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胰腺癌PCR 阵列-人
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胰腺癌PCR 阵列-人

货号:WC-MRNA0192-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0192-H


产品介绍

      浸润性导管腺癌是胰腺最常见的恶性肿瘤。当大多数研究人员使用术语“胰腺癌症”时,他们指的是胰腺导管腺癌(PDA)。正常导管上皮通过一系列组织学定义的前体细胞(PanINs)向浸润性癌症发展。HER-2/neu的过度表达和K-ras基因中的激活点突变发生得早,p16基因的失活处于中间阶段,p53、SMAD4和BRCA2的失活发生得相对较晚。激活的K-ras参与多种效应通路。尽管EGF受体通常被认为是RAS蛋白的上游激活剂,但它们也可以通过RAS诱导的EGFR家族配体的自分泌激活来充当RAS信号转导子。此外,PDA表现出广泛的基因组不稳定性和非整倍性。端粒损耗和p53和BRCA2的突变可能是导致这些表型的原因。SMAD4肿瘤抑制基因的失活导致转化生长因子β信号通路的抑制作用丧失。

      WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

产品内容

品    名:

Pancreatic Adenocarcinoma PCR Array plate

种    属:

Human

货    号:

WC-MRNA0192-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

AKT1

AKT2

AKT3

BCL2

BCL2L1

BIRC5

BRAF

BRCA2

CCNA2

CCNB1

CCND1

CCND2

B

CCNE1

CCNE2

CDC42

CDK2

CDK4

CDKN1A

CDKN1B

CDKN2A

CDKN2B

CDKN2C

CDKN2D

CYP2E1

C

E2F1

E2F3

E2F4

EGF

EGFR

ELK1

ERBB2

FIGF

GRB2

HBEGF

HSP90AA1

IGF1

D

IL6

JAK1

JAK2

JAK3

KDR

KIT

KRAS

MAP2K1

MAP2K2

MAPK1

MAPK3

MDM2

E

MMP1

MMP2

MMP3

MMP7

MMP9

NFKB1

NFKB2

NOTCH1

PIK3CA

PIK3CB

PIK3CD

PIK3R1

F

PIK3R2

PTGS2

RAC1

RAC2

RAF1

RB1

REL

RELA

RELB

RHOA

RHOB

SMAD2

G

SMAD3

SMAD4

SOS1

STAT1

STAT2

STAT3

STAT5B

STAT6

TGFA

TGFB1

TGFB2

TGFB3

H

TGFBR1

TGFBR2

TP53

VEGFA

VEGFB

VEGFC

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


胰腺癌通路图


图片来源于:https://www.kegg.jp/kegg-bin/show_pathway?map05212


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.