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细胞外基质与黏附分子PCR 阵列-人
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细胞外基质与黏附分子PCR 阵列-人

货号:WC-MRNA0057-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0057-H


产品介绍:

细胞通过细胞表面上的粘附分子附着到细胞外基质(ECM)基质中的蛋白聚糖和糖蛋白(如纤维连接蛋白、层粘连蛋白和胶原),以定义组织形状、结构和功能。与其他细胞和ECM建立和断开细胞接触在细胞生长、分裂、分化和迁移等正常过程中起着关键作用。疾病状态(转移、类风湿性关节炎、心血管和中枢神经系统疾病)和病理生理过程(伤口愈合和炎症)也涉及ECM重塑和细胞表面表达的细胞粘附分子种类的变化。

该阵列包含ECM蛋白质,包括基膜成分、胶原和其他定义ECM结构的基因。还包括重塑ECM的基质和其他金属蛋白酶及其抑制剂。此外该阵列还代表整合素、选择素、细胞粘附分子家族成员(ICAM、ECAM、NCAM、PECAM和VCAM),以及对细胞粘附和细胞骨架桥接重要的其他基因,如连环素。使用实时

WCGENE®PCRArrayPlate操作简单。只需要将cDNA与qPCRmix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Extracellular Matrix & Adhesion Molecules PCR Array plate

种    属:

Human

货    号:

WC-MRNA0057-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

ADAMTS1

ADAMTS13

ADAMTS8

CD44

CDH1

CLEC3B

CNTN1

COL11A1

COL12A1

COL14A1

COL15A1

COL16A1

B

COL1A1

COL4A2

COL5A1

COL6A1

COL6A2

COL7A1

COL8A1

CTGF

CTNNA1

CTNNB1

CTNND1

CTNND2

C

ECM1

FN1

HAS1

HMBS

ICAM1

ITGA1

ITGA2

ITGA3

ITGA4

ITGA5

ITGA6

ITGA7

D

ITGA8

ITGAL

ITGAM

ITGAV

ITGB1

ITGB2

ITGB3

ITGB4

ITGB5

KAL1

LAMA1

LAMA2

E

LAMA3

LAMB1

LAMB3

LAMC1

MMP1

MMP10

MMP11

MMP12

MMP13

MMP14

MMP15

MMP16

F

MMP2

MMP3

MMP7

MMP8

MMP9

NCAM1

PECAM1

PGK1

PPIA

RPLP0

SELE

SELL

G

SELP

SGCE

SPARC

SPG7

SPP1

TBP

TGFBI

THBS1

THBS2

THBS3

TIMP1

TIMP2

H

TIMP3

TNC

UBC

VCAM1

VCAN

VTN

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


基因分类(Human)

相关基因

细胞粘附分子

跨膜受体

CD44 , CDH1 , HAS1 , ICAM1 , ITGA1 , ITGA2 , ITGA3 , ITGA4 , ITGA5 , ITGA6 , ITGA7 , ITGA8 , ITGAL , ITGAM , ITGAV , ITGB1 , ITGB2 , ITGB3 , ITGB4 , ITGB5 , MMP14 , MMP15 , MMP16 , NCAM1 , PECAM1 , SELE , SELL , SELP , SGCE , SPG7 , VCAM1

细胞间粘附

CD44 , CDH1, COL11A1 , COL14A1 , COL6A2 , CTNND1 , ICAM1 , ITGA8 , VCAM1

细胞外基质(ECM)粘附

ADAMTS13 , CD44 , ITGA1 , ITGA2 , ITGA3 , ITGA4, ITGA5 , ITGA6 , ITGA7 , ITGA8 , ITGAL , ITGAM , ITGAV , ITGB1 , ITGB2 , ITGB3 , ITGB4 , ITGB5 , SGCE , SPP1 , THBS3 .

其他细胞粘附分子

ANOS1 , CCN2 , CLEC3B , CNTN1 , COL12A1 , COL15A1 , COL16A1 , COL5A1 , COL6A1 , COL7A1 , COL8A1 , CTNNA1 , CTNNB1 , CTNND2 , FN1 , LAMA1 , LAMA2 , LAMA3 , LAMB1 , LAMB3 , LAMC1 , THBS1 , THBS2 , TNC , VCAN , VTN

细胞外基质(ECM)分子

基膜成分

COL4A2 , COL7A1 , LAMA1 , LAMA2 , LAMA3 , LAMB1 , LAMB3 , LAMC1 , SPARC

胶原蛋白和ECM结构成分

ANOS1 , COL11A1 , COL12A1 , COL14A1 , COL15A1 , COL16A1 , COL1A1 , COL4A2 , COL5A1 , COL6A1 , COL6A2 , COL7A1 , COL8A1 , FN1

细胞外基质(ECM)蛋白酶

ADAMTS1 , ADAMTS13 , ADAMTS8 , MMP1 , MMP10 , MMP11 , MMP12 , MMP13 , MMP14 , MMP15 , MMP16 , MMP2 , MMP3 , MMP7 , MMP8 , MMP9 , SPG7 , TIMP1 .

细胞外基质(ECM)蛋白酶抑制剂

ANOS1 , COL7A1 , THBS1, TIMP1 , TIMP2 , TIMP3

其他细胞外基质

CCN2 , CLEC3B , ECM1 , HAS1 , SPP1 , TGFBI , THBS2 , THBS3 , TNC , VCAN , VTN


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.