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糖皮质激素信号PCR 阵列-人
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糖皮质激素信号PCR 阵列-人

货号:WC-MRNA0064-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0064-H


产品介绍:

肾上腺皮质分泌的糖皮质激素会影响多种生物学过程,从抑制炎症到维持正常血糖水平等等。当糖皮质激素受体与细胞渗透性激素结合时发生信号传导、易位、与其他共转录因子的相互作用(表明与其他途径的相互作用)以及靶基因表达的激活或抑制。糖皮质激素(如常用的强的松、地塞米松或氢化可的松)的治疗应用有助于治疗各种疾病,包括过敏、哮喘、自身免疫性疾病、皮炎、白血病、淋巴瘤和类风湿性关节炎。它们的免疫抑制活性也有助于防止急性移植排斥反应以及移植物抗宿主病。耐药性和副作用(如对感染的敏感性和组织修复过程的抑制)限制了这些药物的长期使用,但也刺激了对开发更安全的糖皮质激素类似物的研究。检查糖皮质激素的转录反应有助于更好地理解它们对任何靶组织中生物学过程的影响。该阵列包括糖皮质激素受体和关键共转录因子,但大多数靶基因是通过同时使用染色质免疫沉淀(ChIP)和两个关键反应组织(脂肪和肺)中的基因表达进行的研究确定的。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

 

产品内容

品    名:

Glucocorticoid Signaling PCR Array plate

种    属:

Human

货    号:

WC-MRNA0064-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

ADARB1

ASPH

CREB1

EDN1

GLUL

IL10

MT1E

PER2

RHOB

SLC22A5

TNFAIP3

ZHX3

B

AFF1

ATF4

CREB3

EHD3

Gmeb1

IL1RN

MT2A

PIK3R1

RHOJ

SNTA1

TSC22D3

ZNF281

C

AK2

BCL6

CREB3L4

ERRFI1

Gmeb2

IL6

NFKBIA

PLD1

SESN1

SPHK1

USP2

PER1

D

AMPD3

BMPER

CTGF

FKBP5

GOT1

IL6R

NR3C1

PLEKHF1

SGK1

SPSB1

USP54

RGS2

E

ANGPTL4

CALCR

CYB561

FOSL2

Gpr83

KLF13

PDCD7

POU2F1

SGK2

STAT5A

VDR

SLC19A2

F

ANXA4

CEBPA

DDIT4

GDPD1

H6PD

KLF9

PDGFRB

POU2F2

SGK3

STAT5B

VLDLR

TNF

G

AQP1

CEBPB

DIRAS2

GHRHR

HAS2

LOX

PDP1

RASA3

SLC10A6

TBL1XR1

XDH

ZFP36

H

ARID5B

COL4A2

DUSP1

Glcci1

HNRNPLL

MERTK

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Human)

相关基因

糖皮质激素受体和共转录因子

ATF4,CEBPA,CEBPB,CREB1,CREB3,CREB3L4,NR3C1 (GRL),POU2F1,POU2F2,STAT5A,STAT5B.

葡萄糖和脂肪酸代谢

ASPH,GDPD1,GLUL,GOT1,H6PD,PDP1.

细胞因子和趋化因子

EDN1,IL10,IL1RN,IL6,IL6R,TNF.

增长因素

ANGPTL4,CCN2.

细胞外基质

COL4A2,HAS2,LOX.

细胞骨架调节剂

PLEKHF1,RHOB,RHOJ,SNTA1.

内吞作用和胞吐作用

ANXA4,EHD3,MERTK,PLEKHF1.

细胞表面受体

CALCR,GHRHR,PDGFRB,VLDLR.

渠道和运输商

AQP1,SLC10A6,SLC19A2,SLC22A5.

信号转导

BMPER,DIRAS2,DUSP1,NFKBIA ,PIK3R1,PLD1,RASA3,RGS2,SESN1,SGK1,SPHK1,TNF,USP2.

应激反应

BCL6,DDIT4,PDCD7,SESN1,SGK1.

转录因子

ARID5B,CEBPB,FOSL2,KLF13,KLF9,NFKBIA ,TBL1XR1,TNFAIP3,TSC22D3,VDR,ZFP36,ZHX3.

昼夜节律

PER1,PER2.

RNA加工

ADARB1,AFF1,HNRNPLL.

蛋白质折叠和运输

FKBP5,LOX.

金属螯合蛋白

MT1E,MT2A.

核苷酸代谢

AK2,AMPD3,XDH.

其他糖皮质激素受体靶基因

CYB561,ERRFI1,SPSB1,USP54,ZNF281.

脂肪和肌肉组织中的上调

 

ADARB1,AFF1,AMPD3,ANXA4,ARID5B,ASPH,BMPER,DDIT4,DUSP1,EHD3,ERRFI1,FKBP5,GDPD1,GLUL,H6PD,HNRNPLL,KLF13,LOX,MERTK,PDP1,PER1,PER2,PIK3R1,PLD1,PLEKHF1,RASA3,RGS2,RHOJ,SESN1,SGK1,SLC10A6,SNTA1,SPHK1,SPSB1,TBL1XR1,TSC22D3,USP2,USP54,VDR,VLDLR,XDH,ZFP36,ZHX3.

肌肉组织中的上调

CCN2,CEBPB,COL4A2,CYB561,DIRAS2,EDN1,KLF9.

肌肉组织中的上调

ANGPTL4,BCL6,FOSL2,NFKBIA ,RHOB,SLC19A2,SLC22A5,TNFAIP3.

脂肪组织下调

AK2,DIRAS2,HAS2,PDGFRB.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.