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肿瘤转移PCR阵列-人
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肿瘤转移PCR阵列-人

货号:WC-MRNA0151-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0151-H


          产品介绍:

沃吉基因肿瘤转移PCR阵列包含细胞粘附、ECM成分、细胞周期、细胞生长和增殖、凋亡、转录因子和调节因子等与肿瘤转移相关的基因。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Tumor Metastasis PCR Array plate

种    属:

HUMAN

货    号:

WC-MRNA0151-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表


human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

APC

CDKN2A

CXCL12

FGFR4

HTATIP2

MCAM

MMP13

MYC

PTEN

SMAD2

TIAM1

TSHR

B

BRMS1

CHD4

CXCR2

FLT4

IGF1

MDM2

MMP14

MYCL1

RB1

SMAD4

TIMP1

VEGFA

C

CCL7

COL4A2

CXCR4

FN1

IL18

MET

MMP2

NF2

RBL1

SRC

TIMP2

MTSS1

D

CD44

CST7

DENR

FXYD5

IL1B

METAP2

MMP3

NME1

RBL2

SSTR2

TIMP3

PNN

E

CD82

CTBP1

EPHB2

GNRH1

ITGA7

MGAT5

MMP7

NME4

RORB

SYK

TIMP4

SET

F

CDH1

CTNNA1

ETV4

HGF

KISS1

MMP1

MMP9

NR4A3

RPSA

TBP

TNFSF10

TGFB1

G

CDH11

CTSK

EWSR1

HPSE

KISS1R

MMP10

MTA1

PLAUR

SERPINE1

TCF20

TP53

TRPM1

H

CDH6

CTSL1

FAT1

HRAS

KRAS

MMP11

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC



基因分类(Human)

相关基因

细胞粘附DH1(E-钙粘蛋白)

CD44、CDH1、CDH11、CDH6、FAT1、FXYD5、ITGA7、PNN、SYK、VEGFA

跨膜受体

CD44、ITGA7、RPSA

其他细胞粘附分子包括

CTNNA1、FN1、MCAM、MGAT5、MTSS1。

细胞外基质(ECM)蛋白酶

MMP10、MMP11、MMP13、MMP2、MMP3、MMP7、MMP9

细胞外基质(ECM)蛋白酶抑制剂

TIMP2、TIMP3、TIMP4

其他细胞外基质(ECM)分子

COL4A2、HPSE、SERPINE1

细胞周期调节

BRMS1、CDKN2A、HRA、IL1B、KRAS、MTSS1、NF2、NME1、PTEN、RB1、TGFB1、TP53、VEGFA

细胞周期的负性调节:前列腺癌

cdkn2a、CTBP1、GNRH1、IL1B、MDM2、NF2、NME1、SSTR2

细胞周期阻滞和检查点

CDKN2A,MYC,RB1,TP53

细胞增殖的调节

IGF1、IL18、TSHR、VEGFA

生长因子和激素

gNRH1、HGF、IGF1、TGFB1、VEGFA。

胞质分裂

CCL7、CXCL12、IL18、IL1B、TNFSF10

细胞表面受体

CXCR2、CXCR4、EPHB2、FGFR4、FLT4、KISS1R、MET、NR4A3、PLAUR、RORB、SSTR2、TSHR

其他细胞生长基因

EWSR1、HRA、MYC、SET、SRC、SYK、TRPM1

细胞凋亡

CXCR4、HTATIP2、IL18、IL1B、TGFB1、TIMP3、TNFSF10、TP53

转录因子和调节因子

 

CHD4、ETV4、EWSR1、HTATIP2、MTA1、MYC、MYCL、NR4A3、RB1、RORB、SMAD2、SMAD4、TCF20、TP53

其他肿瘤转移基因

CD82、CST7、CTSK、CTSL、KISS1、METAP2、NME4

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.