货号:WC-MRNA0014-H
产品介绍:
三种不同的模式识别受体家族(PRR)(toll样(TLR),Nod样(NLR)和RIG-I样受体)启动先天免疫,即先天性一般宿主对常见病原体如病毒的反应。这些受体识别并结合病毒DNA和RNA,激活下游信号传导以诱导炎性细胞因子(包括α和β干扰素)的表达。α和β干扰素介导激活树突细胞和自然杀伤细胞以及适应性免疫应答的I型干扰素信号传导。一些病毒核酸与多个PRR结合,并且每种免疫细胞类型表达一组特定的PRR。该阵列包含TLR,NLR和RIG-I样受体的受体和信号传导效应子,对这些途径有反应的基因,以及参与I型干扰素信号传导的基因以及下游干扰素刺激基因(ISG)。
WCGENE®PCRArrayPlate操作简单。只需要将cDNA与qPCRmix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Antiviral Response PCR Array plate
种 属:
Human 货 号:
WC-MRNA0014-H
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
human
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
AIM2
APOBEC3G
ATG5
AZI2
CARD9
CASP1
CASP10
CASP8
CCL3
CCL5
CD40
CD80
B
CD86
CHUK
CTSB
CTSL
CTSS
CXCL10
CXCL11
CXCL9
CYLD
DAK
DDX3X
DDX58
C
DHX58
FADD
FOS
HSP90AA1
IFIH1
IFNA1
IFNA2
IFNA4
IFNA5
IFNAR1
IFNAR2
IFNB1
D
IKBKB
IL12A
IL12B
IL15
IL18
IL1B
IL6
IL8
IRAK1
IRF1
IRF3
IRF5
E
IRF7
ISG15
JUN
MAP2K1
MAP2K3
MAP3K1
MAP3K7
MAPK1
MAPK14
MAPK3
MAPK8
MAVS
F
MEFV
MX1
MYD88
NFKB1
NFKBIA
NLRP3
NOD2
OAS1
OAS2
OAS3
PIN1
PSTPIP1
G
PYCARD
PYDC1
RELA
RIPK1
SPP1
STAT1
SUGT1
TBK1
TICAM1
TLR3
TLR7
TLR8
H
TLR9
TNF
TRADD
TRAF3
TRAF6
TRIM25
ACTB
GAPDH
HPRT1
18s
NTC
NTC
基因分类(Human)
相关基因
Toll样受体(TLR)信号
Toll样受体和分子伴侣
CTSB,CTSL,CTSS,TLR3,TLR7,TLR8,TLR9
Toll样受体下游的信号传导
CHUK,FOS,IKBKB,IRAK1,IRF3,IRF5,IRF7,JUN,MAP2K1,MAP2K3,MAP3K7,MAPK1,MAPK14,
MAPK3,MAPK8,MYD88,NFKB1,NFKBIA,RELA,RIPK1,SPP1,TBK1,TICAM1,TNF,TRAF3,TRAF6
Toll样受体信号传导反应基因
CCL3,CCL5,CD40,CD80,CD86,CXCL10,CXCL11,CXCL9,IFNA1,IFNA2,IFNB1,IL12A,IL12B,IL15
,IL1B,IL6
NOD样受体(NLR)信号
受体和信号分子
AIM2
NOD-Like 受体和信号分子
CARD9,CASP1,HSP90AA1,MEFV,NLRP3,NOD2,OAS2,PSTPIP1,PYCARD,PYDC1 ,SUGT1.
NOD样受体信号传导反应基因
IL18,IL1B.
RIG-I样受体信号转导
受体和伴侣
CYLD
RIG-I-Like 受体和伴侣
DDX58,DHX58,IFIH1,ISG15,DAK,TRIM25
RIG-I样受体下游的信号传导
ATG5,AZI2,CASP10,CASP8,CHUK,DDX3X,FADD,IKBKB,IRF3,IRF7,MAP3K1,MAP3K7,MAPK14 ,MAPK8,MAVS,NFKB1,NFKBIA ,PIN1,RELA,RIPK1,TBK1,TNF,TRADD,TRAF3,TRAF6
RIG-I样受体信号传导反应基因
CXCL10 ,CXCL8 ,IFNA1,IFNA2,IFNB1,IL12A,IL12B
I型干扰素信号和应答
I型干扰素信号
IFNA1,IFNA2,IFNAR1,IFNB1,STAT1
干扰素应答基因
APOBEC3G,IL15,ISG15,MX1,TLR3
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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