货号:WC-MRNA0125-M
产品介绍:
polycomb和trithorax复合物通过组蛋白修饰维持对细胞身份重要的细胞类型特异性基因表达模式的表观遗传控制。polycomb复合物引起转录抑制,而trithorax复合物逆转该效应以维持活跃的转录状态。Polycomb和trithorax复合物活性控制诱导和胚胎多能干细胞的适当分化,如通过该阵列内容中反映的鉴定的靶基因的表达变化所证实的。polycomb和trithorax复合物活性的失调通过引起细胞身份和分化基因的不适当表达来促进肿瘤发生,使得靶基因表达的研究对于癌症研究是重要的。
WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Polycomb & Trithorax Target Genes PCR Array plate
种 属:
MOUSE 货 号:
WC-MRNA0125-M
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
MOUSE
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
Atf3
Cdkn1a
Dkk1
Foxa2
Hand1
Il6ra
Mgll
Pmp22
Rbbp7
SUZ12
Tnfrsf19
Wnt5a
B
Bmi1
Chst11
Dkk2
G0s2
Hes1
Irs4
MT1G
PRC1
Sall1
Tacstd2
Trim10
WT1
C
Bmp2
Ctsa
Efnb1
Gas6
Hey1
Irx3
Myo5b
Prkch
Satb1
Tbp
Trim15
Pdgfra
D
Cadm1
Cxcl16
Epha4
Gata2
Hoxa10
Jun
Nid2
Prkg2
Serpinb2
Tcf7
Trpm3
Rassf1
E
Cbx8
Cxcr7
Ephb3
Gata3
Hoxa5
Kcna1
Nptx1
Ptpra
Slc30a4
Thbd
Tshz1
Sox17
F
Ccnd2
Cyp1b1
Esx1
Gata4
Hs3st1
Klf4
Otx2
Rarb
Slc34a2
Thpo
Ucp1
Tmem66
G
Cdc42ep1
Dgat2
EZH2
Gata6
Hs6st2
Lox
Pcdh19
Rasd1
Smoc2
Timp3
Usp3
Vsnl1
H
Cdh11
Dhh
Fam65a
Gmnn
Igfbp1
Meis2
ACTB
GAPDH
HPRT1
18s
NTC
NTC
基因分类(Mouse)
相关基因
细胞机制
细胞分化
Bmp2,Cadm1,Ccnd2,Chst11,Dhh,Dkk1,Efnb1,Epha4,Ephb3,Foxa2,Gata2,Gata6,Hand1,Hes1,Il6ra,
Irx3,Jun,Klf4,Otx2,Pdgfra,Pmp22,Rarb,Sall1,Sox17,Thpo,Trim10,Trim15,Ucp1,Wnt5a.
信号转导
Ackr3,Bmp2,Cdc42ep1,Cdkn1a,Chst11,Cxcl16,Dkk1,Dkk2,Epha4,Ephb3,Gas6,Hes1,Hey1,Igfbp1,
Il6ra,Irs4,Jun,Otx2,Pdgfra,Prkch,Prkg2,Ptpra,Rarb,Rasd1,Rassf1,Smoc2,Sox17,Tacstd2,Tcf7,Tnfrsf19,
Wnt5a.
细胞周期
Bmp2,Ccnd2,Cdkn1a,Dhh,Esx1,G0s2,Gmnn,Jun,Rassf1.
细胞凋亡
Cadm1 ,Cdkn1a,Chst11,Gata6,Il6ra,Jun,Rarb,Serpinb2,Tnfrsf19.
细胞外基质(ECM)组织
Ctsa,Lox,Pdgfra,Timp3
染色质重塑因子
Bmi1,Cbx8,Rbbp7.
其他细胞机制
Cdh11,Cyp1b1,Dgat2,Fam65a,Hs3st1,Hs6st2,Mgll,Myo5b,Nid2,Nptx1,Pcdh19,Thbd,Usp3,Vsnl1.
细胞功能
转录因子
Atf3,Esx1,Foxa2,Gata2,Gata3,Gata4,Gata6,Hand1,Hey1,Hoxa10,Hoxa5,Irx3,Jun,Klf4,Meis2,Otx2,Rarb,Sall1,
Satb1,Trim15,Tshz1.
转运因子
Kcna1,Slc30a4,Slc34a2,Trpm3,Ucp1.
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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