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细胞骨架调节因子PCR阵列-小鼠
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细胞骨架调节因子PCR阵列-小鼠

货号:WC-MRNA0037-M

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商品描述

货号:WC-MRNA0037-M


产品介绍:

构成细胞骨架的肌动蛋白丝(或微丝),中间丝和微管都具有许多调节机制,但各自具有独特的功能。微丝通过轴突,树突,丝状伪足,生长锥,片状伪足等突起调节细胞运动,迁移,大小和形状,

微绒毛,伪足和褶皱。肌动蛋白丝也有助于细胞-细胞和细胞-基质连接,胞质分裂,细胞质流动和肌肉收缩。中间丝似乎不仅与微丝共享作用,而且通过将细胞器锚定到位来排列三维细胞结构。微管的动力学,有丝分裂纺锤体的核心成分以及真核纤毛和鞭毛的轴突,在细胞分裂过程中控制着囊泡运输和染色体分离。由该阵列代表的细胞骨架调节基因包括钙调蛋白和钙调神经磷酸酶,激酶和磷酸酶,以及相关的ARF和RHO G蛋白家族成员及其关键调节因子。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

 

产品内容

品    名:

Cytoskeleton Regulators PCR Array plate

种    属:

MOUSE

货    号:

WC-MRNA0037-M

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

MOUSE

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Actr2

Arpc2

Cald1

Cdc42bpa

Cit

Cyfip2

Iqgap2

Mapre1

Nck1

Ppp1r12b

Rock1

Wasf1

B

Actr3

Arpc3

Calm1

Cdc42ep2

Clasp1

Diap1

Limk1

Mapre2

Nck2

Ppp3ca

Rock2

Wasl

C

Arap1

Arpc4

Calm2

Cdc42ep3

Clasp2

Dstn

Limk2

Mapt

Pak1

Ppp3cb

Ssh1

Mapk13

D

Arfip2

Arpc5

Calm3

Cdc42se1

Clip1

Ezr

Llgl1

Mark2

Pak4

Rac1

Ssh2

Mylk2

E

Arhgap6

Aurka

Cask

Cdk5

Clip2

Fnbp1l

Macf1

Mid1

Pfn2

Racgap1

Stmn1

Ppp1r12a

F

Arhgdib

Aurkb

Ccna1

Cdk5r1

Crk

Fscn2

Map3k11

Msn

Phldb2

Raf1

Tiam1

Rhoa

G

Arhgef11

Aurkc

Ccnb2

Cfl1

Cttn

Gsn

Map4

Mylk

Pikfyve

Rdx

Vasp

Was

H

Arpc1b

Baiap2

Cdc42

Cfl2

Cyfip1

Iqgap1

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Mouse)

相关基因

肌动蛋白丝

肌动蛋白丝相互作用蛋白

Actr2,Actr3,Arpc1b,Arpc2,Arpc3,Arpc4,Arpc5,Cald1,Cdc42ep3,Cfl1,Cyfip1,Cyfip2,Diaph1,Dstn,Ezr,Fscn2,Gsn,Iqgap2,Macf1,Pfn2,Rdx,Ssh1,Ssh2,Vasp,Wasf1,Wasl.

肌动蛋白丝组织与生物发生

Arap1,Arfip2,Arhgdib,Arhgef11,Arpc4,Cask,Cdc42,Cdc42bpa,Cfl1,Crk,Diaph1,Dstn,Ezr,Fscn2,Gsn,

Iqgap1,Limk1,Limk2,Nck1,Pfn2,Rdx,Rhoa,Rock1,Ssh1,Ssh2.

肌动蛋白聚合/解聚

Actr3,Arhgap6,Arpc1b,Arpc2,Arpc3,Arpc4,Arpc5,Cdc42ep2,Dstn,Fnbp1l,Gsn,Nck1,Nck2,Pfn2,Pikfyve,

Rac1,Was,Wasf1,Wasl

皮质细胞骨架

Arfip2,Clasp1,Cttn,Dstn,Ezr,Llgl1,Mapre1.

微管相互作用蛋白

Clasp1,Clasp2,Clip1,Clip2,Macf1,Map4,Mapre1,Mapre2,Mapt,Mid1,Racgap1,Stmn1

微管组织与生物发生

Clasp1,Mapt,Mid1,Phldb2,Stmn1.

微管聚合/解聚

Clasp1,Clasp2,Map4,Mapre1,Mapre2,Mapt,Stmn1.

主轴组织与生物发生

Aurka,Aurkb,Clasp1,Clasp2,Clip1,Mapre1,Racgap1.

细胞投影

轴突和树突

Baiap2,Cdk5,Cdk5r1,Cyfip1,Cyfip2,Mapt.

丝状伪足

Arap1,Baiap2,Cdc42,Cdk5,Ezr,Msn,Rdx.

生长锥

Cdk5,Cdk5r1,Mapt.

板状伪足

Actr3,Arfip2,Arpc5,Cdk5,Cttn,Cyfip1,Cyfip2,Nck1,Ppp1r12a,Ppp1r12b,Rac1,Rdx,Wasl

微绒毛

Ezr,Msn,Rdx.

伪足

Cdc42,Cdc42ep2

褶皱

Arfip2,Cttn,Cyfip1,Cyfip2,Ezr,Rac1,Rdx.

细胞形状、大小、极性和形态发生

Arap1,Arhgef11,Cdc42,Cdc42ep2,Cdc42ep3,Clasp1,Clasp2,Cyfip1,Cyfip2,Ezr,Llgl1,Mark2,Mylk2,Ssh1

细胞运动和迁移

Actr2,Actr3,Arap1,Arfip2,Arhgdib,Arhgef11,Arpc1b,Arpc2,Arpc3,Arpc5,Cald1,Cdk5,Cdk5r1,Dstn,Msn,Nck1,Pak4,Rac1,Rock1,Wasf1,Wasl.

细胞周期和细胞分裂

有丝分裂

Aurka,Aurkb,Ccna1,Ccnb2,Cit,Clasp1,Clasp2,Clip1,Mapre1,Mapre2

胞质分裂

Arhgef11,Aurkb,Aurkc,Dstn,Racgap1,Rock1

细胞骨架适配器活性

Baiap2,Msn,Nck1,Nck2,Pak1.

钙调素/钙调素

Cald1,Calm1,Cask,Iqgap1,Iqgap2,Mylk,Mylk2,Ppp3ca,Ppp3cb

G蛋白信号

Arap1,Arfip2,Arhgap6,Arhgdib,Arhgef11,Cdc42,Cdc42ep2,Cfl1,Cit,Cyfip1,Cyfip2,Diaph1,Iqgap1,Iqgap2,Limk1,Limk2,Mapk13 ,Rac1,Racgap1,Rhoa,Rock1,Tiam1,Was,Wasl.

激酶和磷酸酶

Aurka,Aurkb,Aurkc,Cask,Cdc42bpa,Cdk5,Cdk5r1,Cit,Limk1,Limk2,Map3k11,Mapk13,Mark2,Mylk,Mylk2,Pak1,Pak4,Ppp1r12a ,Ppp1r12b,Ppp3ca,Ppp3cb,Rock1,Ssh1,Ssh2.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.