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WNT信号PCR 阵列-人
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WNT信号PCR 阵列-人

货号:WC-MRNA0262-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0262-H





产品介绍:

      Wnt蛋白是许多不同物种和器官中基本发育过程所需的分泌形态发生素,至少存在三种不同的Wnt途径:经典途径、平面细胞极性(PCP)途径和Wnt/Ca2+途径。在经典Wnt通路中,Wnt配体与其受体结合的主要作用是通过抑制β-连环蛋白降解复合物来稳定细胞质β-连环蛋白。然后,β-连环蛋白可以自由进入细胞核并通过其与TCF(T细胞因子)家族转录因子的相互作用以及伴随的辅激活因子募集来激活Wnt调节基因。平面细胞极性(PCP)信号传导导致小GTP酶RHOA和RAC1的激活,从而激活应激激酶JNK和ROCK并导致细胞骨架的重塑和细胞粘附和运动的变化。WNT-Ca2+信号通过G蛋白和磷脂酶介导,导致细胞质游离钙的瞬时增加,随后激活激酶PKC和CAMKII和磷酸酶钙调神经磷酸酶。

      沃吉基因Wnt信号PCR阵列包含三种途径的 WNT 信号配体和受体以及其他下游信号分子,还包括 WNT 信号调节基因以及下游靶基因的关键90个基因。

      WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

WNT Signaling PCR Array plate

种    属:

Human

货    号:

WC-MRNA0262-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

AES

CCND1

CXADR

DVL1

FRAT1

GSK3A

MAPK8

NKD1

RHOA

TCF7

WNT2B

WNT8A

B

APC

CCND2

CXXC4

DVL2

FRZB

GSK3B

MMP7

NLK

RHOU

TCF7L1

WNT3

WNT9A

C

AXIN1

CHSY1

CYP4V2

EP300

FZD1

HSPA12A

MT1A

PITX2

RUVBL1

TLE1

WNT3A

PYGO1

D

AXIN2

CSNK1A1

DAAM1

FBXW11

FZD2

JUN

MTFP1

PORCN

SFRP1

VANGL2

WNT4

NFATC1

E

BCL9

CSNK2A1

DAB2

FBXW4

FZD3

KREMEN1

MTSS1

PPARD

SFRP4

WIF1

WNT5A

TBP

F

BOD1

CTBP1

DIXDC1

FGF4

FZD4

LEF1

MYC

PRICKLE1

SKP2

WISP1

WNT5B

WNT2

G

BTRC

CTNNB1

DKK1

FOSL1

FZD5

LRP5

NAV2

PRMT6

SOX17

WNT10A

WNT7A

WNT7B

H

CALM1

CTNNBIP1

DKK3

FOXN1

FZD6

LRP6

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


基因分类(human)

                                 相关基因

经典wnt信号通路

APC,AXIN1,AXIN2,AES,CSNK1A1,CSNK2A1,CTBP1,CTNNB1,CTNNBIP1 ,CXXC4,DKK1,DKK3,DVL1,DVL2,DIXDC1,EP300,

FRAT1,FZD1,FZD2,FZD3,FZD4,FZD5,FZD6,GSK3A,GSK3B,LEF1,LRP5,LRP6,NKD1,PORCN,PYGO1,RUVBL1,SFRP1,

SFRP4,SKP2,SOX17,TCF7,TCF7L1,WIF1,WNT1,WNT10A,WNT2,WNT2B,WNT3,WNT3A,WNT4,WNT6,WNT7A,WNT7B,WNT8A

平面细胞极性(PCP)途径

DAAM1,DVL1,DVL2,MAPK8 ,NKD1,PRICKLE1,RHOA,RHOU,VANGL2,WNT9A

Wnt/Ca2+途径

FZD2,NFATC1,WNT1,WNT10A,WNT2,WNT2B,WNT3,WNT3A,WNT4,WNT5A,WNT5B,WNT6,WNT7A,WNT7B,WNT8A,WNT9A

WNT 信号负调控

APC,AXIN1,AXIN2,BTRC ,CCND1,CTBP1,CTNNBIP1 ,DKK1,DKK3,FBXW4,FBXW11,FRZB ,KREMEN1,LRP6,NKD1,NLK,SFRP1,

SFRP4,SOX17,WIF1

WNT 信号转导靶基因

AXIN2,BTRC ,CCN4,CCND1,CCND2,DAB2,FOSL1 ,JUN,MMP7,MYC,PITX2,PPARD,TLE1

细胞迁移

APC,DKK1,LRP5,LRP6,RHOA,WNT1

细胞周期

APC,BTRC ,CCND1,CCND2,CTNNB1,EP300,FOSL1 ,JUN,MYC,RHOA,RUVBL1,TCF7L1

细胞稳态

APC,FZD2,JUN,MYC

途径活性特征基因

BOD1,CALM1,CCND1,CCND2,CHSY1,CXADR,CYP4V2,HSPA12A,LEF1,MT1A,MTFP1,MTSS1,MYC,NAV2,PRMT6,SKP2

细胞发展过程

CTNNB1,DKK1,WNT1,WNT3,WNT3A,AXIN2,FZD2,FZD3,FZD5,FZD6,VANGL2,APC,CCN4,CCND1,CCND2,CTBP1,CTNNBIP1 ,

DAB2,EP300,FGF4,FOSL1 ,JUN,LRP5,MMP7,MYC,PPARD


Wnt Signaling通路图

图片来源于:https://www.genome.jp/pathway/map04310


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.