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伤口愈合PCR阵列-大鼠
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伤口愈合PCR阵列-大鼠

货号:WC-MRNA0160-R

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商品描述

货号:WC-MRNA0160-R


           产品介绍:

  伤口愈合通过三个重叠阶段进行:炎症,肉芽和组织重塑。皮肤损伤后形成血凝块,炎症细胞浸润伤口,分泌细胞因子和生长促进炎症阶段的因素。在造粒阶段,成纤维细胞和其他细胞分化成肌成纤维细胞,其沉积细胞外基质(ECM)蛋白。同时,发生血管生成,角质形成细胞增殖并迁移以闭合伤口。在最后的组织重塑阶段,细胞凋亡消除肌成纤维细胞和外来血管,并且ECM被重塑以类似于原始组织。最后一个组织重塑阶段的失调会导致纤维化。

沃吉基因伤口愈合PCR阵列包含对伤口愈合的三个阶段中的每一个阶段都有重要的基因,包括ECM重塑因子、炎性细胞因子和趋化因子,以及生长因子和主要信号分子。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Wound Healing PCR Array plate

种    属:

RAT

货    号:

WC-MRNA0160-R

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Rat

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Actc1

Angpt1

Ccl12

Ccl7

Cd40lg

Cdh1

Col14a1

Col1a1

Col1a2

Col3a1

Col4a1

Col4a3

B

Col5a1

Col5a2

Col5a3

Csf2

Csf3

Ctgf

Ctnnb1

Ctsg

Ctsk

Ctsl1

Cxcl1

Cxcl10

C

Cxcl11

Cxcl12

Cxcl3

Cxcl5

Egf

Egfr

F13a1

F3

Fga

Fgf10

Fgf2

Fgf7

D

Hbegf

Hgf

Ifng

Igf1

Il10

Il1b

Il2

Il4

Il6

Il6st

Itga1

Itga2

E

Itga3

Itga4

Itga5

Itga6

Itgav

Itgb1

Itgb3

Itgb5

Itgb6

Mapk1

Mapk3

Mif

F

Mmp1a

Mmp2

Mmp7

Mmp9

Pdgfa

Plat

Plau

Plaur

Plg

Prkar1a

Prkar2b

Pten

G

Ptgs2

Rac1

Rhoa

Serpine1

Sod1

Sod2

Stat3

Tagln

Tbp

Tgfa

Tgfb1

Tgfbr3

H

Timp1

Tnf

Vegfa

Vtn

Wisp1

Wnt5a

Actb

Gapdh

Hprt1

Ubb

NTC

NTC



    基因分类(Rat)

                         相关基因

细胞外基质和细胞粘附分子

 

细胞外基质(ECM)结构成分

Col14a1,Col1a1,Col1a2,Col3a1,Col4a1,Col4a3,Col5a1,Col5a2,Col5a3,Vtn

细胞外基质重塑酶

Ctsg,Ctsk,Ctsl,F13a1,F3,Fga,Mmp1,Mmp2,Mmp7,Mmp9,Plat,Plau,Plaur,Plg,Serpine1,Timp1

细胞粘附分子

Cdh1,Itga1,Itga2,Itga3,Itga4,Itga5,Itga6,Itgav,Itgb1,Itgb3,Itgb5,Itgb6

细胞骨架调节因子

Actc1,Rac1,Rhoa,Tagln

炎性细胞因子和趋化因子

Ccl12,Ccl7,Cd40lg,Cxcl1,Cxcl11,Cxcl3,Cxcl6,Ifng,Il10,Il1b,Il2,Il4,Il6

生长因子

Angpt1,Ccn2,Csf2,Csf3,Egf,Fgf10,Fgf2,Fgf7,Hbegf,Hgf,Igf1,Mif,Pdgfa,Tgfa,Tgfb1,Tnf,Vegfa

信号转导

TGFβ 信号

Stat3,Tgfb1,Tgfbr3

WNT 信号

Ccn4,Ctnnb1,Wnt5a

激酶类

Mapk1,Mapk3,Pten

细胞表面受体

Egfr,Il6st

其他信号转导基因

Ptgs2


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.