx1,

Mafb,Meis2,Nanog,Neurod1,Otx2,Pitx2,Shh,Tbx1,Wnt5a,Wnt8a.

神经发育

Ascl1,Bmp2,Chd7,Dcx,Dlx5,Efnb1,Fgf8,Foxa1,Foxg1,Gbx2,Hnf1b,Hoxa1,Hoxb1,Isl1,Mafb,Meis2,Neurod1,Olig2,

Otx2,Pax6,Pitx2,Ret,Shh,Sox2,Stra6,Tbx1,Tfap2c,Tgfb2,Tubb3,Wnt5a.

性别决定与发展

Chd7,Fgf8,Foxo3,Gata4,Gli1,Hnf1b,Lhx1,Mafb,Rbp4,Shh,Sox2,Sox9,Stra6,Stra8,Wnt5a.

皮肤发育和体内平衡

Klf4,Lrat,Msx2,Pax6,Ppara,Ppard,Pparg,Shh,Tfap2c.

干细胞发育与维护

Gli1,Klf4,Nanog,Shh,Sox2,Tfap2c,Wnt5a.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.