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细胞连接通路发现PCR 阵列-小鼠
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细胞连接通路发现PCR 阵列-小鼠

货号:WC-MRNA0026-M

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商品描述

货号:WC-MRNA0026-M




产品介绍:

      细胞连接是胞质膜局部区域特化形成的,通过膜蛋白、细胞骨架蛋白或者胞外基质形成的细胞与细胞之间、细胞与胞外基质之间的连接结构。细胞连接包括紧密连接、通讯连接、锚定连接。每个连接方式都发挥着特定的作用,紧密连接通过跨膜蛋白相连将相邻的上皮细胞封闭起来,防止可溶性物质的反渗,保证机体内环境的相对稳定。在相互接触的细胞之间建立连通讯接,允许无机离子、第二信使及水溶性小分子量的代谢物质从中通过,从而沟通细胞达到代谢与功能的统一。锚定连接通过连接肌动蛋白(粘着带,粘着斑)或通过中间纤维(桥粒,半桥粒)将细胞或细胞基质相连成一个有序的细胞群体,使细胞间、细胞与基质间具有抵抗机械张力的牢固粘合。

      细胞间连接的主要作用于加强细胞间的机械连接,及对细胞间的物质交换起到重要作用。本产品包含了90个关键细胞连接信号通路基因,包括主要的黏连分子,桥粒,半桥粒,紧密连接,间隙连接和粘附连接相关基因。

      WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品名:

Cell Junction PathwayFinder PCR Array plate

种属:

Mouse

货号:

WC-MRNA0026-M

规格:

96孔板

品牌:

WCGENE ® biotech

产品:

96孔引物预制板,封板膜,说明书

储存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

mouse

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Cav1

Cav2

Cav3

Cdh1

Cdh2

Cdx1

Cdx2

Cldn1

Cldn10

Cldn11

Cldn12

Cldn14

B

Cldn15

Cldn16

Cldn17

Cldn18

Cldn19

Cldn2

Cldn3

Cldn4

Cldn5

Cldn6

Cldn7

Cldn8

C

Cldn9

Dll1

Dsc1

Dsc2

Dsc3

Dsg1a

Dsg2

Dsg3

Dsg4

Dsp

Dst

Esam

D

F11r

Gja1

Gja3

Gja4

Gja5

Gja8

Gjb1

Gjb2

Gjb3

Gjb4

Gjb5

Gjb6

E

Gjc2

Gjd2

Gje1

Icam1

Icam2

Itga1

Itga2

Itga3

Itga4

Itga5

Itga6

Itga7

F

Itga8

Itga9

Itgal

Itgam

Itgav

Itgb1

Itgb2

Itgb3

Itgb4

Itgb5

Itgb6

Jam2

G

Jam3

Jup

Myl12a

Myl12b

Myl6b

Myl9

Notch1

Notch2

Notch3

Notch4

Ocln

Plec

H

Pvrl1

Pvrl2

Pvrl4

Tjp1

Tjp2

Tjp3

Actb

Gapdh

Hprt

B2m

NTC

NTC



基因分类(Mouse)

相关基因

黏着斑

Cav1,Cav2,Cav3,Itga1,Itga2,Itga3,Itga4 ,Itga5,Itga6,Itga7,Itga8,Itga9,Itgal,Itgam,Itgav,Itgb1,Itgb2,Itgb3,Itgb4,Itgb5,Itgb6.

紧密连接

Cldn1,Cldn10,Cldn11,Cldn12,Cldn14,Cldn15,Cldn16,Cldn17,Cldn18,Cldn19,Cldn2,Cldn3,Cldn4,Cldn5,Cldn6,Cldn7,Cldn8,

Cldn9,Esam,F11r,Icam1,Icam2,Jam2,Jam3,Ocln,Tjp1,Tjp2,Tjp3.

间隙连接

Gja1 ,Gja3,Gja4,Gja5,Gja8,Gjb1 ,Gjb2 ,Gjb3,Gjb4,Gjb5,Gjb6,Gjc2,Gjd2,Gje1.

黏着连接

Cdh1 ,Cdh2 ,Dll1 ,Nectin1,Nectin2,Nectin3,Nectin4,Notch1,Notch2,Notch3,Notch4.

桥粒

Dsc1,Dsc2,Dsc3,Dsg1a,Dsg2,Dsg3,Dsg4,Dsp,Jup.

半桥粒

Dst,Plec.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.