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前列腺癌PCR阵列-人
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前列腺癌PCR阵列-人

货号:WC-MRNA0126-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0126-H


产品介绍:

      前列腺癌是美国最致命的癌症之一,是男性生殖腺的肿瘤,主要在50岁以后出现。前列腺癌的分子原因尚不清楚,但通常与雄激素信号传导失调和大分子(如脂肪酸)的异常代谢有关。事实上,雄激素消融治疗导致原发性和转移性雄激素依赖性前列腺癌的消退。雄激素受体表达似乎促进了前列腺癌细胞的存活,但是到目前为止,抑制雄激素受体在临床上的效果不如预期。多不饱和脂肪酸导致前列腺肿瘤进展和死亡率增加,而富含ω-3脂肪酸的饮食似乎有益于前列腺癌患者。针对这些途径的研究可能会深入了解前列腺癌发生背后的分子机制。该阵列代表参与雄激素受体,PI3激酶/AKT和PTEN信号传导以及细胞周期和凋亡途径的基因。

      WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Prostate Cancer PCR Array plate

种    属:

HUMAN

货    号:

WC-MRNA0126-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

ACACA

AKT1

ANXA1

ANXA2

APC

AR

ARNTL

BCL2

CAMKK1

CAMSAP1

CASP3

CAV1

B

CAV2

CCL5

CCNA1

CCND1

CCND2

CD5L

CDH1

CDKN2A

CLN3

CREB1

DAXX

DDX11

C

DKK3

DLC1

ECT2

EDNRB

EGFR

EGR3

ENO2

ERG

ETV1

FASN

FOXO1

GCA

D

GNRH1

GPX3

GSTP1

HAL

HMGCR

IGF1

IGFBP5

IL6

KLHL13

KLK3

LGALS4

LOXL1

E

MAPK1

MAX

MGMT

MKI67

MSX1

MTO1

NDRG3

NFKB1

NKX3-1

NRIP1

PDLIM4

PDPK1

F

PES1

PPP2R1B

PRKAB1

PTEN

PTGS1

PTGS2

RARB

RASSF1

RBM39

SCAF11

SEPT7

SFRP1

G

SHBG

SLC5A8

SOCS3

SOX4

SREBF1

STK11

SUPT7L

TBP

TFPI2

TGFB1I1

TIMP2

TIMP3

H

TMPRSS2

TNFRSF10D

TP53

USP5

VEGFA

ZNF185

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


基因分(Human)

相关基因

差异甲基化启动子

APC,AR,CAV1,CCNA1,CDH1,CDKN2A ,DKK3,DLC1,EDNRB,GPX3,GSTP1,MGMT,MSX1,PDLIM4 ,PTGS2 ,RARB,RASSF1,SFRP1,SLC5A8,TIMP2,TNFRSF10D,ZNF185.

在前列腺癌中上调

ARNTL,CAMSAP1,DDX11,ECT2,ETV1,HAL,IGFBP5,KLK3,MTO1,PDPK1,RBM39,SOCS3,SOX4,SUPT7L.

在前列腺癌中下调

CCND2,CLN3,GCA,IGF1,LGALS4,LOXL1,PPP2R1B,SFRP1,SLC5A8,TFPI2,USP5.

转移潜能

CREB1,KLHL13,MAX,NDRG3,PES1,SCAF11,SEPT7.

雄激素受体信号

AR,CAV1,CCND1,DAXX,EGFR,FOXO1,GNRH1,IGF1,IL6,NFKB1,NRIP1,PTEN,SHBG,TGFB1I1,TIMP2,TIMP3,VEGFA.

AKT和PI3激酶信号传导

AKT1,AR,BCL2,CCND1,CCND2,CDH1,CDKN2A ,EGFR,FOXO1,GNRH1,IGF1,IL6,MAPK1,NFKB1,PDPK1,PTEN,TIMP2,TIMP3,TNFRSF10D,TP53,VEGFA.

PTEN信号

AKT1,EGFR,GNRH1,IGF1,IL6,MAPK1,PDPK1,PTEN,TIMP2,TIMP3,TP53 ,VEGFA.

细胞凋亡

BCL2,CASP3,CDKN2A ,EGFR ,ETV1,GNRH1,IGF1,IL6,MAPK1,NFKB1,PTEN,TIMP2,TIMP3,TP53,VEGFA.

细胞周期

APC,BCL2,CASP3,CAV2,CCNA1,CCND1,CCND2,CDKN2A ,EGFR,IGF1,PPP2R1B,PTEN,PTGS1,PTGS2,TP53.

转录因子

AR,ARNTL,CDKN2A,CREB1,DAXX,EGR3,ERG,ETV1,FOXO1,MAX,MSX1,NFKB1,NKX3-1,NRIP1,RARB,RBM39,SOX4,SREBF1,SUPT7L,TP53

脂肪酸代谢

ACACA,CAMKK1,FASN,HMGCR,IGF1,PRKAB1,SREBF1,STK11

其他前列腺癌基因

MKI67,TMPRSS2.


前列腺癌通路图

图片来源于:https://www.kegg.jp/kegg-bin/show_pathway?map05215

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.