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上皮间质转化(EMT)PCR 阵列-小鼠
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上皮间质转化(EMT)PCR 阵列-小鼠

货号:WC-MRNA0053-M

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商品描述

货号:WC-MRNA0053-M





产品介绍:

      上皮-间充质转化(EMT)是一个过程,在此过程中,细胞失去其上皮特征,并获得间充质特性,如运动性增加。在结直肠癌(CRC)中,EMT与侵袭或转移表型相关。在EMT过程中,肿瘤细胞经历紧密连接溶解、顶端-基底极性的破坏和细胞骨架结构的重组,使细胞形成侵袭性表型。在癌细胞中,EMT受到来自肿瘤微环境的细胞外刺激(包括生长因子和炎性细胞因子)以及肿瘤内物理应激(如缺氧)的异常调节。因此,EMT编程允许肿瘤细胞适应人类肿瘤微环境的不断变化,从而成功转移。

      WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


产品内容

品    名:

Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT) PCR Array plate

种    属:

Mouse

货    号:

WC-MRNA0053-M

规    格:

96孔板

品    牌:

Wcgene® biotech

产    品:

96孔引物预置板,封板膜,说明书

储    存:

-20℃

有效期:

六个月

生产日期:

见外包装

使用限制:

本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。


基因列表

mouse

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

12

A

Ahnak

Akt1

Bmp1

Bmp7

Cald1

Camk2n1

Cav2

Cdh1

Cdh2

Cdkn1a

Col1a2

Col3a1

B

Col5a2

Ctnnb1

Dsc2

Dsp

Egfr

Erbb3

Esr1

F11r

Fgfbp1

Fn1

Foxc2

Fzd7

C

Gng11

Gsc

Gsk3b

Gusb

Hsp90ab1

Igfbp4

Il1rn

Ilk

Itga5

Itgav

Itgb1

Jag1

D

Krt14

Krt19

Krt7

Mitf

Mmp2

Mmp3

Mmp9

Msn

Mst1r

Mtap1b

Nodal

Notch1

E

Nudt13

Ocln

Pdgfrb

Plek2

Pparg

Pppde2

Ptk2

Ptp4a1

Rac1

Rgs2

Runx1

Serpine1

F

Sip1

Smad2

Snai1

Snai2

Snai3

Sox10

Sparc

Spp1

Stat3

Steap1

Tbp

Tcf4

G

Tcf7l1

Tfpi2

Tgfb1

Tgfb2

Tgfb3

Timp1

Tmeff1

Tmem132a

Tspan13

Twist1

Vcan

Vim

H

Vps13a

Wnt11

Wnt5a

Wnt5b

Zeb1

Zeb2

Actb

Gapdh

Hprt

B2m

NTC

NTC


基因分类(Mouse)

相关基因

上皮向间充质转化过程中上调

Ahnak、Bmp1、Cald1、Camk2n1、Cdh2、Col1a2、Col3a1、Col5a2、Fn1、Foxc2、Gng11、Gsc、Igfbp4、Itga5、Itgav、Mmp2、Mmp3、Mmp9、Msn、Serpine1、Snai1、Snai2、Snai3、Sox10、Sparc、Steap1、Tcf4、Timp1、Tmeff1、Tmem132a、Twist1、Vcan、Vim、Vps13a、Wnt5a、Wnt5b。

上皮向间充质转化过程中下调

Cav2、Cdh1、Dsp、Fgfbp1、Il1rn、Krt19、Mitf、Mst1r、Nudt13、Ocln、Rgs2、Spp1、Tfpi2、

差异化与发展

细胞形态发生

Akt1、Bmp1、Bmp7、Col3a1、Col5a2、Ctnnb1、Dsp、Erbb3、F11r、Foxc2、Fzd7、Gsc、Jag1、Krt14、Mitf、Mst1r、Nodal、Notch1、Ptp4a1、Smad2、Snai1、Snai2、Sox10、Tgfb2、Tgfb3、Tmeff1、Twist1、Vcan、Wnt11、Wnt5a、Wnt5b。Ctnnb1、Foxc2、Jag1、Rac1、Smad2、Snai1、Sox10、Tgfb1、Tgfb2、Tgfb3、Twist1、Wnt11、Wnt5a。

细胞生长与增殖

Akt1、Bmp1、Bmp7、Cav2、Ctnnb1、Egfr、Erbb3、Fgfbp1、Foxc2、Igfbp4、Ilk、Jag1、Mst1r、Nodal、Pdgfrb、Tgfb1、Tgfb2、Tgfb3、Timp1、Vcan、Zeb1。

细胞迁移和运动

Cald1、Cav2、Egfr、Fn1、Itgb1、Jag1、Msn、Mst1r、Nodal、Pdgfrb、Rac1、Stat3、Tgfb1、Vim。

细胞骨架调节因子

Cav2、Krt7、Plek2、Rac1、Vim。

细胞外基质和细胞粘附分子

Bmp1、Bmp7、Cdh1、Cdh2、Col1a2、Col3a1、Col5a2、Ctnnb1、Dsc2、Egfr、Erbb3、F11r、Fn1、Foxc2、Ilk、Itga5、Itgav、Itgb1、Mmp2、Mmp3、Mmp9、Ptk2、Rac1、Serpine1、Spp1、Tgfb1、Tgfb1、Tgfb2、Timp1、Vcan。

雌激素受体信号

CAV2、Esr1、Krt19、Tgfb3

G蛋白偶联受体信号传导

AKT1、Fzd7、Gng11、Rac1、Rgs2

整合素介导的信号传导

COL3A1、Ilk、Itga5、Itgav、Itgb1、Ptk2

槽口信号

FoxC2、Jag1、Notch1。

受体酪氨酸激酶信号

EGFR、Erbb3、Pdgfrb、Rgs2、Sparc。

Snai3、Sox10、Stat3、Tcf4、Tcf7l1、Twist1、Zeb1

TGFβ/BMP信号

BMP1、Bmp7、Col3a1、Smad2、Tgfb1、Tgfb2、Tgfb3

WNT信号

CTNNB1、Fzd7、Gsk3b、Wnt11、Wnt5a、Wnt5b。

转录因子

Ctnnb1、Esr1、Foxc2、Gsc、Notch1、Smad2、Snai2

检测原理

实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。

产品介绍

PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。

WCGENE® PCR ARRAY Plate90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNAqPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。


流程图




操作步骤

1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围)

RNA

明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0

cDNA

严格按照所用试剂盒说明书操作

cDNA原液预实验内参范围:

ACTBGAPDHCT值:细胞15左右;组织18左右

*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA

2. 板子使用前离心,2000r离心20 ,离心结束后将封板膜小心撕掉。

3. 按照表a配制cDNAmix混合液920μl,将配好的混合液混匀后每个孔9μl加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 ,上机检测

a. cDNAmix混合液配方表

组成成分

96孔

(搭配96孔板,每孔9 μl

Wcgene® mRNA qPCR mix

510 μl

cDNA sample

100 μl

RNAddH2O

290 μl

ROX Reference Dye50×

 20 μl

总体积

920 μl

4. 反应体系设置10μl程序设置如表b所示

b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)

循环

温度

时间

预变性

1

95℃

30 sec

变性

40

95℃

 5 sec

退火延伸

40

60℃

30 sec

熔解曲线分析

 

5. 上机开始Real Time PCR反应

6. 结果导出,数据分析


芯片与适用的Real Time PCR(本品仅适用于订单所写机器型号)

Plate format

Instrument provider

qPCR instrument model

A (96 well)

Roche Applied Science

LC480

Bio-rad

 CFX96

B (96 well)

Applied Biosystems

7500, 7900HT, ViiA 7  

C (96 well)

Applied Biosystems

7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System



参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.

Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,

Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.