货号:WC-MRNA0064-H
产品介绍:
肾上腺皮质分泌的糖皮质激素会影响多种生物学过程,从抑制炎症到维持正常血糖水平等等。当糖皮质激素受体与细胞渗透性激素结合时发生信号传导、易位、与其他共转录因子的相互作用(表明与其他途径的相互作用)以及靶基因表达的激活或抑制。糖皮质激素(如常用的强的松、地塞米松或氢化可的松)的治疗应用有助于治疗各种疾病,包括过敏、哮喘、自身免疫性疾病、皮炎、白血病、淋巴瘤和类风湿性关节炎。它们的免疫抑制活性也有助于防止急性移植排斥反应以及移植物抗宿主病。耐药性和副作用(如对感染的敏感性和组织修复过程的抑制)限制了这些药物的长期使用,但也刺激了对开发更安全的糖皮质激素类似物的研究。检查糖皮质激素的转录反应有助于更好地理解它们对任何靶组织中生物学过程的影响。该阵列包括糖皮质激素受体和关键共转录因子,但大多数靶基因是通过同时使用染色质免疫沉淀(ChIP)和两个关键反应组织(脂肪和肺)中的基因表达进行的研究确定的。
WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Glucocorticoid Signaling PCR Array plate
种 属:
Human 货 号:
WC-MRNA0064-H
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
Human
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
ADARB1
ASPH
CREB1
EDN1
GLUL
IL10
MT1E
PER2
RHOB
SLC22A5
TNFAIP3
ZHX3
B
AFF1
ATF4
CREB3
EHD3
Gmeb1
IL1RN
MT2A
PIK3R1
RHOJ
SNTA1
TSC22D3
ZNF281
C
AK2
BCL6
CREB3L4
ERRFI1
Gmeb2
IL6
NFKBIA
PLD1
SESN1
SPHK1
USP2
PER1
D
AMPD3
BMPER
CTGF
FKBP5
GOT1
IL6R
NR3C1
PLEKHF1
SGK1
SPSB1
USP54
RGS2
E
ANGPTL4
CALCR
CYB561
FOSL2
Gpr83
KLF13
PDCD7
POU2F1
SGK2
STAT5A
VDR
SLC19A2
F
ANXA4
CEBPA
DDIT4
GDPD1
H6PD
KLF9
PDGFRB
POU2F2
SGK3
STAT5B
VLDLR
TNF
G
AQP1
CEBPB
DIRAS2
GHRHR
HAS2
LOX
PDP1
RASA3
SLC10A6
TBL1XR1
XDH
ZFP36
H
ARID5B
COL4A2
DUSP1
Glcci1
HNRNPLL
MERTK
ACTB
GAPDH
HPRT1
18s
NTC
NTC
基因分类(Human)
相关基因
糖皮质激素受体和共转录因子
ATF4,CEBPA,CEBPB,CREB1,CREB3,CREB3L4,NR3C1 (GRL),POU2F1,POU2F2,STAT5A,STAT5B.
葡萄糖和脂肪酸代谢
ASPH,GDPD1,GLUL,GOT1,H6PD,PDP1.
细胞因子和趋化因子
EDN1,IL10,IL1RN,IL6,IL6R,TNF.
增长因素
ANGPTL4,CCN2.
细胞外基质
COL4A2,HAS2,LOX.
细胞骨架调节剂
PLEKHF1,RHOB,RHOJ,SNTA1.
内吞作用和胞吐作用
ANXA4,EHD3,MERTK,PLEKHF1.
细胞表面受体
CALCR,GHRHR,PDGFRB,VLDLR.
渠道和运输商
AQP1,SLC10A6,SLC19A2,SLC22A5.
信号转导
BMPER,DIRAS2,DUSP1,NFKBIA ,PIK3R1,PLD1,RASA3,RGS2,SESN1,SGK1,SPHK1,TNF,USP2.
应激反应
BCL6,DDIT4,PDCD7,SESN1,SGK1.
转录因子
ARID5B,CEBPB,FOSL2,KLF13,KLF9,NFKBIA ,TBL1XR1,TNFAIP3,TSC22D3,VDR,ZFP36,ZHX3.
昼夜节律
PER1,PER2.
RNA加工
ADARB1,AFF1,HNRNPLL.
蛋白质折叠和运输
FKBP5,LOX.
金属螯合蛋白
MT1E,MT2A.
核苷酸代谢
AK2,AMPD3,XDH.
其他糖皮质激素受体靶基因
CYB561,ERRFI1,SPSB1,USP54,ZNF281.
脂肪和肌肉组织中的上调
ADARB1,AFF1,AMPD3,ANXA4,ARID5B,ASPH,BMPER,DDIT4,DUSP1,EHD3,ERRFI1,FKBP5,GDPD1,GLUL,H6PD,HNRNPLL,KLF13,LOX,MERTK,PDP1,PER1,PER2,PIK3R1,PLD1,PLEKHF1,RASA3,RGS2,RHOJ,SESN1,SGK1,SLC10A6,SNTA1,SPHK1,SPSB1,TBL1XR1,TSC22D3,USP2,USP54,VDR,VLDLR,XDH,ZFP36,ZHX3.
肌肉组织中的上调
CCN2,CEBPB,COL4A2,CYB561,DIRAS2,EDN1,KLF9.
肌肉组织中的上调
ANGPTL4,BCL6,FOSL2,NFKBIA ,RHOB,SLC19A2,SLC22A5,TNFAIP3.
脂肪组织下调
AK2,DIRAS2,HAS2,PDGFRB.
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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