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原发性纤毛PCR阵列-人
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原发性纤毛PCR阵列-人

货号:WC-MRNA0127-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0127-H


         产品介绍:

在几乎所有哺乳动物细胞类型的表面上发现的单个初级纤毛是具有9+0微管形成的非运动感觉细胞器。关键纤毛蛋白的突变最近与多种疾病有关,例如多囊肾病(PKD)和Bardet-Biedl综合征(BBS),统称为纤毛病。病理突变发生在纤毛形态发生或通过鞭毛内运输(IFT)维持所必需的基因中,破坏了初级纤毛功能。这些发现为增加初级纤毛的科学兴趣和研究提供了必要的生物学意义。最近的研究表明,初级纤毛调节细胞周期,使其在癌发生中具有潜在作用。这些细胞器还与多种信号通路协调,例如刺猬,WNT和mTOR,尽管广泛的研究尚未解释它们与许多疾病表型的联系。该阵列包含对纤毛功能中心的信号传导途径重要的基因,以及对纤毛形态发生和维持重要的基因。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


          产品内容

品    名:

Primary Cilia PCR Array plate

种    属:

HUMAN

货    号:

WC-MRNA0127-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

ADCY3

ADCY7

AHI1

AKT1

ALMS1

ARL13B

ARL6

AVPR2

AXIN2

BBS1

BBS2

BBS4

B

BBS7

BTRC

CC2D2A

CCND1

CDC42

CDK5RAP2

CDKN1A

CEP290

CEP41

DVL1

DYNC2LI1

FAT4

C

FJX1

FOS

FUZ

FZD1

GLI1

GLI2

GLI3

GLIS2

GSK3B

HNF1B

HTR6

IFT172

D

IFT20

IFT74

IFT80

IFT88

IGF1

IHH

INS

INTU

INVS

IQCB1

ITGB1

KIF3A

E

KIF3B

KRAS

LRP2

MAP2K1

MAP4

MAPK1

MKKS

MKS1

MOS

MTOR

NEK1

NEK8

F

NPHP1

NPHP3

OFD1

PDGFRA

PIK3CA

PKD1

PKD2

PKHD1

PRKCA

PTCH1

PTPN5

RAB23

G

RHOA

ROCK2

RPGRIP1L

RPLP0

RPS6KB1

SHH

SMO

SSTR3

SUFU

TBP

TMEM67

TP53

H

TSC1

TSC2

TTC8

VANGL2

WNT9B

WWTR1

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


基因分类(Human)

相关基因

在非活动性纤毛疾病中发生突变

AHI1,ALMS1,ARL13B,ARL6,BBS1,BBS2,BBS4,BBS7,CC2D2A,GLIS2,HNF1B,INVS,IQCB1,MKKS,MKS1,NEK8,NPHP1,NPHP3,PKD1,PKD2,PKHD1,RPGRIP1L,TMEM67,TTC8.

鞭毛内运输(IFT)

DYNC2LI1,IFT172,IFT20,IFT74,IFT80,IFT88,KIF3A,KIF3B.

纤毛形态发生

ALMS1,ARL6,BBS1,BBS2,BBS4,BBS7,IFT172,IFT88,MKKS,OFD1,PKHD1,RPGRIP1L,VANGL2,WWTR1.

信号转导Hedgehog 信号

BTRC,FUZ,GLI1,GLI2,GLI3,GSK3B,IHH,INTU,LRP2,PTCH1,RAB23,SHH,SMO,SUFU.

cAMP 信号

ADCY3,ADCY7,AVPR2,HTR6,PKD2,SSTR3.

mTOR 信号

AKT1,CDC42,GSK3B,IGF1,INS,MAPK1,MTOR,PIK3CA ,PRKCA,RHOA,TP53,TSC1,TSC2.

平面细胞极化

DVL1,FAT4,FJX1,FUZ,FZD1,INTU,RHOA,ROCK2,VANGL2,WNT9B.

WNT 信号

AXIN2,INVS.

PDGFRA/整合素信号传导

ITGB1,PDGFRA,KRAS,MAP2K1,MAPK1,MOS,PRKCA,PTPN5.

细胞周期

AKT1,BBS4,CCND1,CDK5RAP2,CDKN1A,IGF1,INS,MAP2K1,PKD1,PKD2,TP53.


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.