图2.(A)qRT-PCR显示,在Bel-7404和SK-Hep1细胞中,miR-125a-5p在用模拟物转染后被上调,而在抑制剂转染后被下调。(B和C)使用CCK8和集落形成测定法评估转染的Bel-7404和SK-Hep1细胞的细胞增殖能力。(D)在Bel-7404和SK-Hep1细胞中转染后,使用WB分析p53,Bax,Bcl-2和活化的caspase-3的表达。(E)转染Bel-7404和SK-Hep1细胞后,检测到caspase底物的免疫荧光染色。
3.3 PTPN1和MAP3K11是HCC中miR-125a-5p的直接靶标
使用三个靶点预测数据库预测miR-125a-5p的靶标,确定了131个共同要素(图3A)。结果表明,``JUN激酶活性的激活''是miR-125a-5p的生物学功能,而PTPN1,MAP3K9,MAP3K10和MAP3K11是miRNA的潜在靶标(图3B和3C)。在本研究的其余部分中,重点放在PTPN1和MAP3K11上。
图3.(A)使用三个靶点预测数据库预测miR-125a-5p的靶标;确定了131个共同要素。(B和C)在Cytoscape中用ClueGO和CluePedia分析了这131个靶基因。(D和F)miR-125a-5p及其在PTPN1和MAP3K11的3'-UTR中的假定结合序列。(E和G)miR-125a-5p的过表达被抑制,而敲低则增加了野生型(WT)的荧光素酶活性,但没有突变(MT),PTPN1或MAP3K11 3'-UTR。(H)通过Western印迹评估转染的Bel-7404和SK-Hep1细胞中PTPN1和MAP3K11蛋白的表达。
3.4 PTPN1和MAP3K11上调与肝癌中miR-125a-5p表达负相关
“ JUN激酶活性的激活”与数据库预测的131个常见元件相关的生物学功能之一,这意味着JNK MAPK信号通路可能对miR-125a-5p的生物学功能至关重要。
图4.(A和B)在Starbase的TCGA中PTPN1和MAP3K11被上调。(C和D)PTEP1和MAP3K11