文章信息：

A pathway-focused RT-qPCR array study on immune relevant genes in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) harboring cecropin P1 transgene

Yueh-Chiang Han，Thomas T.Chen

Fish and Shellfish Immunology（IF=3）

DOI: https://doi.org/10.1016/j.fsi.2019.03.027

研究背景：

研究抗菌肽P1转基因鱼对微生物病原体感染的抗性。

方法

对实验室已有的不同家族的抗菌肽P1转基因虹鳟鱼取肝、肾、脾等样本共36个，进行qPCR检测和基因序列分析。

结果

1.     转基因脾脏免疫相关通路差异表达基因的分析

表1.通过RT-qPCR芯片测定转基因鱼（F231，F509和F695）脾脏中的差异表达基因（DEG）情况

图1 三种转基因鱼（F231, F509, F695）中在趋化因子/细胞因子JAK-STAT信号通路（A）、Toll样受体信号通路（B）、补体和凝血的通路（C）、抗原加工和呈递（D）、溶酶体/吞噬作用途径（E）、白细胞跨内皮迁移途径（F）上调、下调表达的基因。

如图1A所示，在所有三个家族中，与导致趋化因子/细胞因子JAK-STAT信号通路的配体-受体结合相关的基因的表达持续上调；这些基因包括ccr9、cxcr3、cxcr4、cxcl11、cxcl12、il6st和il21r(图1A)。虽然stat1的STAT转录因子(STAT1和stat6)和靶基因(c4)的表达增加，但STAT1的另一个靶基因(irf7)显著降低。虽然ccr8的表达在F231鱼类家族中表现出抑制，但是在F509和F695鱼类家族中表现出增加的表达。在Tolllike受体信号通路中，三个不同TLR(TLR 2、tlr3和tlr7)、重要衔接子(myd88)、干扰素调节因子(irf3)及其靶基因(cxcl11)的表达在三个家族中都上调(图1B)。然而，tnfrsf5 (cd40)