货号:WC-MRNA0053-M
产品介绍:
上皮-间充质转化(EMT)是一个过程,在此过程中,细胞失去其上皮特征,并获得间充质特性,如运动性增加。在结直肠癌(CRC)中,EMT与侵袭或转移表型相关。在EMT过程中,肿瘤细胞经历紧密连接溶解、顶端-基底极性的破坏和细胞骨架结构的重组,使细胞形成侵袭性表型。在癌细胞中,EMT受到来自肿瘤微环境的细胞外刺激(包括生长因子和炎性细胞因子)以及肿瘤内物理应激(如缺氧)的异常调节。因此,EMT编程允许肿瘤细胞适应人类肿瘤微环境的不断变化,从而成功转移。
WCGENE® PCR Array Plate操作简单。只需要将cDNA与qPCR mix混匀,然后加入每个孔里,上机检测,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
产品内容
品 名:
Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT) PCR Array plate
种 属:
Mouse
货 号:
WC-MRNA0053-M
规 格:
96孔板
品 牌:
Wcgene® biotech
产 品:
96孔引物预置板,封板膜,说明书
储 存:
-20℃
有效期:
六个月
生产日期:
见外包装
使用限制:
本产品仅供科研使用,不应用于诊断、预防和治疗疾病。
基因列表
mouse
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
Ahnak
Akt1
Bmp1
Bmp7
Cald1
Camk2n1
Cav2
Cdh1
Cdh2
Cdkn1a
Col1a2
Col3a1
B
Col5a2
Ctnnb1
Dsc2
Dsp
Egfr
Erbb3
Esr1
F11r
Fgfbp1
Fn1
Foxc2
Fzd7
C
Gng11
Gsc
Gsk3b
Gusb
Hsp90ab1
Igfbp4
Il1rn
Ilk
Itga5
Itgav
Itgb1
Jag1
D
Krt14
Krt19
Krt7
Mitf
Mmp2
Mmp3
Mmp9
Msn
Mst1r
Mtap1b
Nodal
Notch1
E
Nudt13
Ocln
Pdgfrb
Plek2
Pparg
Pppde2
Ptk2
Ptp4a1
Rac1
Rgs2
Runx1
Serpine1
F
Sip1
Smad2
Snai1
Snai2
Snai3
Sox10
Sparc
Spp1
Stat3
Steap1
Tbp
Tcf4
G
Tcf7l1
Tfpi2
Tgfb1
Tgfb2
Tgfb3
Timp1
Tmeff1
Tmem132a
Tspan13
Twist1
Vcan
Vim
H
Vps13a
Wnt11
Wnt5a
Wnt5b
Zeb1
Zeb2
Actb
Gapdh
Hprt
B2m
NTC
NTC
基因分类(Mouse)
相关基因
上皮向间充质转化过程中上调
Ahnak、Bmp1、Cald1、Camk2n1、Cdh2、Col1a2、Col3a1、Col5a2、Fn1、Foxc2、Gng11、Gsc、Igfbp4、Itga5、Itgav、Mmp2、Mmp3、Mmp9、Msn、Serpine1、Snai1、Snai2、Snai3、Sox10、Sparc、Steap1、Tcf4、Timp1、Tmeff1、Tmem132a、Twist1、Vcan、Vim、Vps13a、Wnt5a、Wnt5b。
上皮向间充质转化过程中下调
Cav2、Cdh1、Dsp、Fgfbp1、Il1rn、Krt19、Mitf、Mst1r、Nudt13、Ocln、Rgs2、Spp1、Tfpi2、
差异化与发展
细胞形态发生
Akt1、Bmp1、Bmp7、Col3a1、Col5a2、Ctnnb1、Dsp、Erbb3、F11r、Foxc2、Fzd7、Gsc、Jag1、Krt14、Mitf、Mst1r、Nodal、Notch1、Ptp4a1、Smad2、Snai1、Snai2、Sox10、Tgfb2、Tgfb3、Tmeff1、Twist1、Vcan、Wnt11、Wnt5a、Wnt5b。Ctnnb1、Foxc2、Jag1、Rac1、Smad2、Snai1、Sox10、Tgfb1、Tgfb2、Tgfb3、Twist1、Wnt11、Wnt5a。
细胞生长与增殖
Akt1、Bmp1、Bmp7、Cav2、Ctnnb1、Egfr、Erbb3、Fgfbp1、Foxc2、Igfbp4、Ilk、Jag1、Mst1r、Nodal、Pdgfrb、Tgfb1、Tgfb2、Tgfb3、Timp1、Vcan、Zeb1。
细胞迁移和运动
Cald1、Cav2、Egfr、Fn1、Itgb1、Jag1、Msn、Mst1r、Nodal、Pdgfrb、Rac1、Stat3、Tgfb1、Vim。
细胞骨架调节因子
Cav2、Krt7、Plek2、Rac1、Vim。
细胞外基质和细胞粘附分子
Bmp1、Bmp7、Cdh1、Cdh2、Col1a2、Col3a1、Col5a2、Ctnnb1、Dsc2、Egfr、Erbb3、F11r、Fn1、Foxc2、Ilk、Itga5、Itgav、Itgb1、Mmp2、Mmp3、Mmp9、Ptk2、Rac1、Serpine1、Spp1、Tgfb1、Tgfb1、Tgfb2、Timp1、Vcan。
雌激素受体信号
CAV2、Esr1、Krt19、Tgfb3
G蛋白偶联受体信号传导
AKT1、Fzd7、Gng11、Rac1、Rgs2
整合素介导的信号传导
COL3A1、Ilk、Itga5、Itgav、Itgb1、Ptk2
槽口信号
FoxC2、Jag1、Notch1。
受体酪氨酸激酶信号
EGFR、Erbb3、Pdgfrb、Rgs2、Sparc。
Snai3、Sox10、Stat3、Tcf4、Tcf7l1、Twist1、Zeb1
TGFβ/BMP信号
BMP1、Bmp7、Col3a1、Smad2、Tgfb1、Tgfb2、Tgfb3
WNT信号
CTNNB1、Fzd7、Gsk3b、Wnt11、Wnt5a、Wnt5b。
转录因子
Ctnnb1、Esr1、Foxc2、Gsc、Notch1、Smad2、Snai2
检测原理
实时定量荧光PCR即通过实时检测 PCR 每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析,本实验采取荧光染料法,在 PCR 反应体系中,加入荧光染料,荧光染料特异性地掺入 DNA 双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。
产品介绍
PCR Array也被称作基因功能分类芯片或PCR阵列,它以96孔板或者384孔为载体,将目的基因引物固定在孔里,可同时定量、定性检测多个基因,具有高灵敏性和高特异性,是分析信号通路或某生物学功能相关基因表达状态的首选工具。
WCGENE® PCR ARRAY Plate含90个目的基因和4个内参基因,只需要将cDNA与qPCR MIX混匀,然后加入每个孔里,即可通过分析qPCR结果找到样品中差异表达的基因。具有重复性高,灵敏性强,操作便捷等特点。为实验研究者节省了预实验、引物验证、文献选择基因等繁琐的过程,可以直接了解不同信号通路或疾病中关键基因的差异情况。
流程图
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操作步骤
1. 将样品提取RNA,并逆转成cDNA,样品要求如下(建议范围):
RNA:
无明显降解,A260/A280比值应为1.8-2.0
cDNA:
严格按照所用试剂盒说明书操作
cDNA原液预实验内参范围:
ACTB或GAPDH的CT值:细胞15左右;组织18左右
*推荐使用Wcgene® mRNA cDNA kit合成cDNA
2. 板子使用前离心,2000r离心20 秒,离心结束后将封板膜小心撕掉。
3. 按照表a配制cDNA和mix混合液920μl,将配好的混合液混匀后按每个孔9μl量加板,加完后用透明封板膜封板,2000r离心20 秒,上机检测。
表a. cDNA和mix混合液配方表
组成成分
96孔
(搭配96孔板,每孔9 μl)
Wcgene® mRNA qPCR mix (2×)
510 μl
cDNA sample
100 μl
无RNA酶ddH2O
290 μl
ROX Reference Dye(50×)
20 μl
总体积
920 μl
4. 反应体系设置10μl,程序设置如表b所示
表b. PCR反应条件(WCGENE ® mRNA qPCR mix试剂盒为例)
循环
温度
时间
预变性
1
95℃
30 sec
变性
40
95℃
5 sec
退火延伸
40
60℃
30 sec
熔解曲线分析
5. 上机开始Real Time PCR反应
6. 结果导出,数据分析
芯片与适用的Real Time PCR仪(本品仅适用于订单所写机器型号)
Plate format
Instrument provider
qPCR instrument model
A (96 well)
Roche Applied Science
LC480
Bio-rad
CFX96
B (96 well)
Applied Biosystems
7500, 7900HT, ViiA 7
C (96 well)
Applied Biosystems
7500 Fast System, 7900HT Fast System, StepOnePlus, ViiA 7 Fast System
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276.
Siqing Yue, Jie Yu, Yuan Kong, Haofeng Chen, Manfei Mao, Chenyang Ji, Shuai Shao, Jianqiang Zhu, Jinping Gu, Meirong Zhao,Metabolomic modulations of HepG2 cells exposed to bisphenol analogues,Environment International,Volume 129,2019,Pages 59-67,ISSN 0160-4120,
Zhao Y, Wang J, Xu C, et al. HEG1 indicates poor prognosis and promotes hepatocellular carcinoma invasion, metastasis, and EMT by activating Wnt/β-catenin signaling[J]. Clinical Science, 2019, 133(14): 1645-1662.
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