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突触可塑性PCR阵列-人
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突触可塑性PCR阵列-人

货号:WC-MRNA0139-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0139-H



产品介绍:

      大脑通过短期记忆回忆即时事件。然而,它必须将这些事件巩固为长期记忆,以便以后回忆。记忆的巩固需要突触的可塑性,其特点是神经元突触的物理变化和基因表达的变化。突触可塑性研究已经发现了在神经元事件发生后立即改变表达的即时基因(IEGs)。IEGs介导了长期电位(LTP),这是一个增强突触连接和巩固记忆的过程。然而,由于并非所有的事件都成为长期记忆,相反的突触重塑反应,长期抑制(LTD),也在突触可塑性中起着核心作用。与LTD相关的基因表达变化产生了神经元突触的物理变化,使受体循环,增强或抑制了突触连接。这个阵列包括IEGs和其他对LTP和LTD重要的基因,以及关键的神经元受体基因和对突触重塑重要的基因。

      WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。



产品内容

品    名:

Synaptic Plasticity PCR Array plate

种    属:

HUMAN

货    号:

WC-MRNA0139-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


  基因列表

HUMAN

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

ADAM10

CDH2

EGR2

GNAI1

GRIN2B

GRM5

KIF17

NFKBIB

NTRK2

PPP1R14A

RELN

TNF

B

ADCY1

CEBPB

EGR3

GRASP1

GRIN2C

GRM7

KLF10

NGF

PCDH8

PPP2CA

RGS2

YWHAQ

C

ADCY8

CEBPD

EGR4

GRIA1

GRIN2D

GRM8

MAPK1

NGFR

PICK1

PPP3CA

RHEB

NFKB1

D

AKT1

CNR1

EPHB2

GRIA2

GRIP1

HOMER1

MEK1

NOS1

PIM1

PRKCA

SIRT1

NTF4

E

ARC

CREB1

ERK1

GRIA3

GRM1

IGF1

MEK2

NPTX2

PLAT

PRKCG

SRF

PPP1CC

F

BDNF

CREM

ERK2

GRIA4

GRM2

INHBA

MMP9

NR4A1

PLCG1

PRKG1

SYNPO

RELA

G

CAMK2A

DLG4

FOS

GRIN1

GRM3

JUN

NCAM1

NTF3

PPP1CA

RAB3A

TBP

TIMP1

H

CAMK2G

EGR1

GABRA5

GRIN2A

GRM4

JUNB

ACTB

GAPDH

HPRT1

18s

NTC

NTC


基因分类Human

相关基因

即时早期反应基因

ARC,BDNF,CEBPB,CEBPD,CREB1,CREM,EGR1,EGR2,EGR3,EGR4,FOS,HOMER1,JUN,JUNB,KLF10,MMP9,NFKB1,NFKBIB NGF,NPTX2,NR4A1,NTF3,PCDH8,PIM1,PLAT,RELA,RGS2,RHEB,SRF,TNF.

突触可塑性的晚期反应

INHBA,SYNPO.

长期潜意识(LTP)

ADCY1,ADCY8,BDNF,CAMK2A,CAMK2G,CDH2 ,CNR1,GABRA5,GNAI1,GRIA1,GRIA2,GRIN1,GRIN2A,GRIN2B,GRIN2C,GRIN2D,MAPK1,MMP9,NTF4,NTRK2,PLCG1,PPP1CA,PPP1CC,PPP3CA,PRKCA,PRKCG,RAB3A,YWHAQ 

长期抑郁症 (LTD)

GNAI1,GRIA1,GRIA2,GRIA3,GRIA4,GRIP1,GRM1,GRM2,IGF1,MAPK1 ,NGFR,NOS1,PICK1,PLAT ,PPP1CA,PPP1CC,

PPP1R14A,PPP2CA,PPP3CA,PRKCA,PRKG1.

细胞粘附分子

ADAM10,CDH2 ,GRIN2A,GRIN2B,NCAM1,PCDH8,PPP2CA,RELN,TNF.

细胞粘附分子

ADAM10,MMP9,PLAT ,RELN,TIMP1.

CREB辅助因子

AKT1,CAMK2G,GRIN1,GRIN2A,GRIN2B,GRIN2C,GRIN2D,MAPK1,PPP1CA,PPP1CC.

神经元受体

EPHB2,GABRA5,GRIA1,GRIA2,GRIA3,GRIA4,GRIN1,GRIN2A,GRIN2B,GRIN2C,GRIN2D,GRM1,GRM2,GRM3,GRM4,

GRM5,GRM7,GRM8,NTRK2.

突触后密度(PSD)

ADAM10,ARC,DLG4 ,GRIA1,GRIA3,GRIA4,GRIN1,GRIN2A,GRIN2B,GRIN2C,GRM1,GRM3,HOMER1,PICK1,SYNPO

其他突触可塑性基因

KIF17,SIRT1.



检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.