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多克隆三孢菌靶基因PCR阵列-大鼠
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多克隆三孢菌靶基因PCR阵列-大鼠

货号:WC-MRNA0125-R

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商品描述

货号:WC-MRNA0125-R


产品介绍:

polycomb和trithorax复合物通过组蛋白修饰维持对细胞身份重要的细胞类型特异性基因表达模式的表观遗传控制。polycomb复合物引起转录抑制,而trithorax复合物逆转该效应以维持活跃的转录状态。Polycomb和trithorax复合物活性控制诱导和胚胎多能干细胞的适当分化,如通过该阵列内容中反映的鉴定的靶基因的表达变化所证实的。polycomb和trithorax复合物活性的失调通过引起细胞身份和分化基因的不适当表达来促进肿瘤发生,使得靶基因表达的研究对于癌症研究是重要的。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Polycomb & Trithorax Target Genes PCR Array plate

种    属:

RAT

货    号:

WC-MRNA0125-R

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

RAT

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Atf3

Cdh11

Cyp1b1

Ephb3

Gata6

Il6r

MT1G

Pmp22

Rbbp7

Sox17

Tmem66

Wnt5a

B

Bhlhe40

Cdkn1a

Dgat2

EZH2

Gmnn

Irx3

Myo5b

PRC1

Rybp

SUZ12

Tnfrsf19

WT1

C

Bmi1

Cdkn2c

Dhh

Foxa2

Gnas

Jun

Nfix

Prkch

Sall1

Tacstd2

Trim10

Plaur

D

Bmp2

Chst11

Dkk1

G0s2

Hand1

Kcna1

Nid2

Prkg2

Satb1

Tbp

Trim15

Rassf1

E

Cadm1

Cntfr

Efna1

Gas6

Hes1

Klf4

Nptx1

Ptpra

Serpinb2

Tcf7

Trpm3

Smoc2

F

Cbx8

Ctsa

Efnb1

Gata2

Hey1

Lox

Otx2

Rarb

Slc30a4

Thbd

Ucp1

Timp3

G

Ccnd2

Cxcl16

Egfr

Gata3

Hs3st1

Meis2

Pdgfra

Rasd1

Slc34a2

Thpo

Usp3

Vsnl1

H

Cdc42ep1

Cxcr7

Epha4

Gata4

Igfbp1

Mgll

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类(Rat

相关基因

细胞机制

 

细胞分化

Bmp2,Cadm1,Ccnd2,Chst11,Dhh,Dkk1,Efna1,Efnb1,Epha4,Ephb3,Flt1,Foxa2,Gata2,Gata6,Gnas,Hand1,Hes1,Il6r,Irx3,Jun,Klf4,Otx2,Pdgfra,Pmp22,Rarb,Sall1,Sox17,Thpo,Ucp1,Wnt5a.

信号转导

Cxcr7,Bmp2,Cdc42ep1,Cdkn1a,Chst11,Cntfr,Cxcl16,Dkk1,Egfr,Epha4,Ephb3,Flt1,Gas6,Gnas,Hes1,Hey1,Igfbp1,Il6r,Jun,Otx2,Pdgfra,Plaur,Prkch,Prkg2,Ptpra,Rarb,Rasd1,Rassf1,Smoc2,Sox17,Tacstd2,Tcf7,Wnt5a.

细胞周期

Bmp2,Ccnd2,Cdkn1a ,Cdkn2c ,Dhh,G0s2,Gmnn,Jun,Rassf1

细胞凋亡

Cadm1 ,Cdkn1a,Chst11,Gata6,Il6r,Jun,Rarb,Rybp,Serpinb2

细胞外基质(ECM)组织

Lox,Pdgfra,Timp3.

染色质重塑因子

Bmi1 ,Cbx8,Rbbp7.

其他细胞机制

Cdh11,Ctsa,Cyp1b1,Dgat2,Hs3st1,Mgll,Myo5b,Nfix,Nid2,Nptx1,Tmem66,Thbd,Usp3,Vsnl1.

细胞功能

转录因子

Atf3,Bhlhe40 ,Foxa2,Gata2,Gata3,Gata4,Gata6,Hand1,Hey1,Irx3,Jun,Klf4,Meis2,Otx2,Rarb,Sall1,Satb1.

转运因子

Kcna1,Slc30a4,Slc34a2,Ucp1.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.