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心脏毒性PCR 阵列-大鼠
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心脏毒性PCR 阵列-大鼠

货号:WC-MRNA0022-R

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商品描述

货号:WC-MRNA0022-R


产品介绍:

由于心血管安全问题,过去40年中近10%的药物已从全球临床市场撤出,这一事实使心脏成为毒理学研究的重要目标。鉴定心脏毒性药物和其他化合物是困难的,因为心脏反应背后的作用机制仍不清楚。然而,使用总体形态变化作为表型通常需要昂贵且耗时的慢性研究。在其他测量的毒性反应之前急性暴露时发生可量化的基因表达变化,并且它们的分析增强了该领域对这些效应的理解。该阵列包括来自在许多模型系统中使用各种药物和化学品的引用研究的心脏损伤的潜在生物标志物。通过分析这些基因的表达,减少实验时间和成本,可以在验证过程的早期从管道中识别和消除心脏毒性候选药物。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Cardiotoxicity PCR Array plate

种    属:

Rat

货    号:

WC-MRNA0022-R

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Rat

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Abhd2

Bcat1

Cfd

Egr1

Hspa2

Klhl41

Pla2g4a

Psmd7

Rps6kb1

Spp1

Uba5

Zfp148

B

Abra

Bgn

Ch25h

ERK

Hsph1

Mcm6

Plau

Pum2

S1pr2

Tcf4

Ubxn2a

Zfp612

C

Acta1

Bpifa1

Ckm

Fcgr2b

Ift20

MEK

Pln

Pvr

Serpine1

Tgfb2

Uck2

Psma2

D

Adra2a

Bsn

Col15a1

Fhl1

Igfbp5

Mt1a

Postn

RAF

SHP2

Thrap3

Ucp1

Rnd1

E

Aifm1

Btg2

Col3a1

Fosl1

Il6

Nexn

Ppbp

RAS

Sik1

Tiam1

Vcan

Sox4

F

Ak3

Ccl7

Crem

Gja1

Itpr2

Nfib

Ppp1r14c

Rbm3

Slc4a3

Timp1

Vegfa

Txnip

G

Ash1l

Ccr1

Csnk2a2

Gpm6a

Kcnj12

Pdk4

Prkab2

Reg3b

SOS

Tubb6

Vim

Wipi1

H

Atp5j

Cd14

Dusp8

Hamp

Klhl40

Pkn2

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Rat)

相关基因

 

 

心脏毒性上调

肌肉收缩

Klhl41.

血管生成

Il6,Plau,Serpine1,Tgfb2

信号转导

Abra,Adra2a,Ccr1,Crem,Il6,Rnd1,Sik1,Tgfb2,Tiam1.

细胞周期

Bcat1,Fosl1,Hspa2,Sik1,Tgfb2.

心肌细胞发育

Btg2,Crem,Egr1,Fhl1,Hspa2,Il6,Rnd1,Sik1,Spp1,Tgfb2,Tiam1,Timp1,Ucp1,Vcan.

代谢(调节和机制)

Abra,Adra2a,Btg2,Ch25h,Crem,Egr1,Fosl1,Il6,Pdk4,Pla2g4a,Pum2,Rbm3,Sik1,Tcf4,Tgfb2,Timp1.

细胞迁移和运动

Abhd2,Ccl7,Ccr1,Fosl1 ,Il6,Plau ,Ppbp,Pvr,Tgfb2.

其他基因在心脏毒性中上调

Bpifa1,Cd14,Cfd,Ckm,Fcgr2b,Gpm6a,Hamp,Klhl40,Mt1a,Reg3b,Tubb6,Uck2.

 

心脏毒性下调

肌肉收缩

Acta1,Gja1,Kcnj12,Rps6kb1.

血管生成

Col15a1,Postn,Vegfa

信号转导

Aifm1,Dusp8,Gja1 ,Igfbp5,Itpr2,Rps6kb1,S1pr2,Thrap3.

细胞周期

Csnk2a2,Mcm6,Psma2,Psmd7,Txnip.

心肌细胞发育

Acta1,Col15a1,Col3a1,Gja1 ,Igfbp5,Pln,Rps6kb1,Sox4 ,Txnip

代谢(调节和机制)

Ash1l,Atp5pf,Dusp8,Igfbp5,Mcm6,Nfib,Ppp1r14c,Prkab2,S1pr2,Sox4,Thrap3,Txnip,Zfp148,Zfp612

细胞迁移和运动

Igfbp5,Nexn,Rps6kb1

其他基因在心脏毒性中下调

Ak3,Bgn,Bsn,Hsph1,Ift20,Pkn2,Slc4a3,Uba5,Ubxn2a,Vim,Wipi1


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.