货号:WC-MRNA0127-H
产品介绍:
在几乎所有哺乳动物细胞类型的表面上发现的单个初级纤毛是具有9+0微管形成的非运动感觉细胞器。关键纤毛蛋白的突变最近与多种疾病有关,例如多囊肾病(PKD)和Bardet-Biedl综合征(BBS),统称为纤毛病。病理突变发生在纤毛形态发生或通过鞭毛内运输(IFT)维持所必需的基因中,破坏了初级纤毛功能。这些发现为增加初级纤毛的科学兴趣和研究提供了必要的生物学意义。最近的研究表明,初级纤毛调节细胞周期,使其在癌发生中具有潜在作用。这些细胞器还与多种信号通路协调,例如刺猬,WNT和mTOR,尽管广泛的研究尚未解释它们与许多疾病表型的联系。该阵列包含对纤毛功能中心的信号传导途径重要的基因,以及对纤毛形态发生和维持重要的基因。
WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Primary Cilia PCR Array plate
种 属:
HUMAN 货 号:
WC-MRNA0127-H
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
human
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
ADCY3
ADCY7
AHI1
AKT1
ALMS1
ARL13B
ARL6
AVPR2
AXIN2
BBS1
BBS2
BBS4
B
BBS7
BTRC
CC2D2A
CCND1
CDC42
CDK5RAP2
CDKN1A
CEP290
CEP41
DVL1
DYNC2LI1
FAT4
C
FJX1
FOS
FUZ
FZD1
GLI1
GLI2
GLI3
GLIS2
GSK3B
HNF1B
HTR6
IFT172
D
IFT20
IFT74
IFT80
IFT88
IGF1
IHH
INS
INTU
INVS
IQCB1
ITGB1
KIF3A
E
KIF3B
KRAS
LRP2
MAP2K1
MAP4
MAPK1
MKKS
MKS1
MOS
MTOR
NEK1
NEK8
F
NPHP1
NPHP3
OFD1
PDGFRA
PIK3CA
PKD1
PKD2
PKHD1
PRKCA
PTCH1
PTPN5
RAB23
G
RHOA
ROCK2
RPGRIP1L
RPLP0
RPS6KB1
SHH
SMO
SSTR3
SUFU
TBP
TMEM67
TP53
H
TSC1
TSC2
TTC8
VANGL2
WNT9B
WWTR1
ACTB
GAPDH
HPRT1
18S
NTC
NTC
基因分类(Human)
相关基因
在非活动性纤毛疾病中发生突变
AHI1,ALMS1,ARL13B,ARL6,BBS1,BBS2,BBS4,BBS7,CC2D2A,GLIS2,HNF1B,INVS,IQCB1,MKKS,MKS1,NEK8,NPHP1,NPHP3,PKD1,PKD2,PKHD1,RPGRIP1L,TMEM67,TTC8.
鞭毛内运输(IFT)
DYNC2LI1,IFT172,IFT20,IFT74,IFT80,IFT88,KIF3A,KIF3B.
纤毛形态发生
ALMS1,ARL6,BBS1,BBS2,BBS4,BBS7,IFT172,IFT88,MKKS,OFD1,PKHD1,RPGRIP1L,VANGL2,WWTR1.
信号转导Hedgehog 信号
BTRC,FUZ,GLI1,GLI2,GLI3,GSK3B,IHH,INTU,LRP2,PTCH1,RAB23,SHH,SMO,SUFU.
cAMP 信号
ADCY3,ADCY7,AVPR2,HTR6,PKD2,SSTR3.
mTOR 信号
AKT1,CDC42,GSK3B,IGF1,INS,MAPK1,MTOR,PIK3CA ,PRKCA,RHOA,TP53,TSC1,TSC2.
平面细胞极化
DVL1,FAT4,FJX1,FUZ,FZD1,INTU,RHOA,ROCK2,VANGL2,WNT9B.
WNT 信号
AXIN2,INVS.
PDGFRA/整合素信号传导
ITGB1,PDGFRA,KRAS,MAP2K1,MAPK1,MOS,PRKCA,PTPN5.
细胞周期
AKT1,BBS4,CCND1,CDK5RAP2,CDKN1A,IGF1,INS,MAP2K1,PKD1,PKD2,TP53.
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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