货号:WC-MRNA0018-H
产品介绍:
癌症是一种异质性疾病,具有多种生存机制,这些机制是由改变基因表达的累积突变引起的。癌症研究不断发现新的失调的致癌作用相关基因,阐明癌症进展或治疗逃避的新机制,并可能为药物开发开辟新途径。对这些基因表达的进一步研究可以确定它们如何以及何时失调,并可能发现癌症生长和进展背后的潜在机制。该阵列包括在致癌过程中失调的基因,包括那些涉及关键细胞生长途径(例如凋亡,DNA损伤修复,表观遗传学,生长因子和其他信号传导途径)的基因。
WCGENE®PCRArrayPlate操作简单。只需要将cDNA与qPCRmix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Cancer Drug Targets PCR Array plate
种 属:
HUMAN 货 号:
WC-MRNA0018-H
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
HUMAM
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
ABCC1
BCL2
CDK6
EGFR
FLT3
HDAC4
HSP90B1
MDM2
PARP2
PLK1
PTGS2
TXN
B
AKT1
BCL6
CDK7
ERBB2
FLT4
HDAC6
IGF1
MDM4
PARP4
PLK2
RHOA
TXNRD1
C
AKT2
BIRC5
CDK8
ERBB3
GRB2
HDAC7
IGF1R
MTOR
PDGFRA
PLK3
RHOB
KRAS
D
AKT3
CDC25A
CDK9
ERBB4
GSTP1
HDAC8
IGF2
NFKB1
PDGFRB
PLK4
TERT
PARP1
E
ATF2
CDK1
CTSB
ESR1
HDAC1
HIF1A
IRF5
NFKB2
PGR
PRKCA
TNKS
PIK3CA
F
AURKA
CDK2
CTSD
ESR2
HDAC11
HRAS
KDR
NRAS
PIK3C2A
PRKCB
TOP2A
PRKCE
G
AURKB
CDK4
CTSL
FIGF
HDAC2
HSP90AA1
KIT
NTN3
PIK3C3
PRKCD
TOP2B
TP53
H
AURKC
CDK5
CTSS
FLT1
HDAC3
HSP90AB1
ACTB
GAPDH
HPRT1
18s
NTC
NTC
基因分类(Human)
相关基因
细胞凋亡
BCL2,BIRC5.
PI3激酶和磷酸酶
MTOR,PIK3C2A,PIK3C3,PIK3CA.
生长因子和受体
EGFR,ERBB2,ERBB3,ERBB4,FLT1,FLT4,IGF1,IGF1R,IGF2,KDR,KIT,PDGFRA,PDGFRB,VEGFD
药物代谢
ABCC1,GSTP1,PTGS2,TXN,TXNRD1.
G蛋白信号
RHOA,RHOB
激素受体
ESR1,ESR2,PGR.
热休克蛋白
HSP90AA1,HSP90B1
受体酪氨酸激酶信号
AKT1,AKT2,GRB2.
组织蛋白酶类
CTSB,CTSD,CTSL,CTSS.
细胞周期
CDC25A,CDK1,CDK2,CDK4,CDK5,CDK7,CDK8,CDK9,MDM2,MDM4,TERT
拓扑异构酶,II型
TOP2A,TOP2B
转录因子
ATF2,HIF1A,IRF5,NFKB1,TP53
蛋白激酶类
AURKA,AURKB,AURKC,PLK1,PLK2,PLK3,PLK4,PRKCA,PRKCB,PRKCD,PRKCE
RAS信号
HRAS,KRAS,NRAS
组蛋白去乙酰化酶
HDAC1,HDAC11,HDAC2,HDAC3,HDAC4,HDAC6,HDAC7,HDAC8
聚ADP核糖聚合酶
PARP1,PARP2,PARP4,TNKS
结构蛋白质类
NTN3
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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