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肿瘤坏死因子信号通路PCR 阵列-小鼠
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肿瘤坏死因子信号通路PCR 阵列-小鼠

货号:WC-MRNA0149-M

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商品描述

货号:WC-MRNA0149-M





产品介绍:

       肿瘤坏死因子(TNF)作为一种重要的细胞因子,可以诱导多种细胞内信号通路,包括细胞凋亡和细胞存活以及炎症和免疫。活化的 TNF 组装成同源三聚体并与其受体(TNFR1、TNFR2)结合,导致 TNFR1 或 TNFR2 三聚化。 TNFR1 由几乎所有细胞表达,是 TNF(也称为 TNF-α)的主要受体。相比之下,TNFR2 在有限的细胞中表达,例如 CD4 和 CD8 T 淋巴细胞、内皮细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞、神经元亚型、心肌细胞、胸腺细胞和人间充质干细胞。它是 TNF 和 LTA(也称为 TNF-β)的受体。在与配体结合后,TNFR 介导一些衔接蛋白(如 TRADD 或 TRAF2)的结合,进而启动信号转导的募集。 TNFR1 信号传导诱导许多基因的激活,主要受两个不同的途径控制,NF-kappa B 途径和 MAPK 级联,或细胞凋亡和坏死性凋亡。 TNFR2 信号激活 NF-kappa B 通路,包括 PI3K 依赖性 NF-kappa B 通路和导致存活的 JNK 通路。

       沃吉基因肿瘤坏死因子信号通路PCR阵列包含TNF 超家族和 TNF 受体超家族的成员以及参与 TNFR1 和 TNFR2 信号通路的基因关键的90个基因。

       WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

TNF Signaling Pathway PCR Array plate

种    属:

Mouse

货    号:

WC-MRNA0149-M

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Mouse

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Apaf1

Arhgdib

Bag4

Bcl2

BCL3

Bid

Birc2

Birc3

Cad

Casp2

Casp3

Casp7

B

Casp8

Cd27

Cd40

Cd40lg

Cd70

Cflar

Chuk

Cradd

Csf1

Csf2

Cycs

Dffa

C

Dusp1

Eda2r

Fadd

Fas

Fasl

Ikbkb

Ikbkg

Jun

Lmna

Lmnb1

Lmnb2

Lta

D

Ltb

Ltbr

Map2k4

Map3k1

Map3k14

Map3k7

Mapk8

Nfkb1

Nfkbia

Ngfr

Pak1

Pak2

E

Parp1

Pglyrp1

Prkdc

Psmg2

Rb1

Relt

Spna2

Tank

Tbp

Tnf

Tnfaip3

Tnfrsf10b

F

Tnfrsf11a

Tnfrsf11b

Tnfrsf12a

Tnfrsf13b

Tnfrsf13c

Tnfrsf14

Tnfrsf17

Tnfrsf18

Tnfrsf19

Tnfrsf1a

Tnfrsf1b

Tnfrsf21

G

Tnfrsf25

Tnfrsf4

Tnfrsf8

Tnfrsf9

Tnfsf10

Tnfsf11

Tnfsf13

Tnfsf13b

Tnfsf14

Tnfsf15

Tnfsf18

Tnfsf4

H

Tnfsf8

Tnfsf9

Tradd

Traf1

Traf2

Traf3

ACTB

GAPDH

HPRT1

B2M

NTC

NTC



基因分类(mouse)

                                 相关基因

TNF超家族成员

Fasl,Lta ,Tnfsf10 ,Tnfsf14,Tnfsf8.Tnfsf15.Tnfsf14.Cd40lg,Tnf,Tnfsf18.Cd70,Tnfsf9.Cd40lg,Tnf.Fasl,Tnf,Tnfsf10 ,Tnfsf14,Tnfsf15.

Ltb,Pglyrp1,Psmg2,Tnfsf11 , Tnfsf13,Tnfsf13b,Tnfsf4.

TNF受体超家族成员

Cd27,Fas,Tnfrsf10b ,Tnfrsf19,Tnfrsf25 ,Tnfrsf9,Tradd.Tnfrsf10b .Cd27.Cd27,Fas,Tnfrsf18.Cd40,Ltbr,Ngfr,Tnfrsf11b ,Tnfrsf1a ,

Tnfrsf1b,Tnfrsf21.Cd40,Tnfrsf1a .Cd27,Cd40,Eda2r,Ltbr,Tnfrsf10b ,Tnfrsf1a ,Tradd.Cd27,Eda2r,Tnfrsf19.

Relt,Tnfrsf11a ,Tnfrsf13b,Tnfrsf13c,Tnfrsf17,Tnfrsf4 ,Tnfrsf8.

TNFR1 信号转导

Apaf1,Bcl2,Bcl3,Birc2,Birc3,Bid,Casp3,Cradd,Cflar,Cycs,Fadd,Tradd.Casp2,Casp3,Casp7,Casp8 .Bag4,Casp2,Csf1,Csf2,Tnf.Dffa,

Pak1,Tnfrsf1a ,Traf2.Tnf,Tnfrsf1a .Casp8 ,Fadd,Tnf,Tnfrsf1a ,Tradd.Map2k4 ,Mapk8 ,Pak1.Jun,Parp1,Rb1,Tnf,Tnfrsf1a .Arhgdib,

Cad,Lmna,Lmnb1,Lmnb2,Map3k1 ,Map3k7 ,Pak2,Prkdc,Sptan1.

TNFR2 信号转导

Ikbkg,Lta ,Traf3.Nfkb1,Tnfaip3.Nfkbia ,Tnfrsf1b,Traf1,Traf2.Nfkb1.Chuk ,Ikbkb ,Ikbkg,Nfkbia ,Tank,Tnfaip3.Ikbkb ,Ikbkg,Nfkb1,Nfkbia

.Dusp1 ,Map3k1 ,Map3k14.


TNF-α Signaling Pathway通路图

 

图片来源于: https://www.genome.jp/pathway/map04668


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.