货号:WC-MRNA0149-H
产品介绍:
肿瘤坏死因子(TNF)作为一种重要的细胞因子,可以诱导多种细胞内信号通路,包括细胞凋亡和细胞存活以及炎症和免疫。活化的 TNF 组装成同源三聚体并与其受体(TNFR1、TNFR2)结合,导致 TNFR1 或 TNFR2 三聚化。 TNFR1 由几乎所有细胞表达,是 TNF(也称为 TNF-α)的主要受体。相比之下,TNFR2 在有限的细胞中表达,例如 CD4 和 CD8 T 淋巴细胞、内皮细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞、神经元亚型、心肌细胞、胸腺细胞和人间充质干细胞。它是 TNF 和 LTA(也称为 TNF-β)的受体。在与配体结合后,TNFR 介导一些衔接蛋白(如 TRADD 或 TRAF2)的结合,进而启动信号转导的募集。 TNFR1 信号传导诱导许多基因的激活,主要受两个不同的途径控制,NF-kappa B 途径和 MAPK 级联,或细胞凋亡和坏死性凋亡。 TNFR2 信号激活 NF-kappa B 通路,包括 PI3K 依赖性 NF-kappa B 通路和导致存活的 JNK 通路。
沃吉基因肿瘤坏死因子信号通路PCR阵列包含TNF 超家族和 TNF 受体超家族的成员以及参与 TNFR1 和 TNFR2 信号通路的基因关键的90个基因。
WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
TNF Signaling Pathway PCR Array plate
种 属:
Human 货 号:
WC-MRNA0149-H
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
Human
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
AGFG1
CASP2
CHUK
IKBKAP
LTB
NFKBIA
RB1
TNFRSF10C
TNFRSF17
TNFRSF6B
TNFSF14
TRAF2
B
ARHGDIB
CASP3
CRADD
IKBKB
LTBR
NGFR
RELT
TNFRSF10D
TNFRSF18
TNFRSF8
TNFSF15
TRAF3
C
BAG4
CASP8
DFFA
IKBKG
MADD
PAK1
SPTAN1
TNFRSF11A
TNFRSF19
TNFRSF9
TNFSF18
TNFRSF10B
D
BAX
CASP9
DUSP1
JUN
MAP2K4
PAK2
TBP
TNFRSF11B
TNFRSF1A
TNFSF10
TNFSF4
TNFRSF14
E
BCL2
CD27
EDA2R
LMNA
MAP3K1
PARP1
TNF
TNFRSF12A
TNFRSF1B
TNFSF11
TNFSF8
TNFRSF4
F
BCL2L1
CD40
FADD
LMNB1
MAP3K7
PGLYRP1
TNFAIP3
TNFRSF13B
TNFRSF21
TNFSF12
TNFSF9
TNFSF13B
G
CAD
CD40LG
FAS
LMNB2
MAPK8
PRKDC
TNFRSF10A
TNFRSF13C
TNFRSF25
TNFSF13
TRADD
TRAF1
H
CASP10
CD70
FASLG
LTA
NFKB1
PSMG2
ACTB
GAPDH
HPRT1
18s
NTC
NTC
基因分类(human)
相关基因
TNF超家族成员
FASLG ,LTA ,TNFSF10 ,TNFSF14,TNFSF8.TNFSF15.TNFSF14.CD40LG,TNF,TNFSF18.CD70,TNFSF9.CD40LG,TNF.FASLG ,
TNF,TNFSF10 ,TNFSF14,TNFSF15.LTB,PGLYRP1,PSMG2,TNFSF11 ,TNFSF12,TNFSF13,TNFSF13B,TNFSF4 .
TNF受体超家族成员
CD27 ,FAS,TNFRSF10A ,TNFRSF10B ,TNFRSF19,TNFRSF25 ,TNFRSF9,TRADD.TNFRSF10A ,TNFRSF10B .CD27 .CD27 ,
FAS,TNFRSF10D,TNFRSF18,TNFRSF6B.CD40 ,LTBR,NGFR,TNFRSF10C,TNFRSF11B ,TNFRSF12A,TNFRSF14,TNFRSF1A ,
TNFRSF1B,TNFRSF21.CD40 ,TNFRSF1A .CD27 ,CD40 ,EDA2R,LTBR,TNFRSF10A ,TNFRSF10B ,TNFRSF1A ,TRADD.CD27 ,EDA2R,
TNFRSF19.RELT,TNFRSF11A ,TNFRSF13B,TNFRSF13C,TNFRSF17,TNFRSF4 ,TNFRSF8.
TNFR1 信号转导
BCL2,BCL2L1,CASP3,CRADD,FADD,TRADD.CASP2,CASP3,CASP8 ,CASP9,CASP10,BAG4,CASP2,TNF.DFFA,PAK1,TNFRSF1A ,
TRAF2.TNF,TNFRSF1A .CASP8 ,FADD,TNF,TNFRSF1A ,TRADD.MAP2K4 ,MAPK8 ,PAK1.JUN,PARP1 ,RB1,TNF,TNFRSF1A .AGFG1,
ARHGDIB,CAD,LMNA,LMNB1,LMNB2,MADD,MAP3K1 ,MAP3K7 ,PAK2,PRKDC,SPTAN1.
TNFR2 信号转导
IKBKG,LTA ,TRAF3.NFKB1,TNFAIP3.NFKBIA ,TNFRSF1B,TRAF1,TRAF2.NFKB1.CHUK ,IKBKB ,IKBKG,NFKBIA ,TNFAIP3.IKBKB ,
IKBKG,NFKB1,NFKBIA .AGFG1,DUSP1 ,MAP3K1 .
TNF-α Signaling Pathway通路图
图片来源于: https://www.genome.jp/pathway/map04668
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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