货号:WC-MRNA0036-R
产品介绍:
这些基因在囊性纤维化(CF)期间差异表达或与囊性纤维化跨膜传导调节器(CFTR)相互作用。CF是一种由CFTR基因突变引起的常染色体隐性疾病,CFTR是一种在上皮细胞中表达的氯通道。CFTR突变导致消化系统和呼吸系统失调。目前的医学疗法成功地治疗了CF患者的消化系统疾病。因此,大多数研究集中于CF肺病理学,其在患者生命中逐渐恶化。积极的医疗治疗使CF患者的平均寿命延长至40岁。CF患者表现出不同程度的支气管粘液增厚和中性粒细胞活化,尽管导致这些表型的确切分子机制尚不清楚。这些患者还患有慢性肺部炎症,可导致纤维化和肺功能降低。这种炎症可能是由于CF患者患有多种感染,尽管一些研究表明,即使在没有肺部感染的情况下,也会发生炎症。不同的CFTR突变具有不同的功能后果,如活性降低或蛋白质错误折叠。然而,CF患者表型的全谱被认为是通过额外的修饰基因发生的,这些修饰基因可能因患者而异,并在CFTR功能的分子机制中发挥作用。该阵列所代表的修饰基因包括离子转运蛋白、参与免疫或炎症反应的基因以及与CFTR功能的确切关系未知的基因。
WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Cystic Fibrosis PCR Array plate
种 属:
Rat 货 号:
WC-MRNA0036-R
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
Rat
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
Ace
Ccl5
Cxcr2
Epsti1
Hspa4
Il6
Mbl2
Pdzk1
S100a8
Slc9a3r2
Tgfb3
Tnfsf10
B
Adipor2
Cftr
Cxcr4
Ezr
Hsph1
Il7r
Met
Pla2g5
S100a9
Slpi
Tjp1
Vcp
C
Adk
Clu
Defb1
Fas
Icam1
Itga2
Msra
Ppp2r4
Scnn1b
Snap23
Tlr2
Nr4a2
D
Adrb2
Cxcl1
Dnaja1
Gclc
Ifrd1
Itgb2
Nfkb1
Prkaa1
Scnn1g
Stx1a
Tlr4
Ptgs2
E
Alox12b
Cxcl2
Dnajc5
Gopc
Igfbp5
Kcne1
Nfkbia
Prkaa2
Serpina1
Stx8
Tlr5
Slc9a3r1
F
Calr
Cxcl3
Dusp1
Gstm2
Il10
Kit
Nme1
Prkce
Sftpb
Tcf7l2
Tnf
Tgfb2
G
Canx
Cxcl5
Edn1
Hsp90aa1
Il1a
Lcn2
Nos3
Prtn3
Slc26a3
Tgfb1
Tnfrsf11a
Tnfrsf1a
H
Ccl12
Cxcl9
Ednra
Hspa1b
Il1b
Mapk1
ACTB
GAPDH
HPRT1
18s
NTC
NTC
基因分类(Rat)
相关基因
囊性纤维化修饰基因
Adipor2,Adrb2,Ednra,Gclc,Gstm2,Ifrd1,Mbl2,Msra,Nos3 ,Scnn1b,Scnn1g,Serpina1,Tcf7l2,Tgfb1,Tnf,Tnfrsf1a
CTFR互动程序
Canx,Cftr,Dnaja1,Dnajc5,Ezr,Gopc,Hsp90aa1,Hspa4 ,Nme1,Pdzk1,Prkaa1,Prkaa2,Ptpa,Slc26a3,Slc9a3r1,Slc9a3r2,Snap23,
Stx1a,Stx8,Tgfb1,Tjp1,Vcp
中性粒细胞趋化
Ccl12,Cxcr2,Edn1,Ednra,Il1b,Itgb2.
炎症反应
Ace,Adrb2,Alox12b,Ccl12,Ccl5,Cxcl1,Cxcl3,Cxcr4,Defb1,Ednra,Il10,Il1b,Il6,Itgb2,Mbl2,Nfkb1,Pla2g5,Ptgs2,S100a8,S100a9,
Serpina1,Tgfb1,Tlr2,Tlr4,Tlr5,Tnf,Tnfrsf11a ,Tnfrsf1a.
免疫应答
先天免疫
Ccl12,Ccl5,Clu,Defb1,Icam1,Lcn2,Mapk1,Mbl2,Nfkb1,Nfkbia,Prkce,Tgfb1,Tlr2,Tlr4,Tlr5,Tnfsf10
获得性免疫
Clu,Fas,Icam1,Il10,Il1b,Il7r,Mbl2 ,Tgfb1,Tlr4,Tnf,Tnfrsf11a
未折叠蛋白反应
Calr,Dnaja1,Hsp90aa1,Hspa1b,Hspa4,Hsph1,Vcp
离子结合和传输
Adk,Kcne1,Nr4a2,Scnn1b,Scnn1g,Slc9a3r1
氧化应激
Clu,Dusp1,Gclc,Il6,Lcn2,Mbl2,Msra,Nos3,Ptgs2,Sftpb
其他囊性纤维化基因
Epsti1,Igfbp5,Itga2,Kit ,Met,Prtn3,Slpi.
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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