产品介绍：

      在发育过程中，一些关键的转录因子（NANOG、POU5F1和SOX2）驱动胚胎干细胞的维持。这些基因激活或抑制这个阵列所代表的其他关键转录因子，这些转录因子是发育和分化所必需的，形成一个转录调控网络。例如，胚胎干细胞维持需要POU5F1（OCT4），而滋养层发育需要CDX2。这两个基因相互压制，形成一个调控网络，要么延迟发育，要么让它按信号进行。了解这些调控环路对于破译发育转录网络和最终阐明分化机制至关重要。该阵列包括干细胞维持所需的关键转录因子，以及参与发育过程并受其调节的转录因子和辅助因子。

     WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀，然后加入每个孔里，上机检测，即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高，灵敏性强，操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程，可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

产品内容

品    名：	Stem Cell Transcription Factors PCR Array plate
种    属：	Human
货    号：	WC-MRNA0136-H
规    格：	96孔板
品    牌：	Wcgene® biotech
产    品：	96孔引物预置板，封板膜，说明书
储    存：	-20℃
有效期：	六个月
生产日期：	见外包装
使用限制：	本产品仅供科研使用，不应用于诊断、预防和治疗疾病。

 基因列表

HUMAM

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

CDX2

FOXA1

GATA6

HOXA7

HOXC12

HTR7

MSX2

OLIG2

PODXL

SMAD2

TBX5

ZFPM2

B

DACH1

FOXA2

GLI2

HOXA9

HOXC4

IRX4

MYC

PAX1

POU4F1

SOX2

TDGF1

ZIC1

C

DLX1

FOXD3

HAND1

HOXB1

HOXC5

ISL1

NANOG

PAX5

POU4F2

SOX6

TERT

NR2F2

D

DLX2

FOXP1

HNF4A

HOXB13

HOXC6

JUN

NEUROD1

PAX6

POU5F1

SOX9

TFCP2L1

PITX3

E

DNMT3B

FOXP2

HOXA10

HOXB3

HOXC9

KLF2

NFATC1

PAX9

PPARG

SP1

TLX3

SIX2

F

EGR3

FOXP3

HOXA11

HOXB5

HOXD1

KLF4

NKX2-2

PCNA

RB1

STAT1

VDR

TBP

G

ESR1

GATA1

HOXA2

HOXB8

HOXD10

LIN28B

NOTCH2

PITX2

RUNX1

STAT3

WRN

WT1

H

EZH2

GATA2

HOXA3

HOXC10

HOXD4

LMX1B

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC

基因分类（Human）	相关基因
体外干细胞维护	CDX2,NANOG,POU5F1,SOX2.
胎盘发育	CDX2,HAND1,PPARG,SP1,VDR.
诱导多能干细胞和胚胎干细胞	NANOG,POU5F1,SOX2,STAT3.
轴线/对称性/分割	CDX2,DLX1,DLX2,FOXA2,HOXA10,HOXA11,HOXA2,HOXA3,HOXA7,HOXA9,HOXB1,HOXB3,HOXB5,HOXB8,HOXC10, HOXC4,HOXC5,HOXC6,HOXC9,HOXD10,HOXD4,LMX1B,NEUROD1,NOTCH2,NR2F2,PAX1,PITX2,SMAD2,TBX5,TDGF1,ZIC1.
胚胎发育	CDX2,DLX1,DLX2,FOXA2,GATA6,GLI2,HAND1,HOXA10,HOXA11,HOXA2,HOXA3,HOXA7,HOXA9,HOXB1,HOXB3, HOXB5,HOXB8,HOXC10,HOXC4,HOXC5,HOXC6,HOXC9,HOXD1,HOXD10,HOXD4,KLF4,LMX1B,MSX2,NANOG,NEUROD1,NOTCH2,PAX1,SIX2,SMAD2,SOX2,SP1,TBX5,TDGF1,ZFPM2,ZIC1.
外胚层、内胚层和中胚层的形成和分化	FOXA2,GATA6,HAND1,HOXA7,HOXB13,ISL1,KLF4,SMAD2,SOX9.
器官形态的形成	CDX2,DLX1,DLX2,GLI2,HAND1,HOXA11,HOXA2,HOXA3,HOXA7,HOXB1,HOXB13,HOXB3,HOXB5,HOXB8,HOXC4,HOXC9,HOXD10,HOXD4,ISL1,JUN,KLF4,MSX2,MYC,NEUROD1,NOTCH2,NR2F2,PAX1,PAX5,PAX6,PITX2,PITX3, PPARG,RUNX1,SIX2,SMAD2,SOX2,SOX9,SP1,STAT3,TBX5,TDGF1,VDR,WT1,ZFPM2,ZIC1.
血管生成	CDX2,HAND1,JUN,NR2F2,RUNX1,WT1.
神经生成	DLX1,DLX2,DNMT3B,FOXA1,FOXA2 ,FOXP3,GLI2,HOXA2,HOXC10,HOXD10,ISL1,LMX1B,NEUROD1,NKX22,NR2F2,OLIG2,PAX6,PITX3,POU4F1,POU4F2,PPARG,SOX2,STAT3,TLX3.
造血功能	RB1,RUNX1,SOX6,SP1,STAT1.
成骨作用	GLI2,HOXA2,SOX2,SP1.
其他干细胞转录因子	DACH1,EGR3,ESR1 ,EZH2,FOXP1,FOXP2,GATA1,HOXC12,HTR7,IRX4,KLF2,LIN28B,NFATC1,PAX9,PCNA,TERT,WRN

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号，来实现对起始模板进行定量及定性的分析，本实验采取荧光染料法，在 PCR 反应体系中，加入荧光染料，荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后，发射荧光信号，而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号，从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列，它以96孔板或者384孔为载体，将目的基因引物固定在孔里，可同时定量、定性检测多个基因，具有高灵敏性和高特异性，是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因，只需要将cDNA与qPCR MIX混匀，然后加入每个孔里，即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高，灵敏性强，操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程，可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。

流程图

操作步骤

1. 将样品提取RNA，并逆转成cDNA，样品要求如下（建议范围）：

RNA：	无明显降解，A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA：	严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围：	ACTB或GAPDH的CT值：细胞15左右；组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心，2000r离心20 秒，离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl，将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板，加完后用透明封板膜封板，2000r离心20 秒，上机检测。

表a. cDNA和mix混合液配方表

组成成分	96孔 （搭配96孔板,每孔9 μl）
Wcgene® mRNA qPCR mix （2×）	510 μl
cDNA sample	100 μl
无RNA酶ddH2O	290 μl
ROX Reference Dye（50×）	20 μl
总体积	920 μl

4. 反应体系设置10μl，程序设置如表b所示

表b. PCR反应条件（WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例）

循环		温度	时间
预变性	1	95℃	30 sec
变性	40	95℃	5 sec
退火延伸	40	60℃	30 sec
熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出，数据分析

芯片与适用的Real Time PCR仪（本品仅适用于订单所写机器型号）

Plate format	Instrument provider	qPCR instrument model
A (96 well)	Roche Applied Science	LC480
	Bio-rad	CFX96
B (96 well)	Applied Biosystems	7500， 7900HT， ViiA 7
C (96 well)	Applied Biosystems	7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System

参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.