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上皮间质转化(EMT)PCR 阵列-人
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上皮间质转化(EMT)PCR 阵列-人

货号:WC-MRNA0053-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0053-H




产品介绍:

      上皮-间充质转化(EMT)是一个过程,在此过程中,细胞失去其上皮特征,并获得间充质特性,如运动性增加。在结直肠癌(CRC)中,EMT与侵袭或转移表型相关。在EMT过程中,肿瘤细胞经历紧密连接溶解、顶端-基底极性的破坏和细胞骨架结构的重组,使细胞形成侵袭性表型。在癌细胞中,EMT受到来自肿瘤微环境的细胞外刺激(包括生长因子和炎性细胞因子)以及肿瘤内物理应激(如缺氧)的异常调节。因此,EMT编程允许肿瘤细胞适应人类肿瘤微环境的不断变化,从而成功转移。

      WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT) PCR Array plate

种    属:

Human

货    号:

WC-MRNA0053-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

AHNAK

CAV1

CTNNB1

F11R

GSK3B

KRT19

MST1R

PTK2

SNAI3

TCF7L1

TMEFF1

WNT5A

B

AKT1

CAV2

DDR1

FGFBP1

IGFBP4

KRT7

CDH2

PTP4A1

SOX10

TFPI2

TMEM132A

WNT5B

C

BMP1

CCND2

DESI1

FN1

IL1RN

MAP1B

NODAL

RAC1

SPARC

TGFB1

TSPAN13

PLEK2

D

BMP2

KRT14

DSC2

FOXC2

ILK

MITF

NOTCH1

RGS2

SPP1

TGFB2

TWIST1

SNAI1

E

BMP7

COL1A2

DSP

FZD7

ITGA5

MMP2

NUDT13

SERPINE1

STAT3

TGFB3

VCAN

TCF4

F

CDH1

COL3A1

EGFR

GEMIN2

ITGAV

MMP3

OCLN

SNAI2

STEAP1

THBS1

VIM

TIMP1

G

CALD1

COL5A1

ERBB3

GNG11

ITGB1

MMP9

PDGFRB

SMAD2

TCF3

THBS2

VPS13A

WNT11

H

CAMK2N1

COL5A2

ESR1

GSC

JAG1

MSN

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


基因分类(Human)

相关基因

上皮向间充质转化过程中上调

AHNAK、BMP1、CALD1、CAMK2N1、CDH2、COL1A2、COL3A1、COL5A2、FN1、FOXC2、GNG11、GSC、IGFBP4、ITGA5、ITGAV、MMP2、MMP3、MMP9、MSN、SERPINE1、SNAI1、SNAI2、SNAI3、SOX10、SPARC、STEAP1、TCF4、TIMP1、TMEFF1、TMEM132A、TWIST1、VCAN、VIM、VPS13A、WNT5A、WNT5B。 

上皮向间充质转化过程中下调

CAV2、CDH1、DESI1、DSP、FGFBP1、IL1RN、KRT19、MST1R、NUDT13、OCLN、RGS2、SPP1、TFPI2、TSPAN13。 

差异化与发展

细胞形态发生

AKT1、BMP1、BMP2、BMP7、COL3A1、COL5A2、CTNNB1、DSP、ERBB3、F11R、FOXC2、FZD7、GSC、JAG1、KRT14、MST1R、NODAL、NOTCH1、PTP4A1、SMAD2、SNAI1、SNAI2、SOX10、TGFB2、TGFB3、TMEFF1、TWIST1、VCAN、WNT11、WNT5A、WNT5B。细胞形态发生CTNNB1、FOXC2、JAG1、RAC1、SMAD2、SNAI1、SOX10、TGFB1、TGFB2、TGFB3、TWIST1、WNT11、WNT5A

细胞生长与增殖

AKT1、BMP1、BMP7、CAV2、CTNNB1、EGFR、ERBB3、FGFBP1、FOXC2、IGFBP4、ILK、JAG1、MST1R、

NODAL、PDGFRB、TGFB1、TGFB2、TGFB3、TIMP1、VCAN、ZEB1。

细胞迁移和运动

CALD1、CAV2、EGFR、FN1、ITGB1、JAG1、MSN、MST1R、NODAL、PDGFRB、RAC1、STAT3、TGFB1、VIM

细胞骨架调节因子

CAV2、KRT7、MAP1B、PLEK2、RAC1、VIM。

细胞外基质和细胞粘附分子

BMP1、BMP7、CDH1、CDH2、COL1A2、COL3A1、COL5A2、CTNNB1、DSC2、EGFR、ERBB3、F11R、FN1、FOXC2、ILK、ITGA5、ITGAV、ITGB1、MMP2、MMP3、MMP9、PTK2、RAC1、SERPINE1、SPP1、TGFB1、TGFB2、TIMP1、VCAN 

雌激素受体信号

CAV2、ESR1、KRT19、TGFB3。 

G蛋白偶联受体信号传导

AKT1、FZD7、GNG11、RAC1、RGS2。

整合素介导的信号传导

COL3A1、ILK、ITGA5、ITGAV、ITGB1、PTK2。

槽口信号

FoxC2、JAG1、NOTCH1。

受体酪氨酸激酶信号

EGFR(ERBB1),ERBB3,PDGFRB,RGS2,SPARC。

TGFβ/BMP信号

TGFβ/BMP信号BMP1、BMP2、BMP7、COL3A1、SMAD2(MADH2)、TGFB1、TGFB2、TGFB3。

WNT信号

CTNNB1、FZD7、GSK3B、WNT11、WNT5A、WNT5B。

转录因子

CTNNB1、ESR1(ERα)、FOXC2、GEMIN2、GSC、NOTCH1、SMAD2(MADH2)、SNAI2、SNAI3、SOX10、STAT3、TCF3、TCF4、TWIST1、ZEB1、

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.