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STING信号PCR 阵列-人
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STING信号PCR 阵列-人

货号:WC-MRNA0221-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0221-H




产品介绍:

       干扰素基因刺激物 (STING) 是一种衔接蛋白,它在响应胞质核酸配体的 I 型干扰素激活中起重要作用,STING信号通路因其独特的激活机制以及对癌症、衰老和自身免疫的产生广泛影响,是一种重要的先天免疫信号级联反应,负责感知异常的胞质双链 DNA (dsDNA),这是癌症和病毒感染的标志。错误的 STING 激活会加剧许多自身免疫和炎症综合征。此外,在维持免疫稳态的同时,能够快速、有效且具体地对无数威胁做出反应。

       沃吉基因STING信号PCR阵列包含激活STING基因及其下游基因,调控下游通路基因,如自噬,JAK-STAT信号通路等关键的90个基因。

       WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

STING Signaling PCR Array plate

种    属:

Human

货    号:

WC-MRNA0221-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

Human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

AIM2

AKT1

AMFR

CCL5

CD274

CHUK

CIITA

CREB1

CREBBP

CXCL10

CXCL9

DDX41

B

DHX36

DHX9

DTX4

EP300

GSK3A

GSK3B

HDAC3

IFI16

IFNA1

IFNA2

IFNAR1

IFNAR2

C

IFNB1

IFNG

IFNGR1

IFNGR2

IKBKB

IKBKE

IKBKG

IL18

IL1A

IL1B

INSIG1

IRF1

D

IRF3

IRF7

IRF9

IRS1

IRS2

JAK1

JAK2

LRRFIP1

MB21D1

MRE11A

MYD88

NFKB1

E

NFKB2

NFKBIA

NFKBIB

NKIRAS1

NKIRAS2

NLRC3

NLRP4

POLR1A

POLR2A

PPM1A

PRKDC

PTPN22

F

RELA

RIPK1

RIPK3

RNF5

RPS27A

SOCS1

SOCS2

SOCS3

STAT1

STAT2

STAT3

STAT6

G

TBK1

TLR3

TLR7

TLR9

TMEM173

TNF

TREX1

TRIM21

TRIM32

TRIM56

TYK2

UBA52

H

UBB

UBC

ULK1

XRCC5

XRCC6

ZBP1

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


基因分类(Human)

                                     相关基因

信号转导分子

TBK1,STING1.

转录因子

IRF3,STAT6,RELA.

信号通路调节分子

INSIG1,AMFR,TRIM21,TREX1,PPM1A,RNF5,ULk1,

干扰素

IFNA1;IFNA2;IFNAR1;IFNAR2;IFNB1;IFNG;IFI16;IFNGR1;IFNGR2;IRF1;IRF3;IRF7;IRF9.

胞浆感受器

ZBP1,IFI16,DDX41,CGAS.

JAK-STAT signaling

AKT1;CXCL9;JAK1;JAK2;STAT1;STAT2;STAT3;SOCS1;SOCS2;SOCS3;TYK2.

TLR受体

TLR3,TLR7,TLR9.

sting激活下游基因

TRIM32,TRIM56,IKBKG,IKBKB,IKBKE,NFKBIA,NFKBIB,NKIRAS1,NKIRAS2.

炎性细胞因子

AIM2,CCL5,CIITA,CHUK,MYD88,NLRC3,NLRP4,TNF.

其他相关基因

CREB1,CD274,CREBBP,CXCL10,DHX36,DTX4,DHX9,EP300,GSK3A,GSK3B,HDAC3,IRS1,IRS2,LRRFIP1,MRE11,NKIRAS1,

NKIRAS2,PRKDC,PTPN22,RIPK1,RIPK3,RPS27A,POLR1A,POLR2A,XRCC5,XRCC6,UBA52,UBB,UBC.

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.