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转录因子PCR阵列-人
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转录因子PCR阵列-人

货号:WC-MRNA0153-H

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商品描述

货号:WC-MRNA0153-H




产品介绍:

沃吉基因转录因子PCR阵列包括了细胞因子和趋化因子信号下游的转录因子和生长因子,如BMP、EGF、EPO、IGF、胰岛素、PDGF、TGFß、TPO和VEGF。信号通过雄激素,B细胞、G蛋白偶联、T细胞和Toll样受体激活此阵列上代表的转录因子。信号中的靶转录因子转导途径,如JAK/STAT、JNK和其他MAP激酶、NFkB、Notch和WNT也包含在该阵列中。

WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Transcription Factors PCR Array plate

种    属:

HUMAN

货    号:

WC-MRNA0153-H

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

human

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

AR

CEBPB

E2F3

FOS

GTF2B

HNF4A

KLF1

NFAT5

PAX6

SMAD1

STAT4

TP53

B

ARNT

CEBPG

E2F6

FOXA2

GTF2F1

HOXA5

MAX

NFATC1

POU2AF1

SMAD4

STAT5A

YY1

C

ATF1

CREB1

EGR1

FOXG1

HAND1

HSF1

MEF2A

NFATC2

PPARA

SMAD9

STAT5B

MYOD1

D

ATF2

CREBBP

ELF1

FOXO1

HAND2

ID1

MEF2C

NFATC3

PPARG

SP1

STAT6

NR3C1

E

ATF3

CTNNB1

ELK1

FOXP1

HDAC1

IRF1

MYB

NFATC4

RB1

SP3

TBP

RELB

F

ATF4

DR1

ESR1

GATA1

HEY1

JUN

MYC

NFKB1

REL

STAT1

TCF7L2

STAT3

G

CDX2

E2F1

ETS1

GATA2

HIF1A

JUNB

MYF5

NFYB

RELA

STAT2

TFAP2A

TGIF1

H

CEBPA

E2F2

ETS2

GATA3

HNF1A

JUND

ACTB

GAPDH

HPRT1

18S

NTC

NTC


基因分类(Human)

相关基因

雄激素受体信号

AR,CTNNB1,RB1

胰岛素信号

ELK1,FOS,FOXO1,JUN

G蛋白偶联受体信号

CREB1,ELK1,FOS,JUN,NFATC1

生长因子信号传导

ELK1,FOS,JUN,STAT1,STAT3,STAT5A

IGF-1 信号

ELK1,FOS,JUN

PDGF信号

ELK1,FOS,JUN,STAT1,STAT3,STAT5A

VEGF信号传导

ARNT,HIF1A,NFAT5,NFATC1,NFATC2,NFATC3,NFATC4

GFβ / BMP 信号

CREBBP,ID1,MYC,SMAD1,SMAD4,SMAD9,SP1

JAK / STAT 信号

CREBBP,MYC,STAT1,STAT2,STAT3,STAT4,STAT5A,STAT5B,STAT6

Notch 信号

CREBBP,HDAC1

WNT 信号

CREBBP,CTNNB1,HNF4A,JUN,MYC,NFAT5,NFATC1,NFATC2,NFATC3,NFATC4,SMAD4,TCF7L2,TP53

NFκB 信号

NFKB1,NR3C1,REL,RELA,RELB,STAT1

Toll样受体(TLR)信号

ELK1,FOS,IRF1,JUN,NFKB1,PPARA,RELA,STAT1

T细胞和B细胞受体信号

FOS,JUN,NFAT5,NFATC1,NFATC2,NFATC3,NFATC4,NFKB1.

细胞因子和趋化因子信号

CEBPA,RELA,STAT3,STAT4,STAT5A,STAT5B

EPO 信号

ELK1,FOS,JUN,STAT5A

TPO 信号

FOS,JUN,STAT1,STAT3,STAT5A

 ERK1 / ERK2 信号

 ELK1,MYC,STAT3.

JNK / p38 信号

ATF2,CREB1,ELK1,JUN,MAX,MEF2A,MYC,STAT1

其他MAP激酶信号

ATF4,CEBPA,FOS,JUN,JUND,MEF2C,NFATC2,NFATC4,NFKB1,SP1,STAT1,TP53

其他转录因子

ATF1,ATF3,CEBPB,CEBPG,DR1,E2F1,E2F6,EGR1,ESR1,ETS1,ETS2,FOXA2,FOXG1,GATA1,GATA2,GATA3,GTF2B,GTF2F1,HAND1,HAND2,HNF1A,HOXA5,HSF1,JUNB,MYB,MYF5,MYOD1,NFYB,PAX6,POU2AF1,PPARG,SP3,TBP,TFAP2A,TGIF1,YY1


检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.